業績情報

• Accumulation of Acyl Plastoquinol and Triacylglycerol in Six Cyanobacterial Species with Different Sets of Genes Encoding Type-2 Diacylglycerol Acyltransferase-like Proteins
  Riko Tanikawa; Haruna Sakaguchi; Toshiki Ishikawa; Yukako Hihara
  Plant and Cell Physiology, 2024年11月, ［査読有り］, ［責任著者］
  Abstract
  
  Recently, acyl plastoquinol (APQ) and plastoquinone-B (PQ-B), which are fatty acid esters of plastoquinol and plastoquinone-C respectively, have been identified as the major neutral lipids in cyanobacteria. In Synechocystis sp. PCC 6803, Slr2103 having homology with the eukaryotic enzyme for triacylglycerol (TAG) synthesis, diacylglycerol acyltransferase 2 (DGAT2), was identified as responsible for the synthesis of these plastoquinone-related lipids. On the other hand, TAG synthesis in cyanobacteria remains controversial due to the low accumulation level within cyanobacterial cells together with the high contamination level from the environment. In this study, to quantify more precisely and elucidate the relationship between the accumulation of neutral lipids and the presence or absence of DGAT2-like genes, plastoquinone-related lipids and TAG were analyzed directly from total lipids of six cyanobacterial species with different sets of genes encoding DGAT2-like proteins belonging to two distinct subclades. The results showed that the synthesis of these neutral lipids is highly dependent on clade A DGAT2-like proteins under the culture conditions used in this study, although accumulation level of TAG was quite low. In contrast to APQ highly abundant in saturated fatty acids, the fatty acid composition of TAG was species-specific and partly reflected the total lipid composition. Gloeobacter violaceus PCC 7421, which lacks a DGAT2-like gene, accumulated APQ with a high proportion of C18:0, suggesting APQ synthesis by an unidentified acyltransferase.
  Oxford University Press (OUP), 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcae137
  DOI ID：10.1093/pcp/pcae137, ISSN：0032-0781, eISSN：1471-9053
• Partner-switching components PmgA and Ssr1600 regulate high-light acclimation in Synechocystis sp. PCC 6803
  Riku Nakamura; Yuji Takahashi; Shogo Tachibana; Arisa Terada; Kakeru Suzuki; Kumika Kondo; Yuzuru Tozawa; Yukako Hihara
  Plant Physiology, 巻：196, 号：1, 開始ページ：621, 終了ページ：633, 2024年06月, ［査読有り］, ［責任著者］
  Abstract
  
  Photomixotrophic growth A (PmgA) is a pleiotropic regulator essential for growth under photomixotrophic and prolonged high-light (HL) conditions in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. The overall similarity with the antisigma factor of the bacterial partner-switching system indicates that PmgA exerts a regulatory function via phosphorylation of its target proteins. In this study, we performed an in vitro phosphorylation assay and protein–protein interaction analysis and found that PmgA interacts with 4 antisigma antagonist homologs, Ssr1600, Slr1856, Slr1859, and Slr1912, but specifically phosphorylates Ssr1600. Phenotypic analyses using the set of gene disruption and overexpression strains of pmgA and ssr1600 revealed that phosphorylation by PmgA is essential for the accumulation of Ssr1600 protein in vivo. The ssr1600-disrupted mutant showed similar phenotypes as those previously reported for the pmgA-disrupted mutant, namely, no obvious phenotype just after the shift to HL, but higher chlorophyll content, 5-aminolevulinic acid synthesis activity, and psaAB transcript levels than those in the wild type after 6 h. These findings indicate that the phosphorylated form of Ssr1600 works as the output of the partner-switching system to coordinately repress chlorophyll biosynthesis and accumulation of photosystem I during HL acclimation.
  Oxford University Press (OUP), 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/plphys/kiae323
  DOI ID：10.1093/plphys/kiae323, ISSN：0032-0889, eISSN：1532-2548
• CRISPRi knockdown of the cyabrB1 gene induces the divergently transcribed icfG and sll1783 operons related to carbon metabolism in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803.　　　　　　　　　　　　　　　
  Atsuko Hishida; Ryo Shirai; Akiyoshi Higo; Minenosuke Matsutani; Kaori Nimura-Matsune; Tomoko Takahashi; Satoru Watanabe; Shigeki Ehira; Yukako Hihara
  The Journal of general and applied microbiology, 2024年01月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国内誌］
  Most cyanobacterial genomes possess more than two copies of genes encoding cyAbrBs (cyanobacterial AbrB-like proteins) having an AbrB-like DNA-binding domain at their C-terminal region. Accumulating data suggest that a wide variety of metabolic and physiologic processes are regulated by cyAbrBs. In this study, we investigated the function of the essential gene cyabrB1 (sll0359) in Synechocystis sp. PCC 6803 by using CRISPR interference technology. The conditional knockdown of cyabrB1 caused increases of cyAbrB2 transcript and protein levels. However, the effect of cyabrB1 knockdown on global gene expression profile was quite limited compared to the previously reported profound effect of knockout of cyabrB2. Among 24 up-regulated genes, 16 genes were members of the divergently transcribed icfG and sll1783 operons related to carbon metabolism. The results of this and previous studies indicate the different contributions of two cyAbrBs to transcriptional regulation of genes related to carbon, hydrogen and nitrogen metabolism. Possession of a pair of cyAbrBs has been highly conserved during the course of evolution of the cyanobacterial phylum, suggesting physiological significance of transcriptional regulation attained by their interaction.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.2323/jgam.2024.01.001
  DOI ID：10.2323/jgam.2024.01.001, PubMed ID：38267064
• Acylated plastoquinone is a novel neutral lipid accumulated in cyanobacteria
  Toshiki Ishikawa; Shunya Takano; Riko Tanikawa; Takashi Fujihara; Kimie Atsuzawa; Yasuko Kaneko; Yukako Hihara
  PNAS Nexus, 2023年03月, ［査読有り］, ［責任著者］
  Abstract
  
  Although cyanobacteria do not possess bacterial triacylglycerol (TAG) synthesizing enzymes, accumulation of TAGs and/or lipid droplets has been repeatedly reported in a wide range of species. In most cases, identification of TAG has been based on the detection of the spot showing the mobility similar to the TAG standard in thin-layer chromatography of neutral lipids. In this study, we identified monoacyl plastoquinol (acyl PQH) as the predominant molecular species in the TAG-like spot from the unicellular Synechocystis sp. PCC 6803 (S.6803) as well as the filamentous Nostocales species, Nostoc punctiforme PCC 73102 and Anabaena sp. PCC 7120. In S.6803, the accumulation level of acyl PQH but not TAG was affected by deletion or overexpression of slr2103, indicating that acyl PQH is the physiological product of Slr2103 having homology with the eukaryotic diacylglycerol acyltransferase-2 (DGAT2). Electron microscopy revealed that cyanobacterial strains used in this study do not accumulate lipid droplet structures such as those observed in oleaginous microorganisms. Instead, they accumulate polyhydroxybutyrate (PHB) granules and/or aggregates of alkane, free C16 and C18 saturated fatty acids and low amounts of TAG in the cytoplasmic area, which can be detected by staining with a fluorescent dye specific to neutral lipids. Unlike these lipophilic materials, acyl PQH is exclusively localized in the membrane fraction. There must be DGAT2-like enzymatic activity esterifying de novo-synthesized C16 and C18 fatty acids to PQH2 in the thylakoid membranes.
