業績情報

• A simulation study on Raman cross sections of OH and OD stretches in isotopically pure and diluted liquid water
  Tetsuyuki Takayama; Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  The Journal of Chemical Physics, 巻：162, 号：24, 開始ページ：244502, 2025年06月, ［査読有り］
  The Raman scattering activity spectra of isotopically pure and diluted liquid water are theoretically calculated to examine the mole-fraction dependence of the OH- and OD-stretch cross sections. This mole-fraction dependence was once claimed to be anomalous and attributed to nuclear quantum correlations of protons and deuterons when it was discovered experimentally. The present study demonstrates that the experimental data of the mole-fraction dependence of the cross sections, as well as the Raman scattering activity spectra in the stretch region, are well reproduced by the theoretical calculations according to the quantum/classical mixed approach in which the nuclear quantum correlations are not taken into account. This suggests that the anomalous dependence does not serve as evidence of the nuclear quantum correlations. The present study provides a more plausible interpretation that the OH- and OD-stretch cross sections depend on the mole fraction because of the inter- and intra-molecular vibrational couplings.
  AIP Publishing, 英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1063/5.0276271
  DOI ID：10.1063/5.0276271, ISSN：0021-9606, eISSN：1089-7690
• A macroscopically homogeneous lipid phase exhibits leaflet-specific lipid diffusion in a glass-supported lipid bilayer
  Takuhiro Otosu; Miyuki Sakaguchi; Shoichi Yamaguchi
  Physical Chemistry Chemical Physics, 巻：27, 号：9, 開始ページ：4944, 終了ページ：4949, 2025年02月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  Leaflet-specific lipid diffusion analysis revealed that the strength of interleaflet coupling is sensitive to the lipid composition even in the region where macroscopically homogeneous phase is observed.
  Royal Society of Chemistry (RSC), 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1039/d5cp00203f
  DOI ID：10.1039/d5cp00203f, ISSN：1463-9076, eISSN：1463-9084
• A new rigid non-polarizable model for semi-heavy water: TIP4P/2005-SHW
  Tetsuyuki Takayama; Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  The Journal of Chemical Physics, 巻：161, 号：23, 2024年12月, ［査読有り］
  In molecular dynamics (MD) simulations of water, rigid non-polarizable models are still valuable and widely used because of their low computational cost and excellent performance. Most of such models have been for light water (H2O) for a long time, and a few have recently been reported for heavy water (D2O). The specific models of D2O are needed because of its notably slower dynamics and stronger hydrogen bond than H2O. To our knowledge, no models of semi-heavy water (HOD) were made, although HOD is the most abundant and, therefore, most important chemical species in isotopically diluted water (IDW) prepared by mixing equal amounts of H2O and D2O. For precise MD simulations of IDW, a specific model of HOD is definitely needed. Here, we report the development of a new rigid non-polarizable model of HOD, TIP4P/2005-SHW, on the basis of the most popular H2O model, TIP4P/2005, and its D2O counterpart, TIP4P/2005-HW. We show the details of the development and demonstrate the high reproducibility of TIP4P/2005-SHW in terms of the density, the temperature of maximum density, the viscosity, and the diffusion coefficient.
  AIP Publishing, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1063/5.0240271
  DOI ID：10.1063/5.0240271, ISSN：0021-9606, eISSN：1089-7690
• Diffusion of Multiple Species Resolved by Fluorescence Lifetime Recovery after Photobleaching (FLRAP)
  Ikumi Mori; Shun Terasaka; Shoichi Yamaguchi; Takuhiro Otosu
  Analytical Chemistry, 巻：96, 号：12, 開始ページ：4854, 終了ページ：4859, 2024年03月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］
  American Chemical Society (ACS), 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c05181
  DOI ID：10.1021/acs.analchem.3c05181, ISSN：0003-2700, eISSN：1520-6882
• Theoretical and experimental OD-stretch vibrational spectroscopy of heavy water
  Tetsuyuki Takayama; Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  The Journal of Chemical Physics, 巻：160, 号：10, 2024年03月, ［査読有り］
  In view of the current situation in which the OD-stretch vibrational spectra have been scarcely computed with non-polarizable rigid D2O models, we investigate the IR and Raman spectra of D2O by using a newly-reported model TIP4P/2005-HW. From the comparison between the calculations and experimental data, we find the excellent performance of TIP4P/2005-HW for vibrational spectroscopy of D2O in the same manner as TIP4P/2005 for H2O, although one may still conveniently employ an alternative method that regards OH as putative OD to calculate the OD-stretch spectra with similar quality from TIP4P/2005 trajectories. We also demonstrate that the appropriate setting for the spectral simulation of D2O under the time-averaging approximation reflects the slower dynamics (i.e., slower motion of translation and rotation due to the heavier mass and stronger hydrogen bond) of D2O than H2O. Moreover, we show from the theoretical calculations that the established interpretation of the OH-stretch spectra of H2O is finely applicable to the OD-stretch of D2O.
