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山口 雅利(ヤマグチ マサトシ)
理工学研究科 物質科学部門 | 准教授 |
工学部 応用化学科 |
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研究者情報
■ 学位■ 研究キーワード
■ 研究分野
■ 経歴
- 2014年03月 - 現在, 埼玉大学, 大学院理工学研究科, 准教授
- 2011年08月 - 現在, 埼玉大学, 環境科学研究センター, 准教授
- 2015年04月 - 2016年03月, カナダ ブリテッィシュコロンビア大学, 植物学科, 訪問研究員
- 2011年12月 - 2015年03月, JST, さきがけ, 研究員
- 2009年07月 - 2011年07月, 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助教
- 2006年04月 - 2009年06月, 独立行政法人理化学研究所PSC 研究員
- 2003年 - 2006年, 独立行政法人理化学研究所PSC 基礎科学特別研究員
- 2002年 - 2003年, 東京大学分子細胞生物学研究所 リサーチアソシエイト
- 2001年 - 2002年, 東京大学分子細胞生物学研究所 日本学術振興会特別研究員
- 1998年04月 - 2001年03月, 東京大学大学院, 理学系研究科, 生物科学(博士課程), 日本国
- 2001年, 東京大学
- 1996年04月 - 1998年03月, 東京大学大学院, 理学系研究科, 生物科学(修士課程), 日本国
- 1998年, 東京大学
- 1992年04月 - 1996年03月, 東京理科大学, 基礎工学部, 生物工学, 日本国
- 1996年, 東京理科大学
- 2022年09月 - 現在
学協会 - 2019年08月 - 現在
さいたま市環境影響評価審議会, 審議会委員, 自治体 - 2021年01月 - 2022年12月
日本植物学会, 選挙管理委員長, 学協会 - 2018年04月 - 2022年03月
埼玉県, 環境影響評価技術審議委員, 自治体 - 2019年04月 - 2021年07月
第7回国際植物細胞壁生物会議組織委員会, 組織委員, その他 - 2017年01月 - 2020年12月
Plant Cell Physiology, Advisory Editorial Board, 学協会 - 2012年01月 - 2020年09月
Plant Biotechnology, Associate Editor, 学協会 - 2017年01月 - 2017年12月
日本植物学会, 電子出版物編集委員長, 学協会 - 2016年01月 - 2017年08月
日本植物細胞分子生物学会, 第35回大会実行委員, 学協会 - 2016年01月 - 2016年12月
日本植物学会, 電子出版物編集委員, 学協会
業績情報
■ 論文- Control of plasma membrane-associated actin polymerization specifies the pattern of the cell wall in xylem vessels
Saku T. Kijima; Takema Sasaki; Yuichiro Kikushima; Daisuke Inoue; Shingo Sakamoto; Yuki Kondo; Soichi Inagaki; Masatoshi Yamaguchi; Nobutaka Mitsuda; Yoshihisa Oda
Nature Communications, 巻:16, 号:1, 2025年02月, [査読有り]
Springer Science and Business Media LLC, 英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1038/s41467-025-56866-y
DOI ID:10.1038/s41467-025-56866-y, eISSN:2041-1723 - The deficiency of methylglyoxal synthase promotes cell proliferation in Synechocystis sp. PCC 6803 under mixotrophic conditions
Aikeranmu Kadeer; Yuuma Ishikawa; Kaushalya Dayarathne; Atsuko Miyagi; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi; Maki Kawai-Yamada
Plant Biotechnology, 巻:41, 号:4, 開始ページ:393, 終了ページ:399, 2024年12月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.24.0718a
DOI ID:10.5511/plantbiotechnology.24.0718a - The effect of light availability and light wavelength on growth, 2-MIB biosynthesis, and 2-MIB-related gene expression in Pseudanabaena foetida var. intermedia.