  Oxford University Press (OUP), 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pnasnexus/pgad092
  DOI ID：10.1093/pnasnexus/pgad092, eISSN：2752-6542
• Dual Redox Regulation of the DNA-Binding Activity of the Response Regulator RpaB in the Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Naoki Kato; Kazuki Iwata; Taro Kadowaki; Kintake Sonoike; Yukako Hihara
  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 2022年06月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcac079
  DOI ID：10.1093/pcp/pcac079, ISSN：0032-0781, eISSN：1471-9053, Web of Science ID：WOS:000826597900001
• The NAD Kinase Slr0400 Functions as a Growth Repressor in Synechocystis sp. PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuuma Ishikawa; Cedric Cassan; Aikeranmu Kadeer; Koki Yuasa; Nozomu Sato; Kintake  Sonoike; Yasuko Kaneko; Atsuko Miyagi; Hiroko Takahashi; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi; Yoshitaka Nishiyama; Yukako Hihara; Yves Gibon; Maki Kawai-Yamada
  Plant and Cell Physiology, 巻：62, 号：4, 開始ページ：668, 終了ページ：677, 2021年09月, ［査読有り］
  
  NADP+, the phosphorylated form of nicotinamide adenine dinucleotide (NAD), plays an essential role in many cellular processes. NAD kinase (NADK), which is conserved in all living organisms, catalyzes the phosphorylation of NAD+ to NADP+. However, the physiological role of phosphorylation of NAD+ to NADP+ in the cyanobacterium Synechocystis remains unclear. In this study, we report that slr0400, an NADK-encoding gene in Synechocystis, functions as a growth repressor under light-activated heterotrophic growth conditions and light and dark cycle conditions in the presence of glucose. We show, via characterization of NAD(P)(H) content and enzyme activity, that NAD+ accumulation in slr0400-deficient mutant results in the unsuppressed activity of glycolysis and tricarboxylic acid (TCA) cycle enzymes. In determining whether Slr0400 functions as a typical NADK, we found that constitutive expression of slr0400 in an Arabidopsis nadk2-mutant background complements the pale-green phenotype. Moreover, to determine the physiological background behind the growth advantage of mutants lacking slr04000, we investigated the photobleaching phenotype of slr0400-deficient mutant under high-light conditions. Photosynthetic analysis found in the slr0400-deficient mutant resulted from malfunctions in the Photosystem II (PSII) photosynthetic machinery. Overall, our results suggest that NADP(H)/NAD(H) maintenance by slr0400 plays a significant role in modulating glycolysis and the TCA cycle to repress the growth rate and maintain the photosynthetic capacity.
  Oxford University Press (OUP), 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcab023
  DOI ID：10.1093/pcp/pcab023, ISSN：0032-0781, eISSN：1471-9053, PubMed ID：33210985, PubMed Central ID：PMC7781788
• シアノバクテリアの転写因子と物質生産　　　　　　　　　　　　　　　
  日原由香子
  生物工学会誌, 巻：99, 号：8, 開始ページ：416, 終了ページ：420, 2021年08月, ［査読有り］, ［招待有り］, ［責任著者］
• The NAD kinase Slr0400 functions as a growth repressor in Synechocystis sp. PCC 6803.　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuuma Ishikawa; Cedric Cassan; Aikeranmu Kadeer; Koki Yuasa; Nozomu Sato; Kintake Sonoike; Yasuko Kaneko; Atsuko Miyagi; Hiroko Takahashi; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi; Yoshitaka Nishiyama; Yukako Hihara; Yves Gibon; Maki Kawai-Yamada
  Plant & cell physiology, 2021年02月, ［査読有り］, ［国内誌］
  NADP+, the phosphorylated form of nicotinamide adenine dinucleotide (NAD), plays an essential role in many cellular processes. NAD kinase (NADK), which is conserved in all living organisms, catalyzes the phosphorylation of NAD+ to NADP+. However, the physiological role of phosphorylation of NAD+ to NADP+ in the cyanobacterium Synechocystis remains unclear. In this study, we report that slr0400, an NADK-encoding gene in Synechocystis, functions as a growth repressor under light-activated heterotrophic growth conditions and light and dark cycle conditions in the presence of glucose. We show, via characterization of NAD(P)(H) content and enzyme activity, that NAD+ accumulation in slr0400-deficient mutant results in unsuppressed activity of glycolysis and tricarboxylic acid (TCA) cycle enzymes. In determining whether Slr0400 functions as a typical NADK, we found that constitutive expression of slr0400 in an Arabidopsis nadk2-mutant background complements the pale-green phenotype. Moreover, to determine the physiological background behind the growth advantage of mutants lacking slr04000, we investigated the photobleaching phenotype of slr0400-deficient mutant under high-light conditions. Photosynthetic analysis found in the slr0400-deficient mutant resulted from malfunctions in the PSII photosynthetic machinery. Overall, our results suggest that NADP(H)/NAD(H) maintenance by slr0400 plays a significant role in modulating glycolysis and the TCA cycle to repress the growth rate and maintain photosynthetic capacity.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcab023
  DOI ID：10.1093/pcp/pcab023, PubMed ID：33560438
• The role of transcriptional repressor activity of LexA in salt-stress responses of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803
  Kosuke Takashima; Syota Nagao; Ayumi Kizawa; Takehiro Suzuki; Naoshi Dohmae; Yukako Hihara
  Scientific Reports, 巻：10, 号：1, 2020年12月, ［査読有り］, ［責任著者］
  
  Different from typical LexA repressors in heterotrophic bacteria exerting SOS response by auto-cleavage, cyanobacterial LexAs, especially that of Synechocystis sp. PCC 6803 (S.6803), have been suggested be involved in regulation of a number of genes related to various cellular processes, rather than the typical SOS regulon. When and how cyanobacterial LexAs are triggered to regulate its target genes have remained unknown. In this study, we found the profound repressing effect of LexA on salt-stress inducible genes in S.6803. The repressing activity of LexA was likely to persist during salt stress and the salt response of these genes was mainly achieved by other regulators than LexA, suggesting that the physiological role of LexA is fine-tuning of gene expression in response to environmental changes. Although the amount and oligomeric state of LexA were unchanged upon salt stress, two-dimensional electrophoresis and liquid chromatography-tandem mass spectrometry analyses detected a change in posttranslational modification in a small fraction of LexA molecules, possibly dephosphorylation of Ser¹⁷³, after 30 min upon the upshift in salt concentration. Activity of LexA in S.6803 may be under gradual control by posttranslational modification to fine-tune gene expression, which is contrasted with the digital switching-off regulation by auto-cleavage in heterotrophic bacteria.
  Springer Science and Business Media LLC, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1038/s41598-020-74534-7
  DOI ID：10.1038/s41598-020-74534-7, eISSN：2045-2322
• Quantitative and Qualitative Analyses of Triacylglycerol Production in the Wild-Type Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 and the Strain Expressing AtfA from Acinetobacter baylyi ADP1.　　　　　　　　　　　　　　　
  Motoki Tanaka; Toshiki Ishikawa; So Tamura; Yujiro Saito; Maki Kawai-Yamada; Yukako Hihara
  Plant & cell physiology, 巻：61, 号：9, 開始ページ：1537, 終了ページ：1547, 2020年09月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国内誌］
  Although cyanobacteria do not possess wax ester synthase/acyl-CoA:diacylglycerol acyltransferase (WS/DGAT), the bacterial enzyme for triacylglycerol (TAG) production, there have been several studies reporting the accumulation of TAG-like compounds in cyanobacteria. In this study, we aimed to evaluate TAG productivity of the ΔrecJ::atfA strain of Synechocystis sp. PCC 6803 generated by inserting atfA encoding WS/DGAT from Acinetobacter baylyi ADP1 into recJ (sll1354), together with the wild type (WT) and the gene-disrupted strain of slr2103 having homology with eukaryotic DGAT2 gene family (Δ2103). Thin-layer chromatography (TLC) of neutral lipids or isolation of the neutral lipid-enriched fraction followed by gas chromatography or liquid chromatography-tandem mass spectrometry was employed for analyses. The ΔrecJ::atfA strain accumulated 0.508 nmol ml-1OD730-1 of TAG after a week of incubation at 100 μmol photons m-2 s-1. The saturated fatty acids C16:0 and C18:0 accounted for about 50% and 20% of the TAG fatty acids, respectively, suggesting that de novo-synthesized fatty acids were preferentially incorporated into TAG molecules. When the neutral lipid profile of the lipid extracts was examined by TLC, a spot located in a slightly lower position compared with the TAG standard was detected in WT but not in the Δ2103 strain. TAG accumulation levels of both strains was only 0.01-0.03 nmol ml-1OD730-1, but the fatty acid composition was substantially different from that of the background. These results suggest that trace amounts of TAG can be produced in Synechocystis cells by enzymes other than Slr2103, and major constituents of the TAG-like spot are unknown lipid species produced by Slr2103.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcaa069
  DOI ID：10.1093/pcp/pcaa069, PubMed ID：32433767
• Light-inducible expression of translation factor EF-Tu during acclimation to strong light enhances the repair of photosystem II.　　　　　　　　　　　　　　　