  AIP Publishing, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1063/5.0200623
  DOI ID：10.1063/5.0200623, ISSN：0021-9606, eISSN：1089-7690
• Peripheral adsorption of polylysine on one leaflet of a lipid bilayer reduces the lipid diffusion of both leaflets
  Kosei Shimizu; Miyuki Sakaguchi; Shoichi Yamaguchi; Takuhiro Otosu
  Physical Chemistry Chemical Physics, 巻：26, 号：11, 開始ページ：8873, 終了ページ：8878, 2024年02月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］
  Leaflet-specific lipid diffusion analysis revealed that polylysine adsorption on one leaflet of a lipid bilayer is sensed by the opposite leaflet.
  Royal Society of Chemistry (RSC), 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1039/d3cp04882a
  DOI ID：10.1039/d3cp04882a, ISSN：1463-9076, eISSN：1463-9084
• Appraisal of TIP4P-type models at water surface
  Shoichi Yamaguchi; Tetsuyuki Takayama; Takuhiro Otosu
  The Journal of Chemical Physics, 巻：159, 号：17, 2023年11月, ［査読有り］
  In view of the current situation in which non-polarizable rigid water models have been scarcely examined against surface-specific properties, we appraise TIP4P-type models at the liquid water surface on the basis of heterodyne-detected sum frequency generation (HD-SFG) spectroscopy. We find in the HD-SFG spectrum of the water surface that the peak frequency of the hydrogen-bonded OH band, the half width at half maximum of the hydrogen-bonded OH band, and the full width at half maximum of the free OH band are best reproduced by TIP4P, TIP4P/Ew, and TIP4P/Ice, respectively, whereas it is already well known that TIP4P/2005 best reproduces the surface tension. These TIP4P-type models perform better at the water surface in terms of the present appraisal items than some polarizable models in the literature.
  AIP Publishing, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1063/5.0171999
  DOI ID：10.1063/5.0171999, ISSN：0021-9606, eISSN：1089-7690
• Transferability of vibrational spectroscopic map from TIP4P to TIP4P-like water models
  Tetsuyuki Takayama; Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  The Journal of Chemical Physics, 巻：158, 号：13, 2023年04月, ［査読有り］
  We computed the IR, Raman, and sum frequency generation spectra of water in the OH-stretch region by employing the quantum/classical mixed approach that consists of a vibrational spectroscopic map and molecular dynamics (MD) simulation. We carried out the MD simulation with the TIP4P, TIP4P/2005, and TIP4P/Ice models and applied the map designed for TIP4P by Skinner et al. to each MD trajectory. Although the map is not tuned for TIP4P-like models, TIP4P/2005 and TIP4P/Ice provide the best reproduction of the experimental vibrational spectra of liquid water and crystalline ice, respectively. This result demonstrates the transferability of the map from TIP4P to TIP4P/2005 and TIP4P/Ice, meaning that one can choose an appropriate TIP4P-like model to calculate the vibrational spectra of an aqueous system without rebuilding the map.