Kaushalya Dayarathne; Toshiki Ishikawa; Aikeranmu Kadeer; Masatoshi Yamaguchi; Maki Kawai-Yamada
Archives of microbiology, 巻:206, 号:9, 開始ページ:367, 終了ページ:367, 2024年08月, [査読有り], [国際誌]
2-methylisoborneol (2-MIB) is an odiferous metabolite mainly produced by cyanobacteria, contributing to taste and odor problems in drinking water. The mechanisms involved in 2-MIB biosynthesis in cyanobacteria are not yet completely understood. This study investigated the effect of light availability and wavelength on growth, 2-MIB synthesis, and related gene expression in Pseudanabaena foetida var. intermedia. A significantly lower 2-MIB production was observed in P. foetida var. intermedia during the dark period of a 12-h photoperiod. Exposure to green light resulted in a significant decrease in 2-MIB production compared to white light and red light. The relative expression levels of 2-MIB-related genes in P. foetida var. intermedia were significantly lower during the dark period of a 12-h photoperiod and when cultured under green light. The expression of 2-MIB-related genes in cyanobacteria appears to be light-dependent. This study suggests that the demand for photopigment synthesis under unfavorable light conditions affects the 2-MIB synthesis in cyanobacteria.
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1007/s00203-024-04099-w
DOI ID:10.1007/s00203-024-04099-w, PubMed ID:39105810 - Heterologous expression of mtf and mtc genes of Pseudanabaena foetida var. intermedia is sufficient to produce 2-methylisoborneol in Escherichia coli.
Kaushalya Dayarathne; Toshiki Ishikawa; Satoru Watanabe; Yuuma Ishikawa; Kadeer Aikeranmu; Hina Kitagawaa; Natsumi Komatsubara; Masatoshi Yamaguchi; Maki Kawai-Yamada
Microbiology spectrum, 巻:11, 号:5, 開始ページ:e0256123, 2023年09月, [査読有り], [国際誌]
Microbial volatile metabolite 2-methylisoborneol (2-MIB) causes odor and taste issues in drinking water, making it unappealing for human consumption. It has been suggested that 2-MIB biosynthesis consists of two main steps, namely, methylation of geranyl diphosphate into 2-methyl geranyl diphosphate by geranyl diphosphate methyl transferase (GPPMT) and subsequent cyclization into 2-MIB by 2-MIB synthase (MIBS). Pseudanabaena foetida var. intermedia is a 2-MIB-producing cyanobacterium whose GPPMT and MIBS enzymes are encoded by adjacent mtf and mtc genes. The present study identified a 2-MIB-related gene cluster composed of cnbA, mtf, mtc, and cnbB genes in P. foetida var. intermedia. The two homologous cyclic nucleotide-binding protein genes, cnbA and cnbB, were detected adjacent to the mtf and mtc genes, respectively. The nucleotide sequence of the cnbA-mtf-mtc-cnbB gene cluster showed 99.55% identity with 2-MIB synthesis-associated gene cluster of Pseudanabaena sp. dqh15. RT-PCR results revealed that mtf and mtc genes are co-expressed, while cnbA and cnbB genes are expressed independently in P. foetida var. intermedia. To investigate whether only mtf and mtc genes are sufficient for 2-MIB synthesis, the two-gene unit (mtf-mtc) was introduced into Escherichia coli strain JM109 via overexpression vector pYS1C. Gas chromatograph-mass spectrometry results showed that the E. coli strain transformed with mtf-mtc was able to produce 2-MIB. The intracellular 2-MIB level in P. foetida var. intermedia was higher than the extracellular 2-MIB level, while the transformed E. coli strain showed an opposite trend. Growth inhibition was observed in the 2-MIB-producing transformed E. coli strain. IMPORTANCE Contamination of drinking water with odiferous microbial metabolite 2-MIB is a worldwide concern. Removal of 2-MIB from drinking water burdens the water purification process. Therefore, it is important to search for alternative methods, such as suppressing the production of 2-MIB by aquatic microorganisms. For that, it is necessary to expand the current knowledge about the mechanism of 2-MIB synthesis at the genetic level. This study revealed that mtf and mtc genes of the 2-MIB-related gene cluster are transcribed as a single unit in P. foetida var. intermedia, and the expression of both mtf and mtc genes is essential and sufficient for 2-MIB synthesis in E. coli heterologous gene expression system.