  Jimbo H; Izuhara T; Hihara Y; Hisabori T; Nishiyama Y
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 巻：116, 号：42, 開始ページ：21268, 終了ページ：21273, 2019年10月, ［査読有り］
  DOI：https://doi.org/10.1073/pnas.1909520116
  DOI ID：10.1073/pnas.1909520116, ISSN：0027-8424, PubMed ID：31570574
• cyAbrB Transcriptional Regulators as Safety Devices To Inhibit Heterocyst Differentiation in Anabaena sp. Strain PCC 7120.　　　　　　　　　　　　　　　
  Higo A; Nishiyama E; Nakamura K; Hihara Y; Ehira S
  Journal of bacteriology, 巻：201, 号：17, 2019年09月, ［査読有り］
  DOI：https://doi.org/10.1128/JB.00244-19
  DOI ID：10.1128/JB.00244-19, ISSN：0021-9193, PubMed ID：31085690
• Biocomputational Analyses and Experimental Validation Identify the Regulon Controlled by the Redox-Responsive Transcription Factor RpaB　　　　　　　　　　　　　　　
  Matthias Riediger; Taro Kadowaki; Ryuta Nagayama; Jens Georg; Yukako Hihara; Wolfgang R. Hess
  iScience, 巻：15, 開始ページ：316, 終了ページ：331, 2019年05月, ［査読有り］, ［責任著者］
  Elsevier BV, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.isci.2019.04.033
  DOI ID：10.1016/j.isci.2019.04.033, ISSN：2589-0042
• One of the NAD kinases, sll1415, is required for the glucose metabolism of Synechocystis sp. PCC 6803.　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuuma Ishikawa; Atsuko Miyagi; Toshiki Ishikawa; Minoru Nagano; Masatoshi Yamaguchi; Yukako Hihara; Yasuko Kaneko; Maki Kawai-Yamada
  the Plant Journal, 巻：98, 号：4, 開始ページ：654, 終了ページ：666, 2019年05月, ［査読有り］, ［国際誌］
  Pyridine nucleotides (NAD(P)(H)) are electron carriers that are the driving forces in various metabolic pathways. Phosphorylation of NAD(H) to NADP(H) is performed by the enzyme NAD kinase (NADK). Synechocystis sp. PCC 6803 harbors two genes (sll1415 and slr0400) that encode proteins with NADK homology. When genetic mutants for sll1415 and slr0400 (Δ1415 and Δ0400, respectively) were cultured under photoheterotrophic growth conditions only the Δ1415 cells showed a growth defect. In wild-type cells, the sll1415 transcript accumulated after the cells were transferred to photoheterotrophic conditions. Furthermore, NAD(P)(H) measurements demonstrated that a dynamic metabolic conversion was implemented during the adaptation from photoautotrophic to photoheterotrophic conditions. Electron microscopy observation and biochemistry quantification demonstrated the accumulation of glycogen in the Δ1415 cells under photoheterotrophic conditions at 96 h. Quantitative real-time reverse transcription PCR (qRT-PCR) demonstrated the accumulation of mRNAs that encoded glycogen biosynthesis-related enzymes in photoheterotrophic Δ1415 cells. At 96 h, enzyme activity measurement in the photoheterotrophic Δ1415 cells demonstrated that the activities of glucose-6-phosphate dehydrogenase and 6-phosphogluconate dehydrogenase were decreased, but the activities of glucose dehydrogenase were increased. Furthermore, metabolomics analysis demonstrated that the Δ1415 cells showed increased glucose-6-phosphate and 6-phosphogluconate content at 96 h. Therefore, sll1415 has a significant function in the oxidative pentose phosphate (OPP) pathway for catabolism of glucose under photoheterotrophic conditions. Additionally, it is presumed that the slr0400 had a different role in glucose catabolism during growth. These results suggest that the two Synechocystis sp. PCC 6803 NADKs (Sll1415 and Slr0400) have distinct functions in photoheterotrophic cyanobacterial metabolism.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1111/tpj.14262
  DOI ID：10.1111/tpj.14262, PubMed ID：30693583
• Interaction of the GntR-family transcription factor Sll1961 with thioredoxin in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803.　　　　　　　　　　　　　　　
  Junichi Kujirai; Sato Nanba; Taro Kadowaki; Yoshiki Oka; Yoshitaka Nishiyama; Yuuki Hayashi; Munehito Arai; Yukako Hihara
  Scientific reports, 巻：8, 号：1, 開始ページ：6666, 終了ページ：6666, 2018年04月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際誌］
  Changes in the redox state of the photosynthetic electron transport chain act as a signal to trigger acclimation responses to environmental cues and thioredoxin has been suggested to work as a key factor connecting the redox change with transcriptional regulation in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. We screened for redox-dependent transcription factors interacting with thioredoxin M (TrxM) and isolated the GntR-type transcription factor Sll1961 previously reported to be involved in acclimation responses of the photosynthetic machinery. Biochemical analyses using recombinant Sll1961 proteins of wild type and mutants of three cysteine residues, C124, C229 and C307, revealed that an intramolecular disulfide bond is formed between C229 and C307 under oxidizing conditions and TrxM can reduce it by attacking C307. Sll1961 exists in a dimeric form of about 80 kDa both under reducing and oxidizing conditions. C124 can form an intermolecular disulfide bond but it is not essential for dimerization. Based on these observations, tertiary structure models of the Sll1961 homodimer and the Sll1961-TrxM complex were constructed.
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1038/s41598-018-25077-5
  DOI ID：10.1038/s41598-018-25077-5, PubMed ID：29703909, PubMed Central ID：PMC5923263
• Oxidation of translation factor EF-Tu inhibits the repair of photosystem II　　　　　　　　　　　　　　　
  Haruhiko Jimbo; Rayakorn Yutthanasirikul; Takanori Nagano; Toru Hisabori; Yukako Hihara; Yoshitaka Nishiyama
  Plant Physiology, 巻：176, 号：4, 開始ページ：2691, 終了ページ：2699, 2018年04月, ［査読有り］
  American Society of Plant Biologists, 英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1104/pp.18.00037
  DOI ID：10.1104/pp.18.00037, ISSN：1532-2548, SCOPUS ID：85045519528
• Effects of inactivation of the cyAbrB2 transcription factor together with glycogen synthesis on cellular metabolism and free fatty acid production in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Kodama Y; Kawahara A; Miyagi A; Ishikawa T; Kawai-Yamada M; Kaneko Y; Takimura Y; Hihara Y
  Biotechnology and Bioengineering, 巻：in press, 2018年, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1002/bit.26842
  DOI ID：10.1002/bit.26842
• From cyanobacteria and algae to land plants: The RpaB/Ycf27 regulatory network in transition　　　　　　　　　　　　　　　
  Riediger M; Hihara Y; Hess W.R
  Perspectives in Phycology, 巻：2018/0078, 2018年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1127/pip/2018/0078
  DOI ID：10.1127/pip/2018/0078
• Applying a riboregulator as a new chromosomal gene regulation tool for higher glycogen production in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Kinuko Ueno; Yuta Sakai; Chika Shono; Ippei Sakamoto; Kaori Tsukakoshi; Yukako Hihara; Koji Sode; Kazunori Ikebukuro
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 巻：101, 号：23-24, 開始ページ：8465, 終了ページ：8474, 2017年12月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1007/s00253-017-8570-4
  DOI ID：10.1007/s00253-017-8570-4, ISSN：0175-7598, eISSN：1432-0614, Web of Science ID：WOS:000415906900015
• The LexA transcription factor regulates fatty acid biosynthetic genes in the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Ayumi Kizawa; Akihito Kawahara; Kosuke Takashima; Yasushi Takimura; Yoshitaka Nishiyama; Yukako Hihara