  AIP Publishing, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1063/5.0146084
  DOI ID：10.1063/5.0146084, ISSN：0021-9606, eISSN：1089-7690
• Experimental and Theoretical Heterodyne-Detected Sum Frequency Generation Spectroscopy of Isotopically Pure and Diluted Water Surfaces　　　　　　　　　　　　　　　
  Shoichi Yamaguchi; Tetsuyuki Takayama; Yuki Goto; Takuhiro Otosu; Takuma Yagasaki
  The Journal of Physical Chemistry Letters, 2022年10月, ［査読有り］
  研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.2c02533
  DOI ID：10.1021/acs.jpclett.2c02533, ORCID：120487669
• Experimental and Theoretical Raman Spectroscopy of Isotopically Pure and Diluted Ice VI　　　　　　　　　　　　　　　
  Tetsuyuki Takayama; Kota Kishi; Takuhiro Otosu; Takuma Yagasaki; Shoichi Yamaguchi
  The Journal of Physical Chemistry C, 2022年10月, ［査読有り］
  研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.2c05133
  DOI ID：10.1021/acs.jpcc.2c05133, ORCID：120088265
• Raman spectroscopy of isotopically pure and diluted high‐ and low‐density amorphous ices
  Senri Ishihara; Tetsuyuki Takayama; Miyuki Sakaguchi; Takuhiro Otosu; Takuma Yagasaki; Yoshiharu Suzuki; Shoichi Yamaguchi
  Journal of Raman Spectroscopy, 2022年02月, ［査読有り］
  Wiley, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1002/jrs.6322
  DOI ID：10.1002/jrs.6322, ISSN：0377-0486, eISSN：1097-4555
• Progress in phase-sensitive sum frequency generation spectroscopy
  Shoichi Yamaguchi; Takuhiro Otosu
  Physical Chemistry Chemical Physics, 巻：23, 号：34, 開始ページ：18253, 終了ページ：18267, 2021年06月, ［査読有り］
  Representative methods of surface-selective phase-sensitive sum frequency generation spectroscopy are reviewed in terms of interferometer implementation for optical heterodyne detection.
  Royal Society of Chemistry (RSC), 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1039/d1cp01994e
  DOI ID：10.1039/d1cp01994e, ISSN：1463-9076, eISSN：1463-9084
• Leaflet-specific Lipid Diffusion Revealed by Fluorescence Lifetime Correlation Analyses　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  CHEMISTRY LETTERS, 巻：49, 号：12, 開始ページ：1473, 終了ページ：1480, 2020年12月, ［査読有り］, ［招待有り］, ［筆頭著者］
  英語
  DOI：https://doi.org/10.1246/cl.200539
  DOI ID：10.1246/cl.200539, ISSN：0366-7022, eISSN：1348-0715, Web of Science ID：WOS:000598377200011
• Effect of electrostatic interaction on the leaflet-specific diffusion in a supported lipid bilayer revealed by fluorescence lifetime correlation analysis　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS, 巻：22, 号：3, 開始ページ：1242, 終了ページ：1249, 2020年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1039/c9cp05833h
  DOI ID：10.1039/c9cp05833h, ISSN：1463-9076, eISSN：1463-9084, Web of Science ID：WOS:000509371400030
• Multifocus Fluorescence Correlation Spectroscopy with Spatially Separated Excitation Beams　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Kunihiko Ishii; Tahei Tahara
  BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN, 巻：92, 号：9, 開始ページ：1495, 終了ページ：1502, 2019年09月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1246/bcsj.20190109
  DOI ID：10.1246/bcsj.20190109, ISSN：0009-2673, eISSN：1348-0634, Web of Science ID：WOS:000482728000012
