業績情報

• Genetic evidence: zebrafish hoxba and hoxbb clusters are essential for the anterior-posterior positioning of pectoral fins　　　　　　　　　　　　　　　
  Morimichi Kikuchi; Renka Fujii; Daiki Kobayashi; Yuki Kawabe; Haruna Kanno; Sohju Toyama; Farah Tawakkal; Kazuya Yamada; Akinori Kawamura
  bioRxiv (under review in eLife), 2025年02月, ［最終著者, 責任著者］
  DOI：https://doi.org/10.1101/2025.02.03.636262
  DOI ID：10.1101/2025.02.03.636262, ORCID：177282484
• Zebrafish hoxb7a mutants exhibit no apparent morphological abnormalities despite being the only paralogous group 7　　　　　　　　　　　　　　　
  Daiki Kobayashi; Akiteru Maeno; Renka Fujii; Akinori Kawamura
  Gene Reports, 2025年01月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］
  研究論文（学術雑誌）
• Live Visualization of Calcified Bones in Zebrafish and Medaka Larvae and Juveniles Using Calcein and Alizarin Red S　　　　　　　　　　　　　　　
  Rina Koita; Sae Oikawa; Taisei Tani; Masaru Matsuda; Akinori Kawamura
  BIO-PROTOCOL, 巻：14, 号：1361, 2024年12月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］
  Bio-Protocol, LLC, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.21769/bioprotoc.5142
  DOI ID：10.21769/bioprotoc.5142, ISSN：2331-8325
• Physical constraints on the positions and dimensions of the zebrafish swim bladder by surrounding bones
  Koumi Satoh; Akiteru Maeno; Urara Adachi; Mizuki Ishizaka; Kazuya Yamada; Rina Koita; Hidemichi Nakazawa; Sae Oikawa; Renka Fujii; Hiroyuki Furudate; Akinori Kawamura
  Journal of Anatomy, 2024年11月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］
  Abstract
  
  Precise regulation of organ size and position is crucial for optimal organ function. Since the swim bladder is primarily responsible for buoyancy in teleosts, early development and subsequent inflation of the swim bladder should be appropriately controlled with the body growth. However, the underlying mechanism remains unclear. In this study, we show that the size and position of the swim bladder are physically constrained by the surrounding bones in zebrafish. Non‐invasive micro‐CT scanning revealed that the anterior edge of the swim bladder is largely attached to the os suspensorium, which is an ossicle extending medioventrally from the 4th centrum. Additionally, we observed that hoxc6a mutants, which lack the os suspensorium, exhibited an anterior projection of the swim bladder beyond the 4th vertebra. During the swim bladder development, we found that the counterclockwise rotation of the os suspensorium correlates with posterior regression of the swim bladder, suggesting that the os suspensorium pushes the swim bladder posteriorly into its proper position. Furthermore, our results revealed a close association between the posterior region of the swim bladder and the pleural ribs. In hoxaa cluster mutants with additional ribs, the swim bladder expanded posteriorly, accompanied by an enlarged body cavity. Taken together, our results demonstrate the importance of the surrounding bones in the robust regulation of swim bladder size and position in zebrafish.
  Wiley, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1111/joa.14179
  DOI ID：10.1111/joa.14179, ISSN：0021-8782, eISSN：1469-7580
• The functional roles of zebrafish HoxA- and HoxD-related clusters in the pectoral fin development
  Mizuki Ishizaka; Akiteru Maeno; Hidemichi Nakazawa; Renka Fujii; Sae Oikawa; Taisei Tani; Haruna Kanno; Rina Koita; Akinori Kawamura
  Scientific Reports, 巻：14, 号：1, 2024年10月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］
  Abstract
  
  The paralogs 9–13 Hox genes in mouse HoxA and HoxD clusters are critical for limb development. When both HoxA and HoxD clusters are deleted in mice, significant limb truncation is observed compared to the phenotypes of single and compound mutants of Hox9-13 genes in these clusters. In zebrafish, mutations in hox13 genes in HoxA- and HoxD-related clusters result in abnormal morphology of pectoral fins, homologous to forelimbs. However, the effect of the simultaneous deletions of entire HoxA- and HoxD-related clusters on pectoral fin development remains unknown. Here, we generated mutants with several combinations of hoxaa, hoxab, and hoxda cluster deletions and analyzed the pectoral fin development. In hoxaa^−/−;hoxab^−/−;hoxda^−/− larvae, the endoskeletal disc and the fin-fold are significantly shortened in developing pectoral fins. In addition, we show that this anomaly is due to defects in the pectoral fin growth after the fin bud formation. Furthermore, in the surviving adult mutants, micro-CT scanning reveals defects in the posterior portion of the pectoral fin which is thought to represent latent regions of the limb. Our results further support that the functional role of HoxA and HoxD clusters is conserved in the paired appendage formation in bony fishes.
  Springer Science and Business Media LLC, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1038/s41598-024-74134-9
  DOI ID：10.1038/s41598-024-74134-9, eISSN：2045-2322, ORCID：163082463
• The Hox code responsible for the pattering of the anterior vertebrae in zebrafish
  Akiteru Maeno; Rina Koita; Hidemichi Nakazawa; Renka Fujii; Kazuya Yamada; Sae Oikawa; Taisei Tani; Mizuki Ishizaka; Koumi Satoh; Atsuki Ishizu; Takumi Sugawara; Urara Adachi; Morimichi Kikuchi; Norimasa Iwanami; Masaru Matsuda; Akinori Kawamura
  Development (Cambridge, England), 2024年06月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］
  The vertebral column is a characteristic structure of vertebrates. Genetic studies in mice have shown that Hox-mediated patterning plays a key role in specifying discrete anatomical regions of the vertebral column. Expression pattern analyses in several vertebrate embryos provided correlative evidence that the anterior boundaries of Hox expression coincide with distinct anatomical vertebrae. However, because functional analyses have been limited to mice, it remains unclear which Hox genes actually function in vertebral patterning in other vertebrates. In this study, various zebrafish hox mutants were generated for loss-of-function phenotypic analysis to functionally decipher the Hox code responsible for the zebrafish anterior vertebrae between the occipital and thoracic vertebrae. We found that hox genes in HoxB- and HoxC-related clusters participate in regulating the morphology of the zebrafish anterior vertebrae. In addition, medaka hoxc6a was found to be responsible for anterior vertebral identity as in zebrafish. Based on phenotypic similarities with Hoxc6 knockout mice, our results suggest that the Hox patterning system, including at least Hoxc6, may have been functionally established in the vertebral patterning of the common ancestor of ray-finned and lobe-finned fishes.
  The Company of Biologists, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1242/dev.202854
  DOI ID：10.1242/dev.202854, ISSN：0950-1991, eISSN：1477-9129
• Teleost Hox code defines regional identities competent for the formation of dorsal and anal fins.　　　　　　　　　　　　　　　
  Urara Adachi; Rina Koita; Akira Seto; Akiteru Maeno; Atsuki Ishizu; Sae Oikawa; Taisei Tani; Mizuki Ishizaka; Kazuya Yamada; Koumi Satoh; Hidemichi Nakazawa; Hiroyuki Furudate; Koichi Kawakami; Norimasa Iwanami; Masaru Matsuda; Akinori Kawamura
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 巻：121, 号：25, 開始ページ：e2403809121, 2024年06月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］, ［国際誌］
  The dorsal and anal fins can vary widely in position and length along the anterior-posterior axis in teleost fishes. However, the molecular mechanisms underlying the diversification of these fins remain unknown. Here, we used genetic approaches in zebrafish and medaka, in which the relative positions of the dorsal and anal fins are opposite, to demonstrate the crucial role of hox genes in the patterning of the teleost posterior body, including the dorsal and anal fins. By the CRISPR-Cas9-induced frameshift mutations and positional cloning of spontaneous dorsalfinless medaka, we show that various hox mutants exhibit the absence of dorsal or anal fins, or a stepwise posterior extension of these fins, with vertebral abnormalities. Our results indicate that multiple hox genes, primarily from hoxc-related clusters, encompass the regions responsible for the dorsal and anal fin formation along the anterior-posterior axis. These results further suggest that shifts in the anterior boundaries of hox expression which vary among fish species, lead to diversification in the position and size of the dorsal and anal fins, similar to how modulations in Hox expression can alter the number of anatomically distinct vertebrae in tetrapods. Furthermore, we show that hox genes responsible for dorsal fin formation are different between zebrafish and medaka. Our results suggest that a novel mechanism has occurred during teleost evolution, in which the gene network responsible for fin formation might have switched to the regulation downstream of other hox genes, leading to the remarkable diversity in the dorsal fin position.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1073/pnas.2403809121
  DOI ID：10.1073/pnas.2403809121, PubMed ID：38861596
• An atlas of seven zebrafish hox cluster mutants provides insights into sub/neofunctionalization of vertebrate Hox clusters.　　　　　　　　　　　　　　　