  PLANT JOURNAL, 巻：92, 号：2, 開始ページ：189, 終了ページ：198, 2017年10月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1111/tpj.13644
  DOI ID：10.1111/tpj.13644, ISSN：0960-7412, eISSN：1365-313X, Web of Science ID：WOS:000412680200004
• Acclimation of Oxygenic Photosynthesis to Iron Starvation Is Controlled by the sRNA IsaR1　　　　　　　　　　　　　　　
  Jens Georg; Gergana Kostova; Linda Vuorijoki; Verena Schoen; Taro Kadowaki; Tuomas Huokko; Desiree Baumgartner; Maximilian Mueller; Stephan Klaehn; Yagut Allahverdiyeva; Yukako Hihara; Matthias E. Futschik; Eva-Mari Aro; Wolfgang R. Hess
  CURRENT BIOLOGY, 巻：27, 号：10, 開始ページ：1425, 終了ページ：+, 2017年05月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.cub.2017.04.010
  DOI ID：10.1016/j.cub.2017.04.010, ISSN：0960-9822, eISSN：1879-0445, Web of Science ID：WOS:000401696100017
• 多彩な戦略で挑むシアノバクテリア由来の持続可能燃料生産　　　　　　　　　　　　　　　
  日原由香子; 朝山宗彦; 蘆田弘樹; 天尾豊; 新井宗仁; 粟井光一郎; 得平茂樹; 小山内崇; 鞆達也; 成川礼; 蓮沼誠久; 増川一
  化学と生物, 巻：55, 開始ページ：88, 終了ページ：97, 2017年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  日本語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1271/kagakutoseibutsu.55.88
  DOI ID：10.1271/kagakutoseibutsu.55.88
• Moderate Heat Stress Stimulates Repair of Photosystem II During Photoinhibition in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Mamoru Ueno; Penporn Sae-Tang; Yuri Kusama; Yukako Hihara; Mami Matsuda; Tomohisa Hasunuma; Yoshitaka Nishiyama
  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻：57, 号：11, 開始ページ：2417, 終了ページ：2426, 2016年11月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcw153
  DOI ID：10.1093/pcp/pcw153, ISSN：0032-0781, eISSN：1471-9053, Web of Science ID：WOS:000393158000016
• Metabolomic analysis of NAD kinase-deficient mutants of the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuuma Ishikawa; Atsuko Miyagi; Yuto Haishima; Toshiki Ishikawa; Minoru Nagano; Masatoshi Yamaguchi; Yukako Hihara; Maki Kawai-Yamada
  JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY, 巻：205, 開始ページ：105, 終了ページ：112, 2016年10月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.jplph.2016.09.002
  DOI ID：10.1016/j.jplph.2016.09.002, ISSN：0176-1617, eISSN：1618-1328, Web of Science ID：WOS:000385858600014
• Overexpressed Superoxide Dismutase and Catalase Act Synergistically to Protect the Repair of PSII during Photoinhibition in Synechococcus elongatus PCC 7942　　　　　　　　　　　　　　　
  Penporn Sae-Tang; Yukako Hihara; Isao Yumoto; Yoshitake Orikasa; Hidetoshi Okuyama; Yoshitaka Nishiyama
  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻：57, 号：9, 開始ページ：1899, 終了ページ：1907, 2016年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcw110
  DOI ID：10.1093/pcp/pcw110, ISSN：0032-0781, eISSN：1471-9053, Web of Science ID：WOS:000384717400009
• Intracellular Imaging of Qdots-Labeled DNA in Cyanobacteria　　　　　　　　　　　　　　　
  Alexandre Loukanov; Veselin Zhelyazkov; Yukako Hihara; Seiichiro Nakabayashi
  MICROSCOPY RESEARCH AND TECHNIQUE, 巻：79, 号：5, 開始ページ：447, 終了ページ：452, 2016年05月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1002/jemt.22651
  DOI ID：10.1002/jemt.22651, ISSN：1059-910X, eISSN：1097-0029, Web of Science ID：WOS:000374551100013
• A Feed-Forward Loop Consisting of the Response Regulator RpaB and the Small RNA PsrR1 Controls Light Acclimation of Photosystem I Gene Expression in the Cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Taro Kadowaki; Ryuta Nagayama; Jens Georg; Yoshitaka Nishiyama; Annegret Wilde; Wolfgang R. Hess; Yukako Hihara
  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻：57, 号：4, 開始ページ：813, 終了ページ：823, 2016年04月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcw028
  DOI ID：10.1093/pcp/pcw028, ISSN：0032-0781, eISSN：1471-9053, Web of Science ID：WOS:000376654100015
• Oxidation of a Cysteine Residue in Elongation Factor EF-Tu Reversibly Inhibits Translation in the Cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Rayakorn Yutthanasirikul; Takanori Nagano; Haruhiko Jimbo; Yukako Hihara; Takashi Kanamori; Takuya Ueda; Takamitsu Haruyama; Hiroki Konno; Keisuke Yoshida; Toru Hisabori; Yoshitaka Nishiyama
  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 巻：291, 号：11, 開始ページ：5860, 終了ページ：5870, 2016年03月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1074/jbc.M115.706424
  DOI ID：10.1074/jbc.M115.706424, ISSN：0021-9258, eISSN：1083-351X, Web of Science ID：WOS:000372551800032
• Transcriptional and posttranscriptional regulation of cyanobacterial photosynthesis　　　　　　　　　　　　　　　
  Annegret Wilde; Yukako Hihara
  BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS, 巻：1857, 号：3, 開始ページ：296, 終了ページ：308, 2016年03月, ［査読有り］, ［招待有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2015.11.002
  DOI ID：10.1016/j.bbabio.2015.11.002, ISSN：0005-2728, eISSN：0006-3002, Web of Science ID：WOS:000370895500012
• Free fatty acid production in the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803 is enhanced by deletion of the cyAbrB2 transcriptional regulator　　　　　　　　　　　　　　　
  Akihito Kawahara; Yusuke Sato; Yujiro Saito; Yasuko Kaneko; Yasushi Takimura; Hiroshi Hagihara; Yukako Hihara
  JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 巻：220, 開始ページ：1, 終了ページ：11, 2016年02月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2015.12.035
  DOI ID：10.1016/j.jbiotec.2015.12.035, ISSN：0168-1656, eISSN：1873-4863, Web of Science ID：WOS:000369371400001
• RNA-seq Profiling Reveals Novel Target Genes of LexA in the Cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Ayumi Kizawa; Akihito Kawahara; Yasushi Takimura; Yoshitaka Nishiyama; Yukako Hihara
  FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 巻：7, 開始ページ：193, 2016年02月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00193
  DOI ID：10.3389/fmicb.2016.00193, ISSN：1664-302X, Web of Science ID：WOS:000370563900001
• Analysis of spontaneous suppressor mutants from the photomixotrophically grown pmgA-disrupted mutant in the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Yoshiki Nishijima; Yu Kanesaki; Hirofumi Yoshikawa; Takako Ogawa; Kintake Sonoike; Yoshitaka Nishiyama; Yukako Hihara
  PHOTOSYNTHESIS RESEARCH, 巻：126, 号：2-3, 開始ページ：465, 終了ページ：475, 2015年12月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1007/s11120-015-0143-8
  DOI ID：10.1007/s11120-015-0143-8, ISSN：0166-8595, eISSN：1573-5079, Web of Science ID：WOS:000362006900025
• Zeaxanthin and Echinenone Protect the Repair of Photosystem II from Inhibition by Singlet Oxygen in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuri Kusama; Shuhei Inoue; Haruhiko Jimbo; Shinichi Takaichi; Kintake Sonoike; Yukako Hihara; Yoshitaka Nishiyama
  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻：56, 号：5, 開始ページ：906, 終了ページ：916, 2015年05月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcv018
  DOI ID：10.1093/pcp/pcv018, ISSN：0032-0781, eISSN：1471-9053, Web of Science ID：WOS:000355313900009
• Identification of OmpR-Family Response Regulators Interacting with Thioredoxin in the Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 (vol 19, e0119107, 2015)　　　　　　　　　　　　　　　
  Taro Kadowaki; Yoshitaka Nishiyama; Toru Hisabori; Yukako Hihara
  PLOS ONE, 巻：10, 号：4, 開始ページ：e0119107, 2015年04月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1371/journal.pone.0124571