• Reduction of glass-surface charge density slows the lipid diffusion in the proximal leaflet of a supported lipid bilayer　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 巻：151, 号：2, 2019年07月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1063/1.5103221
  DOI ID：10.1063/1.5103221, ISSN：0021-9606, eISSN：1089-7690, Web of Science ID：WOS:000486055700034
• Perspective on sum frequency generation spectroscopy of ice surfaces and interfaces　　　　　　　　　　　　　　　
  Shoichi Yamaguchi; Yudai Suzuki; Yuki Nojima; Takuhiro Otosu
  CHEMICAL PHYSICS, 巻：522, 開始ページ：199, 終了ページ：210, 2019年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.chemphys.2019.03.005
  DOI ID：10.1016/j.chemphys.2019.03.005, ISSN：0301-0104, eISSN：1873-4421, Web of Science ID：WOS:000466713000027
• Quantifying the Diffusion of Lipids in the Proximal/Distal Leaflets of a Supported Lipid Bilayer by Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 巻：122, 号：45, 開始ページ：10315, 終了ページ：10319, 2018年11月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.8b08614
  DOI ID：10.1021/acs.jpcb.8b08614, ISSN：1520-6106, Web of Science ID：WOS:000451101100006
• Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy: Concepts and Applications　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  MOLECULES, 巻：23, 号：11, 2018年11月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語
  DOI：https://doi.org/10.3390/molecules23112972
  DOI ID：10.3390/molecules23112972, eISSN：1420-3049, Web of Science ID：WOS:000451641900244
• Total Internal Reflection Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 巻：122, 号：22, 開始ページ：5758, 終了ページ：5764, 2018年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.8b01176
  DOI ID：10.1021/acs.jpcb.8b01176, ISSN：1520-6106, SCOPUS ID：85048247541, Web of Science ID：WOS:000435019600004
• Local pH at the surface of hen egg white lysozyme　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Kaito Kobayashi; Shoichi Yamaguchi
  CHEMICAL PHYSICS LETTERS, 巻：693, 開始ページ：165, 終了ページ：169, 2018年02月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.cplett.2018.01.026
  DOI ID：10.1016/j.cplett.2018.01.026, ISSN：0009-2614, eISSN：1873-4448, SCOPUS ID：85040701289, Web of Science ID：WOS:000424631900026
• Communication: Development of standing evanescent-wave fluorescence correlation spectroscopy and its application to the lateral diffusion of lipids in a supported lipid bilayer　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 巻：147, 号：4, 開始ページ：041101, 2017年07月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1063/1.4985871
  DOI ID：10.1063/1.4985871, ISSN：0021-9606, eISSN：1089-7690, Web of Science ID：WOS:000406347200002
• Highly Heterogeneous Nature of the Native and Unfolded States of the B Domain of Protein A Revealed by Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Kunihiko Ishii; Hiroyuki Oikawa; Munehito Arai; Satoshi Takahashi; Tahei Tahara
  JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 巻：121, 号：22, 開始ページ：5463, 終了ページ：5473, 2017年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b00546
  DOI ID：10.1021/acs.jpcb.7b00546, ISSN：1520-6106, Web of Science ID：WOS:000403191700001