  Kazuya Yamada; Akiteru Maeno; Soh Araki; Morimichi Kikuchi; Masato Suzuki; Mizuki Ishizaka; Koumi Satoh; Kagari Akama; Yuki Kawabe; Kenya Suzuki; Daiki Kobayashi; Nanami Hamano; Akinori Kawamura
  Development (Cambridge, England), 巻：148, 号：11, 2021年06月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］, ［国際誌］
  Vertebrate Hox clusters are comprised of multiple Hox genes that control morphology and developmental timing along multiple body axes. Although results of genetic analyses using Hox-knockout mice have been accumulating, genetic studies in other vertebrates have not been sufficient for functional comparisons of vertebrate Hox genes. In this study, we isolated all of the seven hox cluster loss-of-function alleles in zebrafish using the CRISPR-Cas9 system. Comprehensive analysis of the embryonic phenotype and X-ray micro-computed tomography scan analysis of adult fish revealed several species-specific functional contributions of homologous Hox clusters along the appendicular axis, whereas important shared general principles were also confirmed, as exemplified by serial anterior vertebral transformations along the main body axis, observed in fish for the first time. Our results provide insights into discrete sub/neofunctionalization of vertebrate Hox clusters after quadruplication of the ancient Hox cluster. This set of seven complete hox cluster loss-of-function alleles provide a formidable resource for future developmental genetic analysis of the Hox patterning system in zebrafish.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1242/dev.198325
  DOI ID：10.1242/dev.198325, PubMed ID：34096572
• A globin-family protein, Cytoglobin 1, is involved in the development of neural crest-derived tissues and organs in zebrafish.　　　　　　　　　　　　　　　
  Kazuki Takahashi; Yuki Ito; Mami Yoshimura; Masataka Nikaido; Tatsuya Yuikawa; Akinori Kawamura; Sachiko Tsuda; Daichi Kage; Kyo Yamasu
  Developmental biology, 巻：472, 開始ページ：1, 終了ページ：17, 2021年04月, ［査読有り］, ［国際誌］
  The zebrafish is an excellent model animal that is amenable to forward genetics approaches. To uncover unknown developmental regulatory mechanisms in vertebrates, we conducted chemical mutagenesis screening and identified a novel mutation, kanazutsi (kzt). This mutation is recessive, and its homozygotes are embryonic lethal. Mutant embryos suffered from a variety of morphological defects, such as head flattening, pericardial edema, circulation defects, disrupted patterns of melanophore distribution, dwarf eyes, a defective jaw, and extensive apoptosis in the head, which indicates that the main affected tissues are derived from neural crest cells (NCCs). The expression of tissue-specific markers in kzt mutants showed that the early specification of NCCs was normal, but their later differentiation was severely affected. The mutation was mapped to chromosome 3 by linkage analyses, near cytoglobin 1 (cygb1), the product of which is a globin-family respiratory protein. cygb1 expression was activated during somitogenesis in somites and cranial NCCs in wild-type embryos but was significantly downregulated in mutant embryos, despite the normal primary structure of the gene product. The kzt mutation was phenocopied by cygb1 knockdown with low-dose morpholino oligos and was partially rescued by cygb1 overexpression. Both severe knockdown and null mutation of cygb1, established by the CRISPR/Cas9 technique, resulted in far more severe defects at early stages. Thus, it is highly likely that the downregulation of cygb1 is responsible for many, if not all, of the phenotypes of the kzt mutation. These results reveal a requirement for globin family proteins in vertebrate embryos, particularly in the differentiation and subsequent development of NCCs.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2020.12.016
  DOI ID：10.1016/j.ydbio.2020.12.016, PubMed ID：33358912
• Role of somite patterning in the formation of Weberian apparatus and pleural rib in zebrafish.　　　　　　　　　　　　　　　
  Kagari Akama; Kanami Ebata; Akiteru Maeno; Tomohito Taminato; Shiori Otosaka; Keiko Gengyo-Ando; Junichi Nakai; Kyo Yamasu; Akinori Kawamura
  Journal of anatomy, 巻：236, 号：4, 開始ページ：622, 終了ページ：629, 2020年04月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］, ［国際誌］
  In the vertebrate body, a metameric structure is present along the anterior-posterior axis. Zebrafish tbx6-/- larvae, in which somite boundaries do not form during embryogenesis, were shown to exhibit abnormal skeletal morphology such as rib, neural arch and hemal arch. In this study, we investigated the role of somite patterning in the formation of anterior vertebrae and ribs in more detail. Using three-dimensional computed tomography scans, we found that anterior vertebrae including the Weberian apparatus were severely affected in tbx6-/- larvae. In addition, pleural ribs of tbx6 mutants exhibited severe defects in the initial ossification, extension of ossification, and formation of parapophyses. Two-colour staining revealed that bifurcation of ribs was caused by fusion or branching of ribs in tbx6-/- . The parapophyses in tbx6-/- juvenile fish showed irregular positioning to centra and abnormal attachment to ribs. Furthermore, we found that the ossification of the distal portion of ribs proceeded along myotome boundaries even in irregularly positioned myotome boundaries. These results provide evidence of the contribution of somite patterning to the formation of the Weberian apparatus and rib in zebrafish.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1111/joa.13135
  DOI ID：10.1111/joa.13135, PubMed ID：31840255, PubMed Central ID：PMC7083572, 共同研究・競争的資金等ID：30059329
• Transcriptional autoregulation of zebrafish tbx6 is required for somite segmentation.　　　　　　　　　　　　　　　
  Hiroyuki Ban; Daisuke Yokota; Shiori Otosaka; Morimichi Kikuchi; Hirofumi Kinoshita; Yuuri Fujino; Taijiro Yabe; Hiroki Ovara; Ayaka Izuka; Kagari Akama; Kyo Yamasu; Shinji Takada; Akinori Kawamura
  Development (Cambridge, England), 巻：146, 号：18, 2019年09月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］, ［国際誌］
  The presumptive somite boundary in the presomitic mesoderm (PSM) is defined by the anterior border of the expression domain of Tbx6 protein. During somite segmentation, the expression domain of Tbx6 is regressed by Ripply-meditated degradation of Tbx6 protein. Although the expression of zebrafish tbx6 remains restricted to the PSM, the transcriptional regulation of tbx6 remains poorly understood. Here, we show that the expression of zebrafish tbx6 is maintained by transcriptional autoregulation. We find that a proximal-located cis-regulatory module, TR1, which contains two putative T-box sites, is required for somite segmentation in the intermediate body and for proper expression of segmentation genes. Embryos with deletion of TR1 exhibit significant reduction of tbx6 expression at the 12-somite stage, although its expression is initially observed. Additionally, Tbx6 is associated with TR1 and activates its own expression in the anterior PSM. Furthermore, the anterior expansion of tbx6 expression in ripply gene mutants is suppressed in a TR1-dependent manner. The results suggest that the autoregulatory loop of zebrafish tbx6 facilitates immediate removal of Tbx6 protein through termination of its own transcription at the anterior PSM.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1242/dev.177063
  DOI ID：10.1242/dev.177063, PubMed ID：31444219, 共同研究・競争的資金等ID：30059129
• Deadenylation by the CCR4-NOT complex contributes to the turnover of hairy-related mRNAs in the zebrafish segmentation clock.　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuuri Fujino; Kazuya Yamada; Chihiro Sugaya; Yuko Ooka; Hiroki Ovara; Hiroyuki Ban; Kagari Akama; Shiori Otosaka; Hirofumi Kinoshita; Kyo Yamasu; Yuichiro Mishima; Akinori Kawamura
  FEBS letters, 巻：592, 号：20, 開始ページ：3388, 終了ページ：3398, 2018年10月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］, ［国際誌］
  In the zebrafish segmentation clock, hairy/enhancer of split-related genes her1, her7, and hes6 encodes components of core oscillators. Since the expression of cyclic genes proceeds rapidly in the presomitic mesoderm (PSM), these hairy-related mRNAs are subject to strict post-transcriptional regulation. In this study, we demonstrate that inhibition of the CCR4-NOT deadenylase complex lengthens poly(A) tails of hairy-related mRNAs and increases the amount of these mRNAs, which is accompanied by defective somite segmentation. In transgenic embryos, we show that EGFP mRNAs with 3'UTRs of hairy-related genes exhibit turnover similar to endogenous mRNAs. Our results suggest that turnover rates of her1, her7, and hes6 mRNAs are differently regulated by the CCR4-NOT deadenylase complex possibly through their 3'UTRs in the zebrafish PSM.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1002/1873-3468.13261
  DOI ID：10.1002/1873-3468.13261, PubMed ID：30281784
• Functional roles of the Ripply-mediated suppression of segmentation gene expression at the anterior presomitic mesoderm in zebrafish.　　　　　　　　　　　　　　　