  DOI ID：10.1371/journal.pone.0124571, ISSN：1932-6203, Web of Science ID：WOS:000352845100265
• Oxidation of translation factor EF-G transiently retards the translational elongation cycle in Escherichia coli　　　　　　　　　　　　　　　
  Nagano T; Yutthanasirikul R; Hihara Y; Hisabori T; Kanamori T; Takeuchi N; Ueda T; Nishiyama Y
  Journal of Biochemistry, 巻：158, 号：2, 開始ページ：165, 終了ページ：172, 2015年, ［査読有り］
  英語
  DOI ID：10.1093/jb/mvv026, ISSN：0021-924X, CiNii Articles ID：40020554133, CiNii Books ID：AA00694073, ORCID：25618254, Web of Science ID：WOS:000359684400008
• The effects of dark incubation on cellular metabolism of the wild type cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 and a mutant lacking the transcriptional regulator cyAbrB2　　　　　　　　　　　　　　　
  Masamitsu Hanai; Yusuke Sato; Atsuko Miyagi; Maki Kawai-Yamada; Kyoko Tanaka; Yasuko Kaneko; Yoshitaka Nishiyama; Yukako Hihara
  Life, 巻：4, 号：4, 開始ページ：770, 終了ページ：787, 2014年11月, ［査読有り］, ［責任著者］
  MDPI AG, 英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.3390/life4040770
  DOI ID：10.3390/life4040770, ISSN：2075-1729, SCOPUS ID：84938900212
• Deletion of the Transcriptional Regulator cyAbrB2 Deregulates Primary Carbon Metabolism in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuki Kaniya; Ayumi Kizawa; Atsuko Miyagi; Maki Kawai-Yamada; Hirofumi Uchimiya; Yasuko Kaneko; Yoshikata Nishiyama; Yukako Hihara
  PLANT PHYSIOLOGY, 巻：162, 号：2, 開始ページ：1153, 終了ページ：1163, 2013年06月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1104/pp.113.218784
  DOI ID：10.1104/pp.113.218784, ISSN：0032-0889, Web of Science ID：WOS:000319819900047
• Acclimation to high-light conditions in cyanobacteria: from gene expression to physiological responses　　　　　　　　　　　　　　　
  Masayuki Muramatsu; Yukako Hihara
  JOURNAL OF PLANT RESEARCH, 巻：125, 号：1, 開始ページ：11, 終了ページ：39, 2012年01月, ［査読有り］, ［招待有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1007/s10265-011-0454-6
  DOI ID：10.1007/s10265-011-0454-6, ISSN：0918-9440, Web of Science ID：WOS:000298056000002
• Physiological Roles of the cyAbrB Transcriptional Regulator Pair Sll0822 and Sll0359 in Synechocystis sp strain PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Yuki Yamauchi; Yuki Kaniya; Yasuko Kaneko; Yukako Hihara
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 巻：193, 号：15, 開始ページ：3702, 終了ページ：3709, 2011年08月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1128/JB.00284-11
  DOI ID：10.1128/JB.00284-11, ISSN：0021-9193, Web of Science ID：WOS:000292698100002
• Cross-talk between photomixotrophic growth and CO2-concentrating mechanism in Synechocystis sp strain PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Maya Haimovich-Dayan; Shira Kahlon; Yukako Hihara; Martin Hagemann; Teruo Ogawa; Itzhak Ohad; Judy Lieman-Hurwitz; Aaron Kaplan
  ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 巻：13, 号：7, 開始ページ：1767, 終了ページ：1777, 2011年07月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2011.02481.x
  DOI ID：10.1111/j.1462-2920.2011.02481.x, ISSN：1462-2912, Web of Science ID：WOS:000292308500008
• The PedR transcriptional regulator interacts with thioredoxin to connect photosynthesis with gene expression in cyanobacteria　　　　　　　　　　　　　　　
  Mayumi Horiuchi; Kinu Nakamura; Kouji Kojima; Yoshitaka Nishiyama; Wakako Hatakeyama; Toru Hisabori; Yukako Hihara
  BIOCHEMICAL JOURNAL, 巻：431, 開始ページ：135, 終了ページ：140, 2010年10月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1042/BJ20100789
  DOI ID：10.1042/BJ20100789, ISSN：0264-6021, Web of Science ID：WOS:000282852800014
• Role of Multiple HLR1 Sequences in the Regulation of the Dual Promoters of the psaAB Genes in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Tomoko Takahashi; Nanako Nakai; Masayuki Muramatsu; Yukako Hihara
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 巻：192, 号：15, 開始ページ：4031, 終了ページ：4036, 2010年08月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1128/JB.00444-10
  DOI ID：10.1128/JB.00444-10, ISSN：0021-9193, Web of Science ID：WOS:000279782000021
• A cyanobacterial AbrB-like protein affects the apparent photosynthetic affinity for CO2 by modulating low-CO2-induced gene expression　　　　　　　　　　　　　　　
  Judy Lieman-Hurwitz; Maya Haimovich; Gali Shalev-Malul; Ai Ishii; Yukako Hihara; Ariel Gaathon; Mario Lebendiker; Aaron Kaplan
  ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 巻：11, 号：4, 開始ページ：927, 終了ページ：936, 2009年04月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2008.01818.x
  DOI ID：10.1111/j.1462-2920.2008.01818.x, ISSN：1462-2912, Web of Science ID：WOS:000264881300018
• Mechanism of downregulation of photosystem I content under high-light conditions in the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Masayuki Muramatsu; Kintake Sonoike; Yukako Hihara
  MICROBIOLOGY-SGM, 巻：155, 開始ページ：989, 終了ページ：996, 2009年03月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1099/mic.0.024018-0
  DOI ID：10.1099/mic.0.024018-0, ISSN：1350-0872, Web of Science ID：WOS:000264515100034
• The Response Regulator RpaB Binds to the Upstream Element of Photosystem I Genes To Work for Positive Regulation under Low-Light Conditions in Synechocystis sp Strain PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Yurie Seino; Tomoko Takahashi; Yukako Hihara
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 巻：191, 号：5, 開始ページ：1581, 終了ページ：1586, 2009年03月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1128/JB.01588-08
  DOI ID：10.1128/JB.01588-08, ISSN：0021-9193, Web of Science ID：WOS:000263503600024
• An AbrB-like transcriptional regulator, Sll0822, is essential for the activation of nitrogen-regulated genes in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Ai Ishii; Yukako Hihara
  PLANT PHYSIOLOGY, 巻：148, 号：1, 開始ページ：660, 終了ページ：670, 2008年09月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1104/pp.108.123505
  DOI ID：10.1104/pp.108.123505, ISSN：0032-0889, eISSN：1532-2548, Web of Science ID：WOS:000258947600055
• Difference in metabolite levels between photoautotrophic and photomixotrophic cultures of Synechocystis sp PCC 6803 examined by capillary electrophoresis electrospray ionization mass spectrometry　　　　　　　　　　　　　　　
  Hideyuki Takahashi; Hirofumi Uchimiya; Yukako Hihara
  JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, 巻：59, 号：11, 開始ページ：3009, 終了ページ：3018, 2008年08月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/jxb/ern157
  DOI ID：10.1093/jxb/ern157, ISSN：0022-0957, Web of Science ID：WOS:000258330200009
• Coordinated high-light response of genes encoding subunits of photosystem I is achieved by AT-rich upstream sequences in the cyanobacterium Synechocystis sp strain PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Masayuki Muramatsu; Yukako Hihara
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 巻：189, 号：7, 開始ページ：2750, 終了ページ：2758, 2007年04月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1128/JB.01903-06
  DOI ID：10.1128/JB.01903-06, ISSN：0021-9193, Web of Science ID：WOS:000245842000020
• A network of genes regulated by light in cyanobacteria　　　　　　　　　　　　　　　
  Rajeev Aurora; Yukako Hihara; Abhay K. Singh; Himadri B. Pakrasi
  OMICS A Journal of Integrative Biology, 巻：11, 号：2, 開始ページ：166, 終了ページ：185, 2007年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1089/omi.2007.4323