• Standing evanescent-wave fluorescence correlation spectroscopy for analyzing the translational diffusion in bio-membranes　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Shoichi Yamaguchi
  ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 巻：252, 2016年08月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語
  ISSN：0065-7727, Web of Science ID：WOS:000431460201108
• Microsecond protein dynamics observed at the single-molecule level　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Kunihiko Ishii; Tahei Tahara
  NATURE COMMUNICATIONS, 巻：6, 2015年07月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1038/ncomms8685
  DOI ID：10.1038/ncomms8685, ISSN：2041-1723, Web of Science ID：WOS:000358858100029
• Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy on the Folding Mechanism of B Domain of Protein A　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Kunihiko Ishii; Hiroyuki Oikawa; Munehito Arai; Satoshi Takahashi; Tahei Tahara
  BIOPHYSICAL JOURNAL, 巻：108, 号：2, 開始ページ：501A, 終了ページ：501A, 2015年01月, ［査読有り］
  英語
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.11.2747
  DOI ID：10.1016/j.bpj.2014.11.2747, ISSN：0006-3495, eISSN：1542-0086, Web of Science ID：WOS:000362849600141
• 1P055 二次元蛍光寿命相関分光法によるBdpA折りたたみ機構解明に向けた研究 : 2つのBdpA変異体による包括的解析(01C. 蛋白質 : 物性,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))　　　　　　　　　　　　　　　
  Otosu Takuhiro; Ishii Kunihiko; Oikawa Hiroyuki; Arai Munehito; Takahashi Satoshi; Tahara Tahei
  生物物理, 巻：54, 号：1, 開始ページ：S150, 2014年
  一般社団法人 日本生物物理学会, 英語
  DOI：https://doi.org/10.2142/biophys.54.S150_1
  DOI ID：10.2142/biophys.54.S150_1, CiNii Articles ID：110009932279
• Microsecond Conformational Dynamics of Cytochrome C Revealed by Two-Dimentional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Kunihiko Ishii; Tahei Tahara
  BIOPHYSICAL JOURNAL, 巻：106, 号：2, 開始ページ：459A, 終了ページ：459A, 2014年01月, ［査読有り］
  英語
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.11.2603
  DOI ID：10.1016/j.bpj.2013.11.2603, ISSN：0006-3495, eISSN：1542-0086, Web of Science ID：WOS:000337000402557
• Note: Simple calibration of the counting-rate dependence of the timing shift of single photon avalanche diodes by photon interval analysis　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Kunihiko Ishii; Tahei Tahara
  REVIEW OF SCIENTIFIC INSTRUMENTS, 巻：84, 号：3, 2013年03月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1063/1.4794769
  DOI ID：10.1063/1.4794769, ISSN：0034-6748, eISSN：1089-7623, Web of Science ID：WOS:000316966200057
• 3P052 二次元蛍光寿命相関分光法によるBdpA変性状態における構造ダイナミクスの解析(01C.蛋白質:物性,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))　　　　　　　　　　　　　　　
  Otosu Takuhiro; Ishii Kunihiko; Oikawa Hiroyuki; Arai Munehito; Takahashi Satoshi; Tahara Tahei
  生物物理, 巻：53, 号：1, 開始ページ：S220, 2013年
  一般社団法人 日本生物物理学会, 英語
  DOI：https://doi.org/10.2142/biophys.53.S220_4
  DOI ID：10.2142/biophys.53.S220_4, CiNii Articles ID：110009819856
• Multiple conformational state of human serum albumin around single tryptophan residue at various pH revealed by time-resolved fluorescence spectroscopy　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Etsuko Nishimoto; Shoji Yamashita
  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 巻：147, 号：2, 開始ページ：191, 終了ページ：200, 2010年02月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/jb/mvp175