  Hirofumi Kinoshita; Nanae Ohgane; Yuuri Fujino; Taijiro Yabe; Hiroki Ovara; Daisuke Yokota; Ayaka Izuka; Daichi Kage; Kyo Yamasu; Shinji Takada; Akinori Kawamura
  Mechanisms of development, 巻：152, 開始ページ：21, 終了ページ：31, 2018年08月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］, ［国際誌］
  Somites sequentially form with a regular interval by the segmentation from the anterior region of the presomitic mesoderm (PSM). The expression of several genes involved in the somite segmentation is switched off at the transition from the anterior PSM to somites. Zebrafish Ripply1, which down-regulates a T-box transcription factor Tbx6, is required for the suppression of segmentation gene expression. However, the functional roles of the Ripply-mediated suppression of segmentation gene expression at the anterior PSM remain elusive. In this study, we generated ripply1 mutants and examined genetic interaction between ripply1/2 and tbx6. Zebrafish ripply1-/- embryos failed to form the somite boundaries as was observed in knockdown embryos. We found that somite segmentation defects in ripply1 mutants were suppressed by heterozygous mutation of tbx6 or partial translational inhibition of tbx6 by antisense morpholino. We further showed that somite boundaries that were recovered in tbx6+/-; ripply1-/- embryos were dependent on the function of ripply2, indicating that relative gene dosage between ripply1/2 and tbx6 plays a critical role in the somite formation. Interestingly, the expression of segmentation genes such mesp as was still not fully suppressed at the anterior PSM of tbx6+/-; ripply1-/- embryos although the somite formation and rostral-caudal polarity of somites were properly established. Furthermore, impaired myogenesis was observed in the segmented somites in tbx6+/-; ripply1-/- embryos. These results revealed that partial suppression of the segmentation gene expression by Ripply is sufficient to establish the rostral-caudal polarity of somites, and that stronger suppression of the segmentation gene expression by Ripply is required for proper myogenesis in zebrafish embryos.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.mod.2018.06.001
  DOI ID：10.1016/j.mod.2018.06.001, PubMed ID：29879477
• Enhancer activity-based identification of functional enhancers using zebrafish embryos.　　　　　　　　　　　　　　　
  Tomohito Taminato; Daisuke Yokota; Soh Araki; Hiroki Ovara; Kyo Yamasu; Akinori Kawamura
  Genomics, 巻：108, 号：2, 開始ページ：102, 終了ページ：7, 2016年08月, ［査読有り］, ［最終著者, 責任著者］, ［国際誌］
  Chromatin immunoprecipitation (ChIP) against enhancer-associated marks with massive sequencing is a powerful approach to identify genome-wide distributions of putative enhancers. However, functional in vivo analysis is required to elucidate the activities of predicted enhancers. Using zebrafish embryos, we established a ChIP-Injection method that enables identification of functional enhancers based on their enhancer activities in embryos. Each reporter gene possessing the enhancer-associated genomic region enriched by ChIP was injected into zebrafish embryos to analyze the activity of putative enhancers. By using the ChIP-Injection, we identified 32 distinct putative enhancers that drove specific expression. Additionally, we generated transgenic lines that exhibit distributions of the EGFP signal as was observed in the screening. Furthermore, the expression pattern driven by the identified somite-specific enhancer resembled that of the gene acta2. The results indicate that ChIP-Injection provides an efficient approach for identification of active enhancers in a potentially wide variety of developmental tissues and stages.
  ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, 英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2016.05.005
  DOI ID：10.1016/j.ygeno.2016.05.005, ISSN：0888-7543, eISSN：1089-8646, PubMed ID：27256877, Web of Science ID：WOS:000381477700007, 共同研究・競争的資金等ID：30059129
• Posterior-anterior gradient of zebrafish hes6 expression in the presomitic mesoderm is established by the combinatorial functions of the downstream enhancer and 3'UTR.　　　　　　　　　　　　　　　
  Akinori Kawamura; Hiroki Ovara; Yuko Ooka; Hirofumi Kinoshita; Miki Hoshikawa; Kenji Nakajo; Daisuke Yokota; Yuuri Fujino; Shin-ichi Higashijima; Shinji Takada; Kyo Yamasu
  Developmental biology, 巻：409, 号：2, 開始ページ：543, 終了ページ：54, 2016年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際誌］
  In vertebrates, the periodic formation of somites from the presomitic mesoderm (PSM) is driven by the molecular oscillator known as the segmentation clock. The hairy-related gene, hes6/her13.2, functions as a hub by dimerizing with other oscillators of the segmentation clock in zebrafish embryos. Although hes6 exhibits a posterior-anterior expression gradient in the posterior PSM with a peak at the tailbud, the detailed mechanisms underlying this unique expression pattern have not yet been clarified. By establishing several transgenic lines, we found that the transcriptional regulatory region downstream of hes6 in combination with the hes6 3'UTR recapitulates the endogenous gradient of hes6 mRNA expression. This downstream region, which we termed the PT enhancer, possessed several putative binding sites for the T-box and Ets transcription factors that were required for the regulatory activity. Indeed, the T-box transcription factor (Tbx16) and Ets transcription factor (Pea3) bound specifically to the putative binding sites and regulated the enhancer activity in zebrafish embryos. In addition, the 3'UTR of hes6 is required for recapitulation of the endogenous mRNA expression. Furthermore, the PT enhancer with the 3'UTR of hes6 responded to the inhibition of retinoic acid synthesis and fibroblast growth factor signaling in a manner similar to endogenous hes6. The results showed that transcriptional regulation by the T-box and Ets transcription factors, combined with the mRNA stability given by the 3'UTR, is responsible for the unique expression gradient of hes6 mRNA in the posterior PSM of zebrafish embryos.
  ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, 英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2015.11.010
  DOI ID：10.1016/j.ydbio.2015.11.010, ISSN：0012-1606, eISSN：1095-564X, ORCID：46524491, PubMed ID：26596999, SCOPUS ID：84947982899, Web of Science ID：WOS:000369122300019
• Gbx2 functions as a transcriptional repressor to regulate the specification and morphogenesis of the mid-hindbrain junction in a dosage- and stage-dependent manner　　　　　　　　　　　　　　　
  Yukiko Nakayama; Hiroshi Kikuta; Maiko Kanai; Kimihito Yoshikawa; Akinori Kawamura; Kana Kobayashi; Zhe Wang; Alam Khan; Koichi Kawakami; Kyo Yamasu
  MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 巻：130, 号：11-12, 開始ページ：532, 終了ページ：552, 2013年11月, ［査読有り］
  The Gbx subfamily of homeodomain transcription factors is involved in the positioning of the isthmus, which patterns the midbrain and cerebellum in vertebrates. To uncover the details of Gbx functions, we first examined the dose dependency of its effects on brain formation in zebrafish and found that high-dose gbx2 mRNA injection affected the entire forebrain and midbrain, whereas low-dose mRNA specifically disrupted the isthmic folding at the midbrain-hindbrain boundary (MHB) but only weakly affected the expression of genes involved in MHB specification. Thus, isthmus morphogenesis, and not its early specification, is highly sensitive to gbx2. Transient induction of heat-inducible gbx2 using transgenic fish showed that MHB specification is most sensitive to gbx2 at the end of epiboly and further suggested that otx2 is the direct target gene. These together demonstrate that gbx2 regulates both specification and morphogenesis of the MHB/isthmus region. Deletion analyses showed that both the N- and C-terminal regions contribute to the suppressive activity of Gbx2 against the anterior brain and that the N-terminal core region, including the Eh1 and proline-rich sequences, is required for this Gbx2 activity. Comparison of the effects of activated and repressive forms with wild-type Gbx2 suggested that Gbx2 functions as a transcriptional repressor, which was further evidenced by a luciferase assay in which gbx2 repressed the MHB enhancer of fgf8a in mouse P19 cells. (C) 2013 Elsevier Ireland Ltd. All rights reserved.
  ELSEVIER SCIENCE BV, 英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.mod.2013.07.004
  DOI ID：10.1016/j.mod.2013.07.004, ISSN：0925-4773, eISSN：1872-6356, PubMed ID：23933069, Web of Science ID：WOS:000326983200002
• Mesendoderm specification depends on the function of Pou2, the class V POU-type transcription factor, during zebrafish embryogenesis.　　　　　　　　　　　　　　　
  Alam Khan; Andrew Nakamoto; Miyako Tai; Shinji Saito; Yukiko Nakayama; Akinori Kawamura; Hiroyuki Takeda; Kyo Yamasu
  Development, growth & differentiation, 巻：54, 号：7, 開始ページ：686, 終了ページ：701, 2012年09月, ［査読有り］, ［国内誌］
  Zebrafish pou2, encoding the class V POU transcription factor orthologous to mouse Oct-3/4, has been implicated in different aspects of development, such as dorsoventral patterning, endoderm formation, and brain regionalization, by analyzing pou2 mutant embryos. In the present study, we first conducted overexpression of pou2-modified genes by mRNA injection, and found that pou2 and its active form (vp-pou2) augmented mesoderm formation and suppressed endoderm specification, whereas repressive pou2 (en-pou2) affected the formation of the mesoderm and endoderm in a different manner. To avoid complications that might arise from different pou2 functions during the course of development, we used a transgenic line harboring inducible en-pou2 (HEP), which could function in a dominant-negative manner. We found that suppressing endogenous pou2 by HEP induction at the mid-blastula stage enhanced endoderm development at the expense of mesoderm, whereas the same treatment in the late blastulae promoted mesoderm formation and suppressed the endoderm specification. Further analyses using HEP induction revealed that, from late epiboly to early somitogenesis, pou2 regulated additional developmental aspects, such as brain regionalization, heart development, and tail formation. Our findings suggest that Pou2 functions in multiple aspects of vertebrate development, especially in the binary decision of the mesendoderm to mesoderm and endoderm in different ways depending on the developmental stage.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1111/j.1440-169X.2012.01369.x
  DOI ID：10.1111/j.1440-169X.2012.01369.x, ISSN：0012-1592, PubMed ID：22913532, Web of Science ID：WOS:000309060800002
• Pou2, a class V POU-type transcription factor in zebrafish, regulates dorsoventral patterning and convergent extension movement at different blastula stages　　　　　　　　　　　　　　　
  Khan Alam; Nakamoto Andrew; Okamoto Shun; Tai Miyako; Nakayama Yukiko; Kobayashi Kana; Kawamura Akinori; Takeda Hiroyuki; Yamasu Kyo
  MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 巻：129, 号：9-12, 開始ページ：219, 終了ページ：235, 2012年09月, ［査読有り］
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.mod.2012.07.007
  DOI ID：10.1016/j.mod.2012.07.007, ISSN：0925-4773, PubMed ID：22921661, Web of Science ID：WOS:000310355900003
• Ripply3, a Tbx1 repressor, is required for development of the pharyngeal apparatus and its derivatives in mice.　　　　　　　　　　　　　　　