  DOI ID：10.1089/omi.2007.4323, ISSN：1536-2310, PubMed ID：17594236, SCOPUS ID：34347352108
• Photon flux density-dependent gene expression in Synechocystis sp PCC 6803 is regulated by a small, redox-responsive, LuxR-type regulator　　　　　　　　　　　　　　　
  Kinu Nakamura; Yukako Hihara
  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 巻：281, 号：48, 開始ページ：36758, 終了ページ：36766, 2006年12月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1074/jbc.M606797200
  DOI ID：10.1074/jbc.M606797200, ISSN：0021-9258, Web of Science ID：WOS:000242220800033
• Characterization of high-light-responsive promoters of the psaAB genes in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Masayuki Muramatsu; Yukako Hihara
  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻：47, 号：7, 開始ページ：878, 終了ページ：890, 2006年07月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pcj060
  DOI ID：10.1093/pcp/pcj060, ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000239430500007
• A putative sensor kinase, Hik31, is involved in the response of Synechocystis sp strain PCC 6803 to the presence of glucose　　　　　　　　　　　　　　　
  S Kahlon; K Beeri; H Ohkawa; Y Hihara; O Murik; Suzuki, I; T Ogawa; A Kaplan
  MICROBIOLOGY-SGM, 巻：152, 開始ページ：647, 終了ページ：655, 2006年03月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1099/mic.0.28510-0
  DOI ID：10.1099/mic.0.28510-0, ISSN：1350-0872, Web of Science ID：WOS:000236321700008
• The mutant of sll1961, which encodes a putative transcriptional regulator, has a defect in regulation of photosystem stoichiometry in the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  T Fujimori; M Higuchi; H Sato; H Aiba; M Muramatsu; Y Hihara; K Sonoike
  PLANT PHYSIOLOGY, 巻：139, 号：1, 開始ページ：408, 終了ページ：416, 2005年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1104/pp.105.064782
  DOI ID：10.1104/pp.105.064782, ISSN：0032-0889, Web of Science ID：WOS:000231765300038
• PsaK2 subunit in photosystem I is involved in state transition under high light condition in the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  T Fujimori; Y Hihara; K Sonoike
  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 巻：280, 号：23, 開始ページ：22191, 終了ページ：22197, 2005年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1074/jbc.M500369200
  DOI ID：10.1074/jbc.M500369200, ISSN：0021-9258, Web of Science ID：WOS:000229557900064
• A cyanobacterial gene encoding an ortholog of Pirin is induced under stress conditions　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; M Muramatsu; K Nakamura; K Sonoike
  FEBS LETTERS, 巻：574, 号：1-3, 開始ページ：101, 終了ページ：105, 2004年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1016/j.febslet.2004.06.102
  DOI ID：10.1016/j.febslet.2004.06.102, ISSN：0014-5793, Web of Science ID：WOS:000224041600018
• DNA microarray analysis of redox-responsive genes in the genome of the cyanobacterium Synechocystis sp strain PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; K Sonoike; M Kanehisa; M Ikeuchi
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 巻：185, 号：5, 開始ページ：1719, 終了ページ：1725, 2003年03月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1128/JB.158.5.1719-1725.2003
  DOI ID：10.1128/JB.158.5.1719-1725.2003, ISSN：0021-9193, Web of Science ID：WOS:000181151200029
• Transcriptional regulation of genes encoding subunits of photosystem I during acclimation to high-light conditions in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  M Muramatsu; Y Hihara
  PLANTA, 巻：216, 号：3, 開始ページ：446, 終了ページ：453, 2003年01月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1007/s00425-002-0859-5
  DOI ID：10.1007/s00425-002-0859-5, ISSN：0032-0935, Web of Science ID：WOS:000180820800011
• Physiological significance of the regulation of photosystem stoichiometry upon high light acclimation of Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  K Sonoike; Y Hihara; M Ikeuchi
  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻：42, 号：4, 開始ページ：379, 終了ページ：384, 2001年04月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1093/pcp/pce046
  DOI ID：10.1093/pcp/pce046, ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000168210000005
• DNA microarray analysis of cyanobacterial gene expression during acclimation to high light　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; A Kamei; M Kanehisa; A Kaplan; M Ikeuchi
  PLANT CELL, 巻：13, 号：4, 開始ページ：793, 終了ページ：806, 2001年04月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1105/tpc.13.4.793
  DOI ID：10.1105/tpc.13.4.793, ISSN：1040-4651, Web of Science ID：WOS:000168219000007
• A novel gene, pmgA, specifically regulates photosystem stoichiometry in the cyanobacterium Synechocystis species PCC 6803 in response to high light　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; K Sonoike; M Ikeuchi
  PLANT PHYSIOLOGY, 巻：117, 号：4, 開始ページ：1205, 終了ページ：1216, 1998年08月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1104/pp.117.4.1205
  DOI ID：10.1104/pp.117.4.1205, ISSN：0032-0889, Web of Science ID：WOS:000075485800010
• Toward the elucidation of physiological significance of pmgA-mediated high-light acclimation to adjust photosystem stoichiometry: Effects of the prolonged high-light treatment on pmgA mutants　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; M Ikeuchi
  PHOTOSYNTHESIS: MECHANISMS AND EFFECTS, VOLS I-V, 開始ページ：2929, 終了ページ：2932, 1998年, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（国際会議プロシーディングス）
  Web of Science ID：WOS:000085848500687
• Mutation in a novel gene required for photomixotrophic growth leads to enhanced photoautotrophic growth of Synechocystis sp. PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; M Ikeuchi
  PHOTOSYNTHESIS RESEARCH, 巻：53, 号：2-3, 開始ページ：243, 終了ページ：252, 1997年09月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1023/A:1005879905365
  DOI ID：10.1023/A:1005879905365, ISSN：0166-8595, Web of Science ID：WOS:000070979000016
• The mechanism of the degradation of psaB gene product, one of the photosynthetic reaction center subunits of Photosystem I, upon photoinhibition　　　　　　　　　　　　　　　
  K Sonoike; M Kamo; Y Hihara; T Hiyama; Enami, I
  PHOTOSYNTHESIS RESEARCH, 巻：53, 号：1, 開始ページ：55, 終了ページ：63, 1997年07月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1023/A:1005852330671
  DOI ID：10.1023/A:1005852330671, ISSN：0166-8595, Web of Science ID：WOS:A1997YD40800007
• Expressed sequence tags in developing anthers of rice (oryza sativa L.)　　　　　　　　　　　　　　　
  Yukako Hihara; Keiko Shoda; Qiang Liu; Chikage Hara; Masaaki Umeda; Kinya Toriyama; Hirofumi Uchimiya
  Plant Biotechnology, 巻：14, 号：1, 開始ページ：71, 終了ページ：75, 1997年, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  Japanese Society for Plant Cell and Molecular Biology, 英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.14.71
  DOI ID：10.5511/plantbiotechnology.14.71, ISSN：1347-6114, SCOPUS ID：0009785626
• Isolation and characterization of two cDNA clones for mRNAs that are abundantly expressed in immature anthers of rice (Oryza sativa L.)　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; C Hara; H Uchimiya
  PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 巻：30, 号：6, 開始ページ：1181, 終了ページ：1193, 1996年03月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1007/BF00019551
  DOI ID：10.1007/BF00019551, ISSN：0167-4412, Web of Science ID：WOS:A1996UX50400009