  DOI ID：10.1093/jb/mvp175, ISSN：0021-924X, Web of Science ID：WOS:000274344400006
• Fluorescence Decay Characteristics of Indole Compounds Revealed by Time-Resolved Area-Normalized Emission Spectroscopy　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Etsuko Nishimoto; Shoji Yamashita
  JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, 巻：113, 号：12, 開始ページ：2847, 終了ページ：2853, 2009年03月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1021/jp8078937
  DOI ID：10.1021/jp8078937, ISSN：1089-5639, Web of Science ID：WOS:000264348800024
• The unfolding of alpha-momorcharin proceeds through the compact folded intermediate　　　　　　　　　　　　　　　
  Yukihiro Fukunaga; Etsuko Nishimoto; Takuhiro Otosu; Yasutaka Murakami; Shoji Yamashita
  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 巻：144, 号：4, 開始ページ：457, 終了ページ：466, 2008年10月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/jb/mvn088
  DOI ID：10.1093/jb/mvn088, ISSN：0021-924X, Web of Science ID：WOS:000259770200006
• Heterogeneous packing in the folding/unfolding intermediate state of bitter gourd trypsin inhibitor　　　　　　　　　　　　　　　
  Daisuke Takahashi; Shuzo Matsumoto; Etsuko Nishimoto; Takuhiro Otosu; Shoji Yamashita
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 巻：72, 号：6, 開始ページ：1498, 終了ページ：1505, 2008年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1271/bbb.80009
  DOI ID：10.1271/bbb.80009, ISSN：0916-8451, eISSN：1347-6947, Web of Science ID：WOS:000257305300012
• 2P-091 蛍光法による酸性条件下での蛋白質変性中間体解析(蛋白質・物性(2),第46回日本生物物理学会年会)　　　　　　　　　　　　　　　
  Otosu Takuhiro; Nishimoto Etsuko; Murakami Yasutaka; Yamashita Shoji
  生物物理, 巻：48, 開始ページ：S89, 2008年
  一般社団法人 日本生物物理学会, 英語
  DOI：https://doi.org/10.2142/biophys.48.S89_2
  DOI ID：10.2142/biophys.48.S89_2, CiNii Articles ID：110007013592
• 2P-087 リフォールディングモモルチャリンの構造とダイナミクス(蛋白質・物性(2),第46回日本生物物理学会年会)　　　　　　　　　　　　　　　
  Murakami Yasutaka; Nishimoto Etsuko; Otosu Takuhiro; Yamashita Shoji
  生物物理, 巻：48, 開始ページ：S88, 2008年
  一般社団法人 日本生物物理学会, 英語
  DOI：https://doi.org/10.2142/biophys.48.S88_5
  DOI ID：10.2142/biophys.48.S88_5, CiNii Articles ID：110007013588
• Spectrally and time-resolved fluorescence spectroscopic study on melittin-calmodulin interaction　　　　　　　　　　　　　　　
  Takuhiro Otosu; Etsuko Nishimoto; Shoji Yamashita
  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 巻：142, 号：5, 開始ページ：655, 終了ページ：661, 2007年11月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/jb/mvm180
  DOI ID：10.1093/jb/mvm180, ISSN：0021-924X, Web of Science ID：WOS:000253630200014
• 2P046 時間分割蛍光法によるRNase T1中Tryptophan残基の複数の誘電緩和特性に関する研究(蛋白質(構造・構造機能相関),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)　　　　　　　　　　　　　　　
  乙須 拓洋; 西本 悦子; 宮崎 義史; 山下 昭二
  生物物理, 巻：47, 開始ページ：S124, 2007年
  一般社団法人 日本生物物理学会, 英語
  DOI：https://doi.org/10.2142/biophys.47.S124_3
  DOI ID：10.2142/biophys.47.S124_3, CiNii Articles ID：110006562022
• The partially unfolded state of beta-momorcharin characterized with steady-state and time-resolved fluorescence studies　　　　　　　　　　　　　　　
  Yukihiro Fukunaga; Etsuko Nishimoto; Katsumi Yamashita; Takuhiro Otosu; Shoji Yamashita
  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 巻：141, 号：1, 開始ページ：9, 終了ページ：18, 2007年01月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/jb/mvm002