  Tadashi Okubo; Akinori Kawamura; Jun Takahashi; Hisato Yagi; Masae Morishima; Rumiko Matsuoka; Shinji Takada
  Development (Cambridge, England), 巻：138, 号：2, 開始ページ：339, 終了ページ：48, 2011年01月, ［査読有り］, ［国際誌］
  The pharyngeal apparatus is a transient structure that gives rise to the thymus and the parathyroid glands and also contributes to the development of arteries and the cardiac outflow tract. A typical developmental disorder of the pharyngeal apparatus is the 22q11 deletion syndrome (22q11DS), for which Tbx1 is responsible. Here, we show that Ripply3 can modulate Tbx1 activity and plays a role in the development of the pharyngeal apparatus. Ripply3 expression is observed in the pharyngeal ectoderm and endoderm and overlaps with strong expression of Tbx1 in the caudal pharyngeal endoderm. Ripply3 suppresses transcriptional activation by Tbx1 in luciferase assays in vitro. Ripply3-deficient mice exhibit abnormal development of pharyngeal derivatives, including ectopic formation of the thymus and the parathyroid gland, as well as cardiovascular malformation. Corresponding with these defects, Ripply3-deficient embryos show hypotrophy of the caudal pharyngeal apparatus. Ripply3 represses Tbx1-induced expression of Pax9 in luciferase assays in vitro, and Ripply3-deficient embryos exhibit upregulated Pax9 expression. Together, our results show that Ripply3 plays a role in pharyngeal development, probably by regulating Tbx1 activity.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1242/dev.054056
  DOI ID：10.1242/dev.054056, PubMed ID：21177346
• FGF receptor gene expression and its regulation by FGF signaling during early zebrafish development.　　　　　　　　　　　　　　　
  Satoshi Ota; Noriko Tonou-Fujimori; Noriko Tonou-Fujimori; Yukiko Nakayama; Yuki Ito; Akinori Kawamura; Kyo Yamasu
  Genesis (New York, N.Y. : 2000), 巻：48, 号：12, 開始ページ：707, 終了ページ：16, 2010年12月, ［査読有り］, ［国際誌］
  The expression of all four fgfr genes was extensively examined throughout early embryogenesis of the zebrafish (Danio rerio). fgfr1 alone was expressed maternally throughout the blastoderm, and then zygotically in the anterior neural plate and presomitic mesoderm. fgfr4 expression was first detected in late blastulae and was gradually restricted to the brain. fgfr2 and fgfr3 expression were initiated in early and late gastrulae, respectively; fgfr2 was expressed in the anterior neural plate and somitic mesoderm, whereas fgfr3 was activated in the axial mesoderm and then in the midbrain and somitic mesoderm. During somitogenesis, each of these fgfr genes was expressed in a characteristic manner in the brain. Using an FGF signal inhibitor, dominant-negative FGF receptors and fgf8.1/fgf8a mutants, we found that fgfr expression is directly or indirectly regulated by FGF signaling during epiboly and at the end of somitogenesis, revealing the presence of an autoregulatory mechanism.
  WILEY-LISS, 英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1002/dvg.20682
  DOI ID：10.1002/dvg.20682, ISSN：1526-954X, PubMed ID：20960516, Web of Science ID：WOS:000285397300004
• Activator-to-repressor conversion of T-box transcription factors by the Ripply family of Groucho/TLE-associated mediators.　　　　　　　　　　　　　　　
  Akinori Kawamura; Sumito Koshida; Shinji Takada
  Molecular and cellular biology, 巻：28, 号：10, 開始ページ：3236, 終了ページ：44, 2008年05月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際誌］
  The T-box family of transcription factors, defined by a conserved DNA binding domain called the T-box, regulate various aspects of embryogenesis by activating and/or repressing downstream genes. In spite of the biological significance of the T-box proteins, how they regulate transcription remains to be elucidated. Here we show that the Groucho/TLE-associated protein Ripply converts T-box proteins from activators to repressors. In cultured cells, zebrafish Ripply1, an essential component in somite segmentation, and its structural relatives, Ripply2 and -3, suppress the transcriptional activation mediated by the T-box protein Tbx24, which is coexpressed with ripply1 during segmentation. Ripply1 associates with Tbx24 and converts it to a repressor. Ripply1 also antagonizes the transcriptional activation of another T-box protein, No tail (Ntl), the zebrafish ortholog of Brachyury. Furthermore, injection of a high dosage of ripply1 mRNA into zebrafish eggs causes defective development of the posterior trunk, similar to the phenotype observed in homozygous mutants of ntl. A mutant form of Ripply1 defective in association with Tbx24 also lacks activity in zebrafish embryos. These results indicate that the intrinsic transcriptional property of T-box proteins is controlled by Ripply family proteins, which act as specific adaptors that recruit the global corepressor Groucho/TLE to T-box proteins.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1128/MCB.01754-07
  DOI ID：10.1128/MCB.01754-07, PubMed ID：18332117, PubMed Central ID：PMC2423164
• Paf1 complex homologues are required for Notch-regulated transcription during somite segmentation.　　　　　　　　　　　　　　　
  Takashi Akanuma; Sumito Koshida; Akinori Kawamura; Yasuyuki Kishimoto; Shinji Takada
  EMBO reports, 巻：8, 号：9, 開始ページ：858, 終了ページ：63, 2007年09月, ［査読有り］, ［国際誌］
  Members of the yeast polymerase-associated factor 1 (Paf1) complex, which is composed of at least five components (Paf1, Rtf1, Cdc73, Leo1 and Ctr9), are conserved from yeast to humans. Although these proteins have been implicated in RNA polymerase II-mediated transcription, their roles in vertebrate development have not been explained. Here, we show that a zebrafish mutant with a somite segmentation defect is deficient in rtf1. In addition, embryos deficient in rtf1 or ctr9 show abnormal development of the heart, ears and neural crest cells. rtf1 is required for correct RNA levels of the Notch-regulated genes her1, her7 and deltaC, and also for Notch-induced her1 expression in the presomitic mesoderm. Furthermore, the phenotype observed in rtf1-deficient mutants is enhanced by an additional deficiency in mind bomb, which encodes an effector of Notch signalling. Therefore, zebrafish homologues of the yeast Paf1 complex seem to preferentially affect a subset of genes, including Notch-regulated genes, during embryogenesis.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  ISSN：1469-221X, PubMed ID：17721442, PubMed Central ID：PMC1973952
• Cellular responses of the ciliate, Tetrahymena thermophila, to far infrared irradiation.　　　　　　　　　　　　　　　
  Robert Shiurba; Tatsuo Hirabayashi; Masaru Masuda; Akinori Kawamura; Yuta Komoike; William Klitz; Keiichi Kinowaki; Takashi Funatsu; Shunzo Kondo; Shin Kiyokawa; Toshiro Sugai; Kosuke Kawamura; Hideo Namiki; Toru Higashinakagawa
  Photochemical & photobiological sciences : Official journal of the European Photochemistry Association and the European Society for Photobiology, 巻：5, 号：9, 開始ページ：799, 終了ページ：807, 2006年09月, ［査読有り］, ［国際誌］
  Infrared rays from sunlight permeate the earth's atmosphere, yet little is known about their interactions with living organisms. To learn whether they affect cell structure and function, we tested the ciliated protozoan, Tetrahymena thermophila. These unicellular eukaryotes aggregate in swarms near the surface of freshwater habitats, where direct and diffuse solar radiation impinge upon the water-air interface. We report that populations irradiated in laboratory cultures grew and mated normally, but major changes occurred in cell physiology during the stationary phase. Early on, there were significant reductions in chromatin body size and the antibody reactivity of methyl groups on lysine residues 4 and 9 in histone H3. Later, when cells began to starve, messenger RNAs for key proteins related to chromatin structure, intermediary metabolism and cellular motility increased from two- to nearly nine-fold. Metabolic activity, swimming speed and linearity of motion also increased, and spindle shaped cells with a caudal cilium appeared. Our findings suggest that infrared radiation enhances differentiation towards a dispersal cell-like phenotype in saturated populations of Tetrahymena thermophila.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  ISSN：1474-905X, PubMed ID：17047831
• Groucho-associated transcriptional repressor ripply1 is required for proper transition from the presomitic mesoderm to somites.　　　　　　　　　　　　　　　