• NUCLEOTIDE-SEQUENCE OF A RICE ACIDIC RIBOSOMAL PHOSPHOPROTEIN P0 CDNA　　　　　　　　　　　　　　　
  Y HIHARA; M UMEDA; C HARA; K TORIYAMA; H UCHIMIYA
  PLANT PHYSIOLOGY, 巻：105, 号：2, 開始ページ：753, 終了ページ：754, 1994年06月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
  DOI：https://doi.org/10.1104/pp.105.2.753
  DOI ID：10.1104/pp.105.2.753, ISSN：0032-0889, Web of Science ID：WOS:A1994NR44300038

• CRISPRiを用いたシアノバクテリアSynechocystis sp.PCC6803のcyAbrB1転写因子の機能解析　　　　　　　　　　　　　　　
  菱田温子; 肥後明佳; 松谷峰之介; 荷村(松根)かおり; 渡辺智; 得平茂樹; 日原由香子
  日本植物生理学会年会(Web), 巻：62nd, 2021年
  J-Global ID：202102224598369645
• リボレギュレーターを用いたcyabrB2遺伝子の発現制御によるグリコーゲン高生産シアノバクテリアの構築　　　　　　　　　　　　　　　
  上野絹子; 酒井雄大; 生野千佳; 坂本一平; 上野絹子; 酒井雄大; 生野千佳; 坂本一平; 塚越かおり; 日原由香子; 早出広司; 池袋一典; 日原由香子; 早出広司; 池袋一典
  日本生物工学会大会講演要旨集, 巻：69th, 2017年
  J-Global ID：201702257403107900
• Transcriptional regulation by Sll1961 that modulates photosystem stoichiometry in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Mio Tamori; Tamaki Fujimori; Hiroshi Ozaki; Hanayo Sato; Yukako Hihara; Kintake Sonoike
  巻：48, 開始ページ：S96, 終了ページ：S96, 2007年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000245922700380
• The coordinated high-light response of genes encoding subunits of photosystem I is achieved by AT-rich upstream sequences in the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  Yukako Hihara; Masayuki Muramatsu
  巻：48, 開始ページ：S127, 終了ページ：S127, 2007年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000245922700502
• Functional Analysis of PmgA involved in high-light acclimation in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  MasMki Muramatsu; Kintake Sonoike; Yukako Hihara
  巻：48, 開始ページ：S177, 終了ページ：S177, 2007年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000245922701186
• Characterization of putative transcriptional regulators having an AbrB-type DNA binding domain in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  A Ishii; Y Hihara
  巻：47, 開始ページ：S87, 終了ページ：S87, 2006年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000236401400348
• The activity of chlorophyll a biosynthesis determines the amount of photosystem I complex under high-light conditions in a cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  M Muramatsu; K Sonoike; Y Hihara
  巻：47, 開始ページ：S87, 終了ページ：S87, 2006年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000236401400346
• The sensing mechanism of the redox state of photosynthetic electron transport chain by a small LuxR-type regulator, Ss10564, in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  K Nakamura; Y Hihara
  巻：47, 開始ページ：S87, 終了ページ：S87, 2006年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000236401400347
• The redox sensing mechanism of a small LuxR-type regulator, Ss10564, in a cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  K Nakamura; Y Hihara
  巻：46, 開始ページ：S42, 終了ページ：S42, 2005年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000228104100167
• Promoter analysis of genes encoding subunits of photosystem I in Synechocystis sp PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  M Muramatsu; Y Hihara
  巻：46, 開始ページ：S41, 終了ページ：S41, 2005年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000228104100164
• Transcriptional regulation of a novel stress-induced operon, pirAB, in a cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803.　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; M Muramatsu; K Nakamura; K Sonoike
  巻：45, 開始ページ：S129, 終了ページ：S129, 2004年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000220592700508
• PsaK2 subunit of Synechocystissp. PCC6803 is involved in the energy transfer from the phycobilisome to the photosystem I under high light condition　　　　　　　　　　　　　　　
  T Fujimori; K Sonoike; Y Hihara
  巻：43, 開始ページ：S170, 終了ページ：S170, 2002年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000174726400607
• Search for redox responsive genes in Synechocystis sp. PCC 6803 by using DNA microarrays　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; K Sonoike; M Kanehisa; M Ikeuchi
  巻：43, 開始ページ：S178, 終了ページ：S178, 2002年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000174726400632
• Regulation mechanism of the photosystem? Content during the acclimation to high light in Synechocystis sp. PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  M Muramatsu; Y Hihara
  巻：43, 開始ページ：S178, 終了ページ：S178, 2002年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0781, Web of Science ID：WOS:000174726400633
• DNA MICROARRAY ANALYSIS OF Symechocystis sp. PCC 6803 UNDER CONDITIONS OF PSII AND PSI LIGHT :　　　　　　　　　　　　　　　
  HIHARA Yukako; IKEUCHI Masahiko
  Plant and cell physiology, 巻：42, 開始ページ：s165, 2001年
  Japanese Society of Plant Physiologists, 英語
  ISSN：0032-0781, CiNii Articles ID：110003715790, CiNii Books ID：AA0077511X
• FUNCTIONAL ANALYSIS OF LEXA-LIKE GENE, sll 1626 IN Synechocystis sp. PCC 6803 USING DNA MICROARRAY :　　　　　　　　　　　　　　　
  KAMEI Ayako; HIHARA Yukako; GENG Xiao Xing; IKEUCHI Masahiko
  Plant and cell physiology, 巻：42, 開始ページ：s95, 2001年
  Japanese Society of Plant Physiologists, 英語
  ISSN：0032-0781, CiNii Articles ID：110003715513, CiNii Books ID：AA0077511X
• ANALYSIS OF HIGH LIGHT-INDUCED GENES IN CYANOBACTERIUM Synechocystis sp. PCC 6803 USING DNA MICROARRAY :　　　　　　　　　　　　　　　
  HIHARA Yukako; KAMEI Ayako; IKEUCHI Masahiko
  Plant and cell physiology, 巻：41, 開始ページ：s74, 2000年
  Japanese Society of Plant Physiologists, 英語
  ISSN：0032-0781, CiNii Articles ID：110003722207, CiNii Books ID：AA0077511X
• SCREENING OF GENES WHICH INTERACT WITH pmgA BY COMPLEMENTATION OF LIGHT/GLUCOSE SENSITIVITY　　　　　　　　　　　　　　　
  HIHARA Yukako; IKEUCHI Masahiko
  Plant and cell physiology, 巻：40, 開始ページ：s43, 終了ページ：s43, 1999年03月
  英語
  ISSN：0032-0781, CiNii Articles ID：10003757879, CiNii Books ID：AA0077511X
• PHYSIOLOGICAL SIGNIFICANCE OF PHOTOSYSTEM STOICHIOMETRY IN A CYANOBACTERIUM UPON LIGHT ACCLIMATION　　　　　　　　　　　　　　　
  SONOIKE Kintake; HIHARA Yukako; IKEUCHI Masahiko
  Plant and cell physiology, 巻：40, 開始ページ：s43, 終了ページ：s43, 1999年03月
  英語
  ISSN：0032-0781, CiNii Articles ID：10003757878, CiNii Books ID：AA0077511X
• PHYSIOLOGICAL ROLE AND GENE EXPRESSION OF A NOVEL GENE, pmgA, WHICH IS INVOLVED IN ACCLIMATION TO HIGH LIGHT IN A CYANOBACTERIUM Synechocystis sp. PCC 6803　　　　　　　　　　　　　　　
  HIHARA Yukako; SONOIKE Kintake; IKEUCHI Masahiko
  Plant and cell physiology, 巻：39, 開始ページ：S27, 終了ページ：S27, 1998年05月
  英語
  ISSN：0032-0781, CiNii Articles ID：10003751571, CiNii Books ID：AA0077511X
• A novel mutant phenotype of pmgA and its involvement in adaptation to high light by changing photosystem II photosystem I stoichiometry in Synechocystis sp. PCC 6803.　　　　　　　　　　　　　　　
  Y Hihara; M Ikeuchi
  巻：114, 号：3, 開始ページ：1035, 終了ページ：1035, 1997年07月
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0889, Web of Science ID：WOS:A1997XL11901067
• The mechanism of degradation of PsaB protein, a reaction center subunit of photosystem I, upon photoinhibition.　　　　　　　　　　　　　　　
  K Sonoike; M Kamo; Y Hihara; T Hiyama; Enami, I
  巻：114, 号：3, 開始ページ：159, 終了ページ：159, 1997年07月
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
  ISSN：0032-0889, Web of Science ID：WOS:A1997XL11900203

• Cyanobacteria biotechnology　　　　　　　　　　　　　　　
  Akihito Kawahara; Yukako Hihara, ［分担執筆］
  Wiley-VCH, 2021年07月
  英語, 総ページ数：xviii, 542 p.