  DOI ID：10.1093/jb/mvm002, ISSN：0021-924X, Web of Science ID：WOS:000244866600002
• 2P010 Fluorescence spectroscopic study on the CaM-target protein interaction-Interaction with melittin(29. Protein structure and dynamics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)　　　　　　　　　　　　　　　
  Otosu Takuhiro; Nishimoto Etsuko; Fukunaga Yukihiro; Miyazaki Yoshifumi; Yamashita Shoji
  生物物理, 巻：46, 号：2, 開始ページ：S298, 2006年
  一般社団法人 日本生物物理学会, 英語
  DOI：https://doi.org/10.2142/biophys.46.S298_2
  DOI ID：10.2142/biophys.46.S298_2, CiNii Articles ID：110006193971
• 1P051 カルモデュリン-グルタミン酸デカルボキシラーゼに見る蛋白質間相互作用(蛋白質 B) 構造・機能相関))　　　　　　　　　　　　　　　
  乙須 拓洋; 松元 俊彦; 西本 悦子; 山下 昭二; 山浦 泉
  生物物理, 巻：45, 開始ページ：S44, 2005年
  一般社団法人 日本生物物理学会, 日本語
  DOI：https://doi.org/10.2142/biophys.45.S44_3
  DOI ID：10.2142/biophys.45.S44_3, CiNii Articles ID：110004571032

• Advanced Photon Counting: Applications, Methods, Instrumentation　　　　　　　　　　　　　　　
  Ishii Kunihiko; Otosu Takuhiro; Tahara Tahei, ［分担執筆］, Chapter 9 Lifetime-weighted FCS and 2D FLCS: Advanced application of time-tagged TCSPC
  Springer, 2015年
  英語
  ISBN：9783319156361

• 新規分光計測による混合脂質二重膜の新たな相境界の探索　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 2023年04月 - 2026年03月
  乙須 拓洋, 埼玉大学
  配分額（総額）：4550000, 配分額（直接経費）：3500000, 配分額（間接経費）：1050000
  課題番号：23K04662
• アミロイド形成を促す脂質‐蛋白質間相互作用の分子機構解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(B), 2019年04月01日 - 2023年03月31日
  乙須 拓洋; 山口 祥一, 埼玉大学
  配分額（総額）：15600000, 配分額（直接経費）：12000000, 配分額（間接経費）：3600000
  本研究ではモデル生体膜を用い，脂質二重膜上で促進されるアミロイド形成の分子機構理解を目的としている．2021年度はアミロイド形成蛋白質として知られているIAPPを用い，アミロイド感受性色素であるチオフラビンTを用いた凝集過程の追跡，ならびに蛍光ラベルしたIAPPを用いたIAPP拡散速度変化の追跡を行った．前者の実験の結果，IAPPはアミロイド形成開始後約70分間はアミロイドの形成は起こらず，その後加速度的にアミロイド形成が促進することが明らかとなった．
  この点についてより詳細に調べるために，蛍光ラベルしたIAPPを用いて，アミロイド形成開始後異なる経過時間での蛍光相関分光法によるIAPP拡散速度計測を行った．IAPPの拡散速度はIAPPの凝集サイズに敏感であることから，この測定により開始後70分間の間にどのような構造変化，またオリゴマーへの転移が起こっているかを調べることが可能となる．計測の結果，IAPPの拡散速度は70分の間ほとんど変化が見られなかった．この結果は，IAPPがアミロイド形成に至る前に形成するオリゴマーの分子サイズ（流体力学的半径）はモノマーとほとんど区別ができないことを示唆するものとなった．IAPPが構造変化を伴わずにオリゴマーとなった場合流体力学的半径の変化が起こることから，今回の結果はIAPPオリゴマーにおいてIAPPはモノマー時よりもよりコンパクトは構造へと転移している事を示唆する結果となった．
  課題番号：19H02669
• 膜融合の分子機構解明に向けた脂質二重膜間相互作用の分光学的研究　　　　　　　　　　　　　　　
  日揮実吉奨学会, 日揮実吉奨学会研究助成金, 2020年09月 - 2022年08月
  埼玉大学, 研究代表者
• 新規光技術に基づく界面選択的流速計測法の開発と応用　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 挑戦的研究(萌芽), 2017年06月30日 - 2019年03月31日
  乙須 拓洋, 埼玉大学
  配分額（総額）：6110000, 配分額（直接経費）：4700000, 配分額（間接経費）：1410000
  固液界面に代表される様々な界面近傍での物質の流れがバルクの流れとどう異なるかを理解することは，界面での効率的な化学反応の制御，血管内壁近傍での血液の流れの理解，などあらゆる分野における研究課題について重要な知見を与える．本研究では申請者が細胞膜研究を目的として開発を行った，エバネッセント光の干渉を利用する新規分光装置を界面での流速計測に応用し，高い精度での界面選択的流速計測法の確立を目指した．
  課題番号：17K19097
• 蛍光寿命の相関解析による蛋白質‐リガンド複合体形成機構解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 若手研究(B), 2015年04月01日 - 2017年03月31日
  乙須 拓洋, 埼玉大学
  配分額（総額）：4160000, 配分額（直接経費）：3200000, 配分額（間接経費）：960000
  蛋白質の構造揺らぎは生体機能発現と深くかかわっていることから，近年盛んに研究が行われている．本研究では平衡状態での構造揺らぎ解析の重要なツールである二次元蛍光寿命相関分光法を非平衡状態ダイナミクス研究に応用可能な手法へと拡張することを目的とした研究を行った．特に本研究ではリガンドの結合により誘起される蛋白質の構造変化追跡を目的とし，ケージド化合物の光解離に基づくリガンド放出を可能とする紫外光パルスと，蛋白質の構造変化追跡用の可視光パルスを同軸入射する新たな蛍光寿命相関分光装置の立ち上げに成功した．
  課題番号：15K17814