  Akinori Kawamura; Sumito Koshida; Hiroko Hijikata; Akiko Ohbayashi; Hisato Kondoh; Shinji Takada
  Developmental cell, 巻：9, 号：6, 開始ページ：735, 終了ページ：44, 2005年12月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際誌］
  Concomitant with the transition from the presomitic mesoderm (PSM) to somites, the periodical gene expression characteristic of the PSM is drastically changed and translated into the segmental structure. However, the molecular mechanism underlying this transition has remained obscure. Here, we show that ripply1, encoding a nuclear protein associated with the transcriptional corepressor Groucho, is required for this transition. Zebrafish ripply1 is expressed in the anterior PSM and in several newly formed somites. Ripply1 represses mesp-b expression in the PSM through a Groucho-interacting motif. In ripply1-deficient embryos, somite boundaries do not form, the characteristic gene expression in the PSM is not properly terminated, and the initially established rostrocaudal polarity in the segmental unit is not maintained, whereas paraxial mesoderm cells become differentiated. Thus, ripply1 plays dual roles in the transition from the PSM to somites: termination of the segmentation program in the PSM and maintenance of the rostrocaudal polarity.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  ISSN：1534-5807, PubMed ID：16326386, 共同研究・競争的資金等ID：30059135
• Zebrafish hairy/enhancer of split protein links FGF signaling to cyclic gene expression in the periodic segmentation of somites.　　　　　　　　　　　　　　　
  Akinori Kawamura; Sumito Koshida; Hiroko Hijikata; Takuya Sakaguchi; Hisato Kondoh; Shinji Takada
  Genes & development, 巻：19, 号：10, 開始ページ：1156, 終了ページ：61, 2005年05月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際誌］
  Notch and fibroblast growth factor (FGF) signaling pathways have been implicated in the establishment of proper periodicity of vertebrate somites. Here, we show evidence that a Hes6-related hairy/Enhancer of split-related gene, her13.2, links FGF signaling to the Notch-regulated oscillation machinery in zebrafish. Expression of her13.2 is induced by FGF-soaked beads and decreased by an FGF signaling inhibitor. her13.2 is required for periodic repression of the Notch-regulated genes her1 and her7, and for proper somite segmentation. Furthermore, Her13.2 augments autorepression of her1 in association with Her1 protein. Therefore, FGF signaling appears to maintain the oscillation machinery by supplying a binding partner, Her13.2, for Her1.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  ISSN：0890-9369, PubMed ID：15905406, PubMed Central ID：PMC1132002, 共同研究・競争的資金等ID：30059135
• Zebrafish Polycomb group gene ph2alpha is required for epiboly and tailbud formation acting downstream of FGF signaling.　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuta Komoike; Akinori Kawamura; Norihisa Shindo; Chie Sato; Junichi Satoh; Robert Shiurba; Toru Higashinakagawa
  Biochemical and biophysical research communications, 巻：328, 号：4, 開始ページ：858, 終了ページ：66, 2005年03月, ［査読有り］, ［国際誌］
  We analyzed Polycomb group gene ph2alpha functionally in zebrafish embryos by a gene knock-down procedure using morpholino antisense oligos. Inhibition of ph2alpha message translation resulted in abnormal epibolic movements as well as a thick tailbud or incomplete covering of the yolk plug. At the 24hpf stage, morphants had short trunks and tails, phenotypes similar to those with disturbances in FGF signaling. Accordingly, we looked at the effects of ph2alpha expression upstream and downstream of the FGF pathway. Treatment with SU5402, an inhibitor of Fgfrs, or injection of dominant-negative Fgfr1 DNA markedly reduced ph2alpha expression in the tailbud. In addition, cells expressing mRNAs for no tail, spadetail, myoD, and papc, which are involved in FGF-related development of posterior mesoderm, were distributed abnormally. Collectively, the data argue that ph2alpha is required for epiboly and tailbud formation, acting downstream of the FGF signaling pathway.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  ISSN：0006-291X, PubMed ID：15707958
• pc1 and psc1, zebrafish homologs of Drosophila Polycomb and Posterior sex combs, encode nuclear proteins capable of complex interactions.　　　　　　　　　　　　　　　
  Akinori Kawamura; Shin'ichiro Yokota; Kouji Yamada; Hitoshi Inoue; Keiji Inohaya; Ken Yamazaki; Ikuo Yasumasu; Toru Higashinakagawa
  Biochemical and biophysical research communications, 巻：294, 号：2, 開始ページ：456, 終了ページ：63, 2002年06月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際誌］
  Drosophila Polycomb group proteins are thought to form multimeric nuclear complexes that are responsible for stable transmission of repressed states of gene expression during the proliferation of differentiating embryos. In this study, we cloned, sequenced, and characterized two Polycomb group homologs, designated pc1 and psc1, in zebrafish. Amino acid sequence analyses determined that pc1 is a structural homolog of Drosophila Polycomb and that psc1 is a homolog of Drosophila Posterior sex combs. Northern blots and whole-mount in situ hybridization revealed that pc1 and psc1 had overlapping expression patterns at successive stages of embryogenesis. Immunocytochemistry localized both Pc1 and Psc1 protein in blastomere nuclei. Pull-down assays and two-hybrid system deletion analyses showed that these proteins were capable of homotypic and heterotypic interactions and identified the regions required for these interactions. The evidence supports the idea that zebrafish Polycomb group proteins, like those of other species, form nuclear complexes with compositions that may vary in a spatio-temporal manner during development.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  ISSN：0006-291X, PubMed ID：12051733
• Alternative transcripts of a polyhomeotic gene homolog are expressed in distinct regions of somites during segmentation of zebrafish embryos.　　　　　　　　　　　　　　　