  ISBN：9783527347148

• 制御系の進化から解き明かす始原的光合成超分子の環境適応原理　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 学術変革領域研究(A), 2023年04月01日 - 2028年03月31日
  日原 由香子; 広瀬 侑; 丸山 真一朗, 埼玉大学
  配分額（総額）：169780000, 配分額（直接経費）：130600000, 配分額（間接経費）：39180000
  課題番号：23H04962
• 光合成ユビキティ：あらゆる地球環境で光合成を可能とする超分子構造制御　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 学術変革領域研究(A), 2023年04月01日 - 2028年03月31日
  栗栖 源嗣; 斉藤 圭亮; 山本 大輔; 白井 剛; 坂本 亘; 日原 由香子; 広瀬 侑; 丸山 真一朗; 田中 亮一; 皆川 純; 吉田 啓亮; 桶川 友季, 大阪大学
  配分額（総額）：111280000, 配分額（直接経費）：85600000, 配分額（間接経費）：25680000
  課題番号：23H04957
• シアノバクテリアのパートナースイッチング制御系による環境応答機構の解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 2019年04月01日 - 2023年03月31日
  日原 由香子, 埼玉大学
  配分額（総額）：4290000, 配分額（直接経費）：3300000, 配分額（間接経費）：990000
  シアノバクテリア Synechocystis sp. PCC 6803 (S.6803)においては、パートナースイッチング制御系のアンチσ因子と相同性を持つPmgAタンパク質が、強光下や光混合栄養条件下での生存に必須である。本研究では、PmgAのリン酸化標的として、パートナースイッチング制御系のアンタゴニスト様タンパク質Ssr1600を同定したことから、「パートナースイッチング制御系はいかにして、シアノバクテリアの光合成や代謝を制御しているのか？」の解明を目指している。当該年度は、pmgAおよびssr1600を恒常的高発現プロモーターPtrcに接続し、ゲノム中のニュートラルサイトに導入することで過剰発現株を作製し、遺伝子破壊株、野生株とともに表現型解析を行った。pmgA過剰発現株では、ssr1600転写産物量は野生株と同レベルであるが、Ssr1600タンパク質は野生株の2倍ほど蓄積していたことから、pmgA破壊株でSsr1600が蓄積しないという観察結果と合わせ、PmgAがSsr1600量を制御することが強く示唆された。強光下での細胞当たりクロロフィル量は、いずれの株も6時間以内に半減するが、その後の再蓄積の速度が野生株に比べ、pmgA過剰発現株では遅れ、破壊株では速かった。一方、ssr1600の過剰発現・遺伝子破壊株ではクロロフィル量への影響は顕著には観察されなかった。同様に、強光下での光合成関連遺伝子転写産物量も、pmgA発現量の増減によって影響を受けるが、ssr1600の増減による影響は僅かであった。以上の結果から、PmgAは強光順化応答に重要な役割を担うが、Ssr1600との相互作用はその調節に必須ではない可能性が示唆された。今後、Ssr1600が強光順化応答に果たす役割についてさらに検討を続ける必要がある。
  課題番号：19K06717
• チオレドキシンを介した光合成電子伝達依存的な転写制御機構の解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 2015年04月01日 - 2019年03月31日
  日原 由香子, 埼玉大学
  配分額（総額）：4940000, 配分額（直接経費）：3800000, 配分額（間接経費）：1140000
  本研究では、シアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803において、調節タンパク質チオレドキシンとの相互作用が検出され、光合成活性に依存して働くと考えられる転写因子のうち、RpaBとSll1961について個別解析を行った。RpaBについては全ゲノムレベルで標的遺伝子を同定し、および光合成電子伝達鎖のレドックス状態がRpaBのDNA結合活性に及ぼす影響を明らかにした。Sll1961については、システイン残基のレドックス状態変化とチオレドキシンとの相互作用機構、およびRNA-seq解析結果を用いての標的遺伝子の同定に成功した。
  課題番号：15K07096
• 光合成電子伝達のセンシングによる転写制御機構の解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 2011年 - 2013年
  日原 由香子, 埼玉大学
  配分額（総額）：5330000, 配分額（直接経費）：4100000, 配分額（間接経費）：1230000
  光合成生物は、環境の変化を光合成電子伝達鎖のレドックス変化としてセンシングし、転写制御を行うことが知られている。しかし、その過程で働く転写制御因子に関する知見は極めて乏しい。そこで本研究では、光合成電子伝達鎖のレドックス状態を伝える調節タンパク質チオレドキシンと転写制御因子の相互作用を検出するスクリーニング系を開発し、この系を用いて、シアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803ゲノムから、チオレドキシンの標的となり得る転写制御因子５種を新たに同定することに成功した。
  課題番号：23570047
• シアノバクテリアの強光順化における転写制御機構の解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 若手研究(B), 2008年 - 2010年
  日原 由香子, 埼玉大学
  配分額（総額）：4160000, 配分額（直接経費）：3200000, 配分額（間接経費）：960000
  これまでに我々はシアノバクテリアSynechocystis sp.PCC6803において、光化学系I反応中心サブユニットをコードするpsaAB遺伝子のプロモーター解析を行ってきた。一般に、光化学系I遺伝子プロモーターは弱光下で活性化され、強光下で抑制されるが、psaAB遺伝子の2つのプロモーターP1とP2両方が、この応答パターンを示すことが明らかになった。本研究では、レスポンスレギュレーターRpaBがpsaABプロモーター領域に複数存在するHLR1配列に結合することを見出し、さらに、細菌由来ルシフェラーゼ遺伝子を用いたレポーター解析により、これらのHLR1配列を含むシスエレメントが、2つのプロモーターの活性に様々な影響を及ぼすことを明らかにした。以上、複数の転写制御機構が働き、psaAB発現レベルのfine-tuningが行われていることが明らかになった。
  課題番号：20770026
• シアノバクテリアにおける光合成電子伝達鎖のレドックス検知機構の解明　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 若手研究(B), 2005年 - 2007年
  日原 由香子, 埼玉大学
  配分額（総額）：3500000, 配分額（直接経費）：3500000
  LuxR型低分子量転写因子PedRは光合成電子伝達活性の低い弱光下でいくつかの遺伝子の発現を制御している。しかし光合成電子伝達活性の高まる強光下では一過的に不活化され転写調節能を失う。この活性変換の際に、PedRが構造変化を起こすことが、抗PedR抗体を用いたウェスタン解析により明らかになった。すなわち、不活型タンパク質の泳動度が活性化型より遅れることを見出した。そこで、光合成電子伝達活性の検知ならびに活性変換メカニズムを解明するために、PedRヘアミノ酸変異を導入し、弱光下、強光下におけるPedR標的遺伝子の発現レベルをノーザン法により調べた。シアノバクテリアのPedRオルソログ間で高度に保存されているK40、T54、T56、W65、K71をそれぞれアラニンに置換した結果、PedRの転写因子としての機能に、以下のような影響が見られた。K40A、T54A:リプレッサー、アクチベーターの両機能が弱まる。T56A:特に影響なし。W65A:アクチベーター機能が失われる。K71A:リプレッサー、アクチベーターの両機能が失われる。今後はこれらの変異株について、光強度変化時のPedR活性変換がどのように行われているかどうかを、ウェスタン解析により調べていきたい。さらに、TOF-MS解析により、PedR活性型・不活型がそれぞれどのような修飾を受けているか調べることを予定しており、その準備としてPedRを過剰に発現するSynechocystis sp. PCC 6803株を作製した。
  課題番号：17770029
• シアノバクテリアの順化応答における光化学系I遺伝子群の転写調節機構の解析　　　　　　　　　　　　　　　
  日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 若手研究(B), 2002年 - 2004年
  日原 由香子, 埼玉大学
  配分額（総額）：3400000, 配分額（直接経費）：3400000
  シアノバクテリアSynechocystis sp.PCC6803は、光強度の変化に応答し、系I遺伝子群のプロモーター活性を大きく変動させる。ところが、光強度変化シグナル受容から系I遺伝子発現調節に至るシグナル伝達経路は、全く明らかになっておらず、本研究課題ではその解明を目指している。今年度は前年度に引き続き、系I遺伝子プロモーターの光応答領域の同定を行なった。系I反応中心サブユニットをコードするpsaABおよび小サブユニット遺伝子の代表としてpsaDのプロモーター領域の解析を行った。転写開始点を決定し、また推定プロモーター部位を段階的に欠失させてluxABに連結し、光応答に必要な領域の同定を行ったところ、psaABには独立に光応答性を持つ2つのプロモーター(P1、P2)が存在することが明らかになった。上流プロモーターであるP1については、弱光下におけるプロモーターの活性化に必要なATリッチな領域を同定し、強光下ではこの活性化が解除されることを見いだした。一方、下流プロモーターP2の光応答領域は、P1の上流域に、P2自体からはかなり隔たって存在していることが分かった。この領域は強光下でのP2活性の抑制に関わっており、P1とP2の光応答性は、異なるメカニズムにより実現されていることが分かった。一方、psaDには、psaABと同様2つのプロモーター(P1、P2)が存在していたが、P1の活性は弱く、光応答性は認められなかった。P2はpsaAのP1と同様、弱光下で正の制御を受けることにより、光応答性が付与されていた。このことから、psaDでは、主にP2プロモーターが、系I遺伝子群の協調的な転写制御に関与していると推測される。psaAのP1とpsaDのP2の塩基配列を比較したが、両者に共通性は特に見いだされなかった。
  課題番号：14740433
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