  Akinori Kawamura; Kouji Yamada; Ken'ichi Fujimori; Toru Higashinakagawa
  Biochemical and biophysical research communications, 巻：291, 号：2, 開始ページ：245, 終了ページ：54, 2002年02月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際誌］
  Here we describe isolation and characterization of two zebrafish cDNAs, designated ph2alpha and ph2beta, which were identified as structural homologs of the Drosophila polyhomeotic, mouse Mph2, and human HPH2 genes, collectively termed the Polycomb group. The alpha and beta transcripts shared a 1.9-kb sequence at their 3'-termini. Alpha had an additional 1.6-kb sequence extending toward its 5'-terminus. Only a short 0.1-kb segment was unique to beta. Sequencing of a genomic clone corresponding to the two cDNAs indicated that the mRNAs were transcribed from a single gene locus by alternative promoters. Northern blots revealed expression of alpha transcripts during the segmentation period, while beta expression occurred at all developmental stages examined. Whole-mount in situ hybridizations with an alpha-specific probe and a probe recognizing both transcripts revealed distinct spatio-temporal expression patterns along developing somites. Alpha transcripts were detected initially at the 7-8 somite stage; beta transcripts appeared in the first somites. As segmentation proceeded, alpha and beta expression shifted position toward the tailbud in parallel with the formation of each somite. Within individual somites, the signal corresponding to alpha was strongest at the posterior border and weakest in the anterior region. Conversely, that corresponding to beta was strongest at the anterior border and weakest in the posterior region. The data support the idea that Ph2alpha and Ph2beta are involved in spatio-temporal generation of somites as well as in specification of antero-posterior regional differences within individual somites.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  ISSN：0006-291X, PubMed ID：11846397

• 魚の背ビレやしりビレを作る位置はどのように決まるのか？ ～Hox遺伝子と改良メダカ～　　　　　　　　　　　　　　　
  松田 勝; 川村哲規, ［分担執筆］
  観賞魚総合誌 アクアライフ（11月号）, 2024年10月
• 分子生物学15講　　　　　　　　　　　　　　　
  東中川, 徹; 桑山, 秀一; 川村, 哲規, ［共編者(共編著者)］
  オーム社, 2024年10月
  日本語, 総ページ数：xiv, 377p
  CiNii Books：http://ci.nii.ac.jp/ncid/BD08964852
  ISBN：9784274228094, CiNii Books ID：BD08964852
• 動物の事典　　　　　　　　　　　　　　　
  ［分担執筆］, 「細胞分化」、「魚類の発生」
  朝倉書店, 2020年11月
  ISBN：4254171668
• Groucho結合因子Ripply1による分節プログラム　　　　　　　　　　　　　　　
  川村 哲規; 越田 澄人; 高田 慎治, ［分担執筆］
  細胞工学, 2006年02月

• 多様な形態を示すヒレの形成を司るHox遺伝子群　　　　　　　　　　　　　　　
  川村哲規
  日本動物学会 第93回大会2022 シンポジウム「脊椎動物の多様な形態をもたらす分子基盤」, 2022年09月
  シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
• ゼブラフィッシュ遺伝学を用いたhoxクラスターの機能解析　　　　　　　　　　　　　　　
  川村哲規
  日本動物学会 第91回大会2020 シンポジウム「ゼブラフィッシュが切り開く新たな生物学」, 2020年09月
  2020年09月 - 2020年09月, シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
  共同研究・競争的資金等ID：30059127
• 成長に伴うゼブラフィッシュの体節間血管の再配置に関する研究　　　　　　　　　　　　　　　
  松野由美香; 乙坂栞里; 鈴木聖人; 川村哲規
  第72回 日本動物学会関東支部会, 2020年03月
  ポスター発表
• Chemical Screeningを用いたゼブラフィッシュ肋骨形成の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  佐藤こうみ; 川村哲規
  第72回 日本動物学会関東支部会, 2020年03月
  ポスター発表
• ゼブラフィッシュ成魚の全身骨格および軟組織形成におけるhoxクラスターの機能解析　　　　　　　　　　　　　　　
  鈴木聖人; 山田一哉; 前野哲輝; 菊地守道; 荒木 颯; 石坂瑞樹; 赤間 燿; 川村 哲規
  第72回 日本動物学会関東支部会, 2020年03月
  ポスター発表
  共同研究・競争的資金等ID：30059127
• ゼブラフィッシュ胚発生におけるhoxクラスターの機能解析　　　　　　　　　　　　　　　
  菊地守道; 山田一哉; 前野哲輝; 荒木 颯; 鈴木聖人; 石坂瑞樹; 赤間 燿; 川村哲規
  第72回 日本動物学会関東支部会, 2020年03月
  ポスター発表
  共同研究・競争的資金等ID：30059127
• 未分節中胚葉におけるtbx6の自己転写活性化は体節の分節化に必須である　　　　　　　　　　　　　　　
  Ban H; Yokota D; Otosaka S; Kikuchi M; Kinoshita H; Fujino Y; Yabe T; Ovara H; Izuka A; Akama K; Yamasu K; Takada S; Kawamura A
  第25回 小型魚類研究会, 2019年09月
  ポスター発表
  共同研究・競争的資金等ID：30059129
• ゼブラフィッシュ発生におけるhoxクラスターの異なる機能分担化　　　　　　　　　　　　　　　
  Yamada K; Kikuchi M; Maeno A; Araki S; Akama K; Suzuki M; Ishizaka M; Kawamura A
  第25回 小型魚類研究会, 2019年09月
  ポスター発表
  共同研究・競争的資金等ID：30059127
• ゼブラフィッシュ変異体を用いた肋骨形成機構の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  江幡 奏美; 赤間 燿; 田港 朝仁; 弥益 恭; 川村 哲規
  第70回 日本動物学会 関東支部大会, 2018年03月
  ポスター発表
• ゼブラフィッシュ未分節中胚葉におけるtbx6遺伝子の転写制御機構の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  伴 博之; 横田 大佑; 乙坂 栞里; 木下 宏史; 藤野 友梨; 矢部 泰二郎; 小原 弘幹; 猪塚 彩花; 赤間 燿; 鹿毛 大地; 弥益 恭; 高田 慎治; 川村 哲規
  第70回 日本動物学会 関東支部大会, 2018年03月
  ポスター発表
  共同研究・競争的資金等ID：30059129
• ゼブラフィッシュを用いたhoxクラスター変異体の作製と解析　　　　　　　　　　　　　　　
  荒木 颯; 赤間 燿; 弥益 恭; 川村 哲規
  第40回 日本分子生物学会年会, 2017年12月
  ポスター発表
• ゼブラフィッシュ分節時計におけるhairy関連遺伝子のmRNA不安定性に関する解析　　　　　　　　　　　　　　　
  藤野友梨; 菅谷千尋; 大岡優子; 木下宏史; 小原弘幹; 弥益 恭; 三嶋雄一郎; 川村哲規
  第40回 日本分子生物学会年, 2017年12月
  ポスター発表
• ゼブラフィッシュ未分節中胚葉におけるtbx6遺伝子の発現は positive autoregulatory loopによって維持される　　　　　　　　　　　　　　　
  伴 博之; 横田大佑; 木下宏史; 藤野友梨; 矢部泰二郎; 小原弘幹; 猪塚彩花; 赤間 耀; 鹿毛大地; 弥益 恭; 高田慎治; 川村哲規
  第40回 日本分子生物学会年, 2017年12月
  ポスター発表
• Somite patterning provides positional cues for the segmental ossification of the vertebral column in teleosts　　　　　　　　　　　　　　　
  Akama K; Inohaya K; Taminato T; Ebata K; Fujino Y; Kinoshita H; Yamasu K; Kawamura A
  第23回 小型魚類研究会, 2017年08月
  ポスター発表
• Distinct mRNA turnover rate mediated by 3’UTR of hairy-related genes in the segmentation clock of zebrafish embryos　　　　　　　　　　　　　　　
  Fujino Y; Sugaya C; Ooka Y; Kinoshita H; Ovara H; Yamasu K; Mishima Y; Kawamura A
  第23回 小型魚類研究会, 2017年08月
  ポスター発表
• Transcriptional autoregulatory loop maintains the expression of tbx6 in the zebrafish presomitic mesoderm　　　　　　　　　　　　　　　
  Ban H; Yokota D; Kinoshita H; Fujino Y; Yabe T; Ovara H; Izuka A; Akama K; Kage D; Yamasu K; Takada S; Kawamura A
  第23回 小型魚類研究会, 2017年08月
  ポスター発表
• Genetic interactions between Ripply and Tbx6 in the somite segmentation and myogenesis in zebrafish embryos　　　　　　　　　　　　　　　
  Kinoshita H; Fujino Y; Ohgane N; Yabe T; Yokota D; Ovara H; Izuka A; Ban H; Kage D; Yamasu K; Takada S; Kawamura A
  50th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, 2017年05月
  ポスター発表

• 2017年 - 現在
  分子発生制御学特論, 埼玉大学大学院理工学研究科
• 2013年 - 現在
  基礎生物学演習Ⅰ,Ⅱ, 埼玉大学理学部生体制御学科
• 2013年 - 現在
  発生生物学輪講ⅠＡ,Ｂ, 埼玉大学大学院理工学研究科
• 2013年 - 現在
  発生生物学特論Ⅰ, 埼玉大学大学院理工学研究科
• 2013年 - 現在
  発生生物学Ⅱ, 埼玉大学理学部生体制御学科
• 2008年 - 現在
  生体制御学実験/生物学実験Ｂ, 生体制御学実験/生物学実験Ｂ
• 2007年 - 現在
  生体制御学実験Ⅲ（旧：発生情報学実験）, 埼玉大学理学部生体制御学科
• 2007年 - 現在
  発生情報学演習, 生体制御学実験Ⅲ（旧：発生情報学実験）

• 現在, 日本分子生物学会
• 現在, 日本動物学会
• 現在, 日本発生生物学会

• マイクロ CT スキャンを用いた魚の形態多様性をもたらす分子機構の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  国立遺伝学研究所, NIG-JOINT（B）, 2025年04月 - 2026年03月
  研究代表者
• ゼブラフィッシュHoxコードの発生遺伝学解析　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 基盤研究(C), 2023年04月 - 2026年03月
  川村 哲規, 埼玉大学
  配分額（総額）：4550000, 配分額（直接経費）：3500000, 配分額（間接経費）：1050000
  課題番号：23K05790
• ゼブラフィッシュを用いたHox遺伝子群の機能解析　　　　　　　　　　　　　　　
  自然科学研究機構 生命創成探求センター, 一般共同研究, 2023年12月 - 2025年03月
• マイクロCTスキャンを用いたゼブラフィッシュHox変異体の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所, NIG-JOINT(A), 2021年04月 - 2025年03月
  川村哲規
• ゼブラフィッシュを用いたHox遺伝子クラスターのゲノム機能解析　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 基盤研究(C), 2018年04月 - 2022年03月
  川村 哲規, 埼玉大学, 研究代表者
  配分額（総額）：4290000, 配分額（直接経費）：3300000, 配分額（間接経費）：990000
  Hox遺伝子群の発見から四半世紀以上経った現在においても、その機能と制御機構については不明な点が多く残されている。その大きな理由として、Hox遺伝子群のゲノム上の構造と、それに伴う相補性の高さが挙げられる。ショウジョウバエでは、単一の染色体上に一列に並んだホメオティック遺伝子群はそれぞれ固有の機能を持ち、遺伝子と機能の相関が明確である。一方、脊椎動物においては、脊椎動物の進化の初期過程で生じた2回の全ゲノム重複により、ヒトやマウスでは4つのHoxクラスターが存在している。また、真骨魚類では4つのHoxクラスターがさらに倍加し8つのクラスターを生じた後、ゼブラフィッシュではhoxdbクラスターが消失して計7つのクラスター構造を有している。さらに、単一のHoxクラスター内には10個程度のHox遺伝子が並び、個々のHox遺伝子はcis及びtransに相補しあい、その結果、遺伝子と機能の関係は非常に複雑である。このように高度に相補性を持つ脊椎動物のHoxクラスターの機能と制御の全容を解明するには、ゲノムレベルでHox遺伝子クラスターを捉えた解析が必須である。本研究では、胚発生が早く、遺伝学的解析に優れたゼブラフィッシュの利点を生かし、それぞれのHox遺伝子クラスターを破壊した欠損体をCRISPR-Cas9システムを用いて作製し、脊椎動物におけるHox遺伝子クラスターの役割を解明する。さらに、Hox遺伝子クラスターの多重変異体を作製し、その表現形解析を行うとともに各クラスターのゲノム構造を解析することにより、Hox遺伝子クラスター間の相互作用の意義を解明する。
  課題番号：18K06177
  講演・口頭発表等ID：30059323
• ゼブラフィッシュ最前部椎骨を司るHox遺伝子の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  公益信託 成茂動物科学振興基金, 2021年10月
  川村哲規
• マイクロCTスキャンを用いた脊椎動物の体幹部形成機構の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所, 共同研究 (A), 2019年04月 - 2021年03月
  川村哲規, 研究代表者
  論文ID：30059067
• ChIP-Injection法：生体内活性を指標としたエンハンサー同定法の確立　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 基盤研究(C), 2014年04月 - 2018年03月
  川村 哲規, 埼玉大学, 研究代表者
  配分額（総額）：5070000, 配分額（直接経費）：3900000, 配分額（間接経費）：1170000
  本研究ではゼブラフィッシュ胚を用いて、生体内活性を指標としたエンハンサー同定法を確立した。胚から尾芽を切断し、抗H3K27Ac抗体によるChIP法により得たDNA断片をEGFPリポーターに挿入したエンハンサー・ライブラリを作製した。EGFPリポーターをゼブラフィッシュの受精卵へ導入し、領域特異的なEGFP蛍光を示すエンハンサーの探索を行った結果、導入した108個のうち39個において、尾芽、体節、脊索などでエンハンサー活性が観察された。4つのエンハンサーについて組換え魚を作製し、スクリーニング時と同様の活性を確認した。さらに、エンハンサーのゲノム位置を明らかにし、ターゲット候補遺伝子を同定した。
  課題番号：26430182
  論文ID：30059068, 講演・口頭発表等ID：30059645
• 脳原基の領域化と神経分化を統合的に制御する遺伝子ネットワークの解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 基盤研究(C), 2014年04月 - 2017年03月
  弥益 恭; 川村 哲規, 埼玉大学, 研究分担者
  配分額（総額）：5070000, 配分額（直接経費）：3900000, 配分額（間接経費）：1170000
  本研究では、ゼブラフィッシュをモデルとし、脳原基領域化とニューロン分化の統合的理解をめざした。まず、脳領域化遺伝子であるpou2とgbx2の発現が神経前駆領域と密接に関係すること、これらの遺伝子が多様な神経発生遺伝子の発現制御に関わることを示した。さらに、pou2の機能阻害胚で発現が変動する遺伝子を網羅的に検討し、pou2が多様な神経発生遺伝子を制御することを示した。一方、pou2及びbHLH-Oの転写制御を培養細胞系で解析し、神経発生遺伝子間の相互作用を明らかにした。pou2については尾芽多能性幹細胞からの神経分化に関与することも示した。以上から神経発生の統合的制御機構の存在が示された。
  課題番号：26440114
• 小型魚モデルの利点を駆使した脳形成オーガナイザーの形成制御機構の解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 基盤研究(C), 2011年 - 2013年
  弥益 恭; 川村 哲規, 埼玉大学, 研究分担者
  配分額（総額）：5200000, 配分額（直接経費）：4000000, 配分額（間接経費）：1200000
  ゼブラフィッシュを用いて脊椎動物脳形成制御機構の研究を行った。まず、峡部形成遺伝子gbx2とpou2について機能の詳細を明らかとし、いずれもが神経分化に関与することを示唆した。また、神経板前端形成遺伝子emx3、峡部形成を制御するpax2aとpou2について、転写制御機構の詳細を明らかとした。一方、多様な発生異常を示す変異体kanazutsi 変異体について、神経堤及び体節の形成異常が起きること、原因がglobin family遺伝子の変異であることを示した。さらに、ゼブラフィッシュでの発生遺伝学研究において強力な新規研究技術であるGAL4/UAS系とTALEN法の導入に成功した。
  課題番号：23570247
• 脊椎動物の体幹部に前後軸の特異性をもたらす分子機構の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 若手研究(B), 若手研究(B), 2010年 - 2012年
  川村 哲規, 埼玉大学, 研究代表者
  配分額（総額）：4290000, 配分額（直接経費）：3300000, 配分額（間接経費）：990000
  脊椎動物の体幹部は、発生初期に前後軸に沿って繰り返し構造である体節が形成され、その後特異性が確立される。脊椎動物の胚発生において、Hox遺伝子群が前後軸に沿った特異性の決定において中心的な役割を果たすことが知られているが、この秩序だった発現パターンの形成機構に関しては殆ど分かっていない。本研究では、ゼブラフィッシュの突然変異体に着目し、その原因遺伝子の探索を行い、原因遺伝子の候補を絞り込んだ。さらに、前後軸に沿った繰り返し構造を示す体節の形成過程に重要な役割を担うhairy相同遺伝子に着目し、その遺伝子発現を制御するエンハンサー領域を探索した結果、hairy相同遺伝子座の下流領域に内在の発現領域に発現誘導活性をもつDNA領域を同定した。現在、この配列についてさらなる解析を進めている。
  課題番号：22770208
• ゼブラフィッシュを用いた細胞移動の制御機構の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  財団法人 上原記念生命科学財団, 研究奨励金, 2010年04月 - 2011年03月
  研究代表者
• 脊椎動物胚の脳原基部域化を支配するシグナルセンターの形成制御機構　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 基盤研究(C), 2008年 - 2010年
  弥益 恭; 川村 哲規, 埼玉大学
  配分額（総額）：4810000, 配分額（直接経費）：3700000, 配分額（間接経費）：1110000
  脳形成シグナルセンターである前方神経境界(ANB)と中脳後脳境界(MHB)の形成及び誘導機能に関わる調節遺伝子のエンハンサーをゼブラフィッシュにおいて同定、その制御機構を結合因子解析とレポーター解析等により検討した。またMHB形成におけるpou2遺伝子の機能について熱誘導性抑制型Pou2 を用いて解析し、pou2の働く時期と標的遺伝子を示した。並行して新規脳形成異常変異体の表現型解析と原因遺伝子の特定を進めた。
  課題番号：20570197
• 組織構造の反復性を生み出す分子ネットワーク　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(S), 基盤研究(S), 2006年 - 2010年
  高田 慎治; 越田 澄人; 大久保 直; 矢部 泰二郎; 赤沼 啓志; 川村 哲規; 高田 律子; 内海 秀子; 陳 秋紅; 高橋 潤; 津国 浩之
  配分額（総額）：111020000, 配分額（直接経費）：85400000, 配分額（間接経費）：25620000
  脊椎動物の反復構造が形成される仕組みを理解するため、順・逆両方の遺伝学的方法により体節の分節化に必須な遺伝子を多数同定した。その一つであるRipply1はT-box型転写因子の機能を複数のメカニズムを介して抑制し、分節位置を規定する鍵因子として働くことが明らかになった。さらにRipplyとT-box転写因子の相互作用は咽頭弓の分節化にも関与しており、分節化機構には組織を超えた共通性があることが示された。
  課題番号：18107006
• 2重蛍光ゼブラフィッシュを用いたHox遺伝子群の発現異常を示す変異体の単離　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 若手研究(B), 若手研究(B), 2008年 - 2009年
  川村 哲規, 埼玉大学
  配分額（総額）：4290000, 配分額（直接経費）：3300000, 配分額（間接経費）：990000
  脊椎動物のからだには、肋骨や四肢などに代表されるように前後軸に沿った特徴的な形態がみられる。このような前後軸の位置による形態の違いは、発生過程において確立される特異性によってもたらされ、ショウジョウバエの遺伝学的解析を端尾とした研究から、Hox 遺伝子群がこの過程において中心的な役割を果たすことが知られている。ショウジョウバエおよび脊椎動物におけるHox遺伝子群がこのようなパターンを形成し前後軸に沿ったアイデンティティーを決めていることはこれまでの多くの研究結果から支持されているが、脊椎動物の胚発生において、この秩序だった発現パターンがどのようにして形成されるのかに関しては殆ど分かっていない。本研究では、ゼブラフィッシュ胚を用いた突然変異体スクリーニングにより、Hox遺伝子の発現異常を示す変異体を単離することを第一の目標としている。エチレンニトロソウレアを用いて変異原処理した魚の第2 代のファミリー魚(F2)を用いて、突然変異体スクリーニングを行った。その結果、これまでに初期発生において異常を呈する変異体を少なくとも13 種類同定した。それらに対して、Hox 遺伝子の発現パターンを含めて、その表現型の詳細な解析を行っている。また、さらに多くの変異体を単離するため、引き続いて変異体スクリーニングを行っている。
  課題番号：20770172
• 脊椎動物の体節における領域形成と特異化をつかさどる分子機構　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費, 特別研究員奨励費, 2005年 - 2007年
  川村 哲規, 研究代表者
  配分額（総額）：3300000, 配分額（直接経費）：3300000
  脊椎動物の体幹部には、脊椎骨、肋骨、骨格筋や感覚神経節などの前後軸に沿った繰り返し構造がみられる。このような規則正しい反復性は、発生過程で一過的につくられる体節の分節性に由来する。体節は未分節中胚葉の最前方部分が、体幹部の伸長に伴って頭部側から尾部側へと周期的にくびれ切れ、ひとつずつ付け加わることで形成される。近年の研究の成果から、体節形成過程に関わる遺伝子群が数多く同定され、それら多くの遺伝子は未分節中胚葉で発現し、体節へと分化する際に発現が消失する、もしくは大きく発現レベルが切り替わることが共通してみられる。我々はこれまでにゼブラフィッシュを用いた解析から、未分節中胚葉から体節への分化過程で体節の形成過程に関わる遺伝子群の発現を抑制する機構が存在し、そこには転写共抑制因子Grouchoと結合する転写因子Ripply1が関与することを明らかにしてきた。しかしながら、Ripply1の分子機構に関して、殆ど不明のままであった。
  今年度は、Ripply1の転写因子としての作用メカニズムの一端を明らかにした。具体的には、Ripply1はT-box型転写因子であるTbx24と結合し、Grouchoをリクルートすることで、本来、転写活性化因子であるTbx24を転写抑制化因子に変換し分節プログラムを終結することを示した。これまでにRipply相同遺伝子は脊椎動物で3つずつ存在し、一方のT-box遺伝子は30種類近く報告されている。Ripply1-Tbx24間で判明した結果は他のRipply-Tbxの組み合わせでも同様にみられることから、Ripplyは一般的にT-box型転写因子にGrouchoを仲介するアダプター分子であると示唆される(Mol.Cell.Biol.,2008)。
  課題番号：05J04326
  論文ID：30059073

• CTスキャンで生物研究 筋肉・内臓も360度観察、レプリカ作成も　　　　　　　　　　　　　　　
  朝日新聞デジタル, 2024年12月11日, ［インターネットメディア］
• 生物の体内 CTで360度観察　　　　　　　　　　　　　　　
  朝日新聞（朝刊）教育・科学面, 2024年11月29日, ［新聞・雑誌］
• 魚にもあった !? 「首の骨」　　　　　　　　　　　　　　　
  朝日新聞（夕刊） ぶらっとラボ, 2024年08月26日, ［新聞・雑誌］
• Do fish have neck bones? Saitama University led group finds high probability of only one bone being present　　　　　　　　　　　　　　　
  Science Japan, 2024年08月21日, ［インターネットメディア］
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  Science JAPAN, 2024年08月13日, ［インターネットメディア］
• 魚のひれの形を決める「Hox遺伝子」とは 埼玉大などがゲノム編集技術で初めて解明　　　　　　　　　　　　　　　
  OSAKADAILY, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
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  モバゲー・ニュース, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
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  エキサイトニュース, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
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  BIGLOBEニュース, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
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  infoseekニュース, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
• 魚のひれの形を決める「Hox遺伝子」とは　　　　　　　　　　　　　　　
  au Webポータル, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
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  ライブドアニュース, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
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  gooニュース, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
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  中部経済新聞, 2024年08月04日, ［新聞・雑誌］
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  Yahoo!ニュース, 2024年08月04日, ［インターネットメディア］
• 哺乳類の首の骨は7個…では魚は何個？ 埼玉大などが解明　　　　　　　　　　　　　　　
  ライブドアニュース, 2024年08月03日, ［インターネットメディア］
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  infoseekニュース, 2024年08月03日, ［インターネットメディア］
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  gooニュース, 2024年08月03日, ［インターネットメディア］
• 哺乳類の首の骨は7個…では魚は何個？ 埼玉大などが解明　　　　　　　　　　　　　　　
  MSNニュース, 2024年08月03日, ［インターネットメディア］
• 哺乳類の首の骨は7個…では魚は何個？ 埼玉大などが解明　　　　　　　　　　　　　　　
  毎日新聞, 2024年08月03日, ［新聞・雑誌］
• 哺乳類の首の骨は7個…では魚は何個？ 埼玉大などが解明　　　　　　　　　　　　　　　
  Yahooニュース, 2024年08月03日, ［インターネットメディア］
• 鱼类有颈骨（颈椎）吗？”埼玉大学等发现可能“有一块　　　　　　　　　　　　　　　
  客観日本（中国語）, 2024年07月30日, ［インターネットメディア］
• ひれの多様な「設計図」、埼玉大など発表　　　　　　　　　　　　　　　
  東京新聞, 2024年07月24日
• 魚に首の骨（頸椎）があるのか？ ―脊椎動物の共有形質「背骨」の進化を探る　　　　　　　　　　　　　　　
  科学新聞, 2024年07月19日, ［新聞・雑誌］
• ひれの多様な「設計図」、埼玉大など発表　　　　　　　　　　　　　　　
  北陸中日新聞, 2024年07月16日, ［新聞・雑誌］
• ひれの多様な「設計図」、埼玉大など発表　　　　　　　　　　　　　　　
  下野新聞, 2024年07月15日, ［新聞・雑誌］
• 魚に首の骨はあるのか？意外な結果が判明　　　　　　　　　　　　　　　
  ニフティニュース, 2024年07月12日, ［インターネットメディア］
• 魚のひれ「設計図」解明、埼玉大などが遺伝子研究　　　　　　　　　　　　　　　
  毎日新聞, 2024年07月10日, ［新聞・雑誌］
• 魚に首の骨は存在するのか？1つだけある可能性 脊椎動物は陸で首を発達 埼玉大など　　　　　　　　　　　　　　　
  文教速報デジタル, 2024年07月09日, ［インターネットメディア］
• 魚に首の骨（頸椎）があるのか？ ―脊椎動物の共有形質「背骨」の進化を探る　　　　　　　　　　　　　　　
  テック・アイ技術情報研究所, 2024年07月09日, ［インターネットメディア］
• 魚の頸椎の調査から脊椎動物の「背骨」の進化を探る―埼玉大など　　　　　　　　　　　　　　　
  マイナビニュース, 2024年07月09日, ［インターネットメディア］
• 魚のひれ決める遺伝子 埼玉大・宇都宮大が解明　　　　　　　　　　　　　　　
  四国新聞, 2024年07月08日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ決める遺伝子 埼玉大・宇都宮大が解明　　　　　　　　　　　　　　　
  愛媛新聞, 2024年07月08日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ決める遺伝子 埼玉大・宇都宮大が解明　　　　　　　　　　　　　　　
  神戸新聞, 2024年07月08日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ決める遺伝子 埼玉大・宇都宮大が解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本海新聞, 2024年07月08日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ決める遺伝子働き解明 埼玉・宇都宮グループ　　　　　　　　　　　　　　　
  茨城新聞, 2024年07月07日, ［新聞・雑誌］
• 魚の背ひれや尻びれ 形決める遺伝子解明 埼玉、宇都宮大グループ　　　　　　　　　　　　　　　
  埼玉新聞, 2024年07月07日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ設計の遺伝子 埼玉大・宇都宮大、機能を解明　　　　　　　　　　　　　　　
  沖縄タイムス, 2024年07月06日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ設計の遺伝子 埼玉大・宇都宮大、機能を解明　　　　　　　　　　　　　　　
  山陽新聞, 2024年07月06日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ決める遺伝子働き解明 埼玉・宇都宮グループ　　　　　　　　　　　　　　　
  千葉日報, 2024年07月06日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ設計の遺伝子 埼玉大・宇都宮大、機能を解明　　　　　　　　　　　　　　　
  信濃毎日新聞, 2024年07月06日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ設計の遺伝子 埼玉大・宇都宮大、機能を解明　　　　　　　　　　　　　　　
  東奥日報, 2024年07月06日, ［新聞・雑誌］
• 魚のひれ設計の遺伝子 埼玉大・宇都宮大、機能を解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本経済新聞, 2024年07月06日, ［新聞・雑誌］
• 魚のヒレ 形成位置を制御 埼玉大などHox遺伝子の仕組み解明 システム変更が多様性生み出す　　　　　　　　　　　　　　　
  科学新聞社, 2024年07月05日, ［新聞・雑誌］
• 「魚のヒレ」長かったり、短かったり!? 仕組みを解明 ヒレの多様性をもたらす単純なシステム・埼玉大学　　　　　　　　　　　　　　　
  アンドラ・学習ニュース, 2024年06月14日, ［インターネットメディア］
• 魚のヒレは長かったり、短かったり、はなぜ？　　　　　　　　　　　　　　　
  HOYUKAIニュース, 2024年06月14日, ［インターネットメディア］
• 魚のヒレの幅や長さはどのように決まるのか？ 観賞魚創造に貢献 埼玉大など　　　　　　　　　　　　　　　
  文教速報デジタル, 2024年06月14日, ［インターネットメディア］
• サイ・テクこらむ 知と技の発信「【575】魚から探る脊椎動物の進化」　　　　　　　　　　　　　　　
  埼玉新聞, 2024年06月05日, ［新聞・雑誌］
• サイ・テクこらむ 知と技の発信「【369】脊椎動物の規則的な体作り」　　　　　　　　　　　　　　　
  埼玉新聞, 2018年09月19日
• サイ・テクこらむ 知と技の発信「【130】脊椎動物の形を決める時計」　　　　　　　　　　　　　　　
  埼玉新聞, 2013年09月04日, ［新聞・雑誌］