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1128/spectrum.02561-23
DOI ID:10.1128/spectrum.02561-23, PubMed ID:37732762, PubMed Central ID:PMC10580876 - NAC domain transcription factors VNI2 and ATAF2 form protein complexes and regulate leaf senescence
Isura Sumeda Priyadarshana Nagahage; Kohei Matsuda; Kyoko Miyashita; Sumire Fujiwara; Chanaka Mannapperuma; Takuya Yamada; Shingo Sakamoto; Toshiki Ishikawa; Minoru Nagano; Misato Ohtani; Ko Kato; Hirofumi Uchimiya; Nobutaka Mitsuda; Maki Kawai‐Yamada; Taku Demura; Masatoshi Yamaguchi
Plant Direct, 巻:7, 号:9, 2023年09月, [査読有り], [最終著者, 責任著者]
Abstract
The NAM, ATAF1/2, and CUC2 (NAC) domain transcription factor VND‐INTERACTING2 (VNI2) negatively regulates xylem vessel formation by interacting with another NAC domain transcription factor, VASCULAR‐RELATED NAC‐DOMAIN7 (VND7), a master regulator of xylem vessel formation. Here, we screened interacting proteins with VNI2 using yeast two‐hybrid assay and isolated two NAC domain transcription factors, Arabidopsis thaliana ACTIVATION FACTOR 2 (ATAF2) and NAC DOMAIN CONTAINING PROTEIN 102 (ANAC102). A transient gene expression assay showed that ATAF2 upregulates the expression of genes involved in leaf senescence, and VNI2 effectively inhibits the transcriptional activation activity of ATAF2. vni2 mutants accelerate leaf senescence, whereas ataf2 mutants delay leaf senescence. In addition, the accelerated leaf senescence phenotype of the vni2 mutant is recovered by simultaneous mutation of ATAF2. Our findings strongly suggest that VNI2 interacts with and inhibits ATAF2, resulting in negatively regulating leaf senescence.
Wiley, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1002/pld3.529
DOI ID:10.1002/pld3.529, ISSN:2475-4455, eISSN:2475-4455 - Metabolic changes associated with dark-induced leaf senescence in Arabidopsis nadk2 mutants
Chaomurilege; Atsuko Miyagi; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi; Hideki Murayama; Maki Kawai-Yamada
Plant Signaling and Behavior, 巻:18, 号:1, 開始ページ:e2215618, 2023年05月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1080/15592324.2023.2215618
DOI ID:10.1080/15592324.2023.2215618 - Loss of peroxisomal NAD kinase 3 (NADK3) affects photorespiration metabolism in Arabidopsis
Shota Suzuki; Daimu Tanaka; Atsuko Miyagi; Kentaro Takahara; Masaru Kono; Chaomurilege; Ko Noguchi; Toshiki Ishikawa; Minoru Nagano; Masatoshi Yamaguchi; Maki Kawai-Yamada
Journal of Plant Physiology, 巻:283, 開始ページ:153950, 2023年03月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1016/j.jplph.2023.153950
DOI ID:10.1016/j.jplph.2023.153950 - Metabolomic analysis of rice brittle culm mutants reveals each mutant- specific metabolic pattern in each organ
Atsuko Miyagi; Kazuhisa Mori; Toshiki Ishikawa; Satoshi Ohkubo; Shunsuke Adachi; Masatoshi Yamaguchi; Taiichiro Ookawa; Toshihisa Kotake; Maki Kawai-Yamada
Metabolomics, 巻:18, 号:12, 2022年11月, [査読有り]
Springer Science and Business Media LLC, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1007/s11306-022-01958-9
DOI ID:10.1007/s11306-022-01958-9, eISSN:1573-3890 - Loss of chloroplast-localized NAD kinase causes ROS stress in Arabidopsis thaliana
Chaomurilege; Yanhui Zu; Atsuko Miyagi; Shin-Nosuke Hashida; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi; Maki Kawai-Yamada
Journal of Plant Research, 巻:in press, 2022年11月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1007/s10265-022-01420-w
DOI ID:10.1007/s10265-022-01420-w - Sphingolipids with 2-hydroxy fatty acids aid in plasma membrane nanodomain organization and oxidative burst
Tomomi Ukawa; Fumihiko Banno; Toshiki Ishikawa; Kota Kasahara; Yuuta Nishina; Rika Inoue; Keigo Tsujii; Masatoshi Yamaguchi; Takuya Takahashi; Yoichiro Fukao; Maki Kawai-Yamada; Minoru Nagano
Plant Physiology, 巻:189, 号:2, 開始ページ:839, 終了ページ:857, 2022年06月, [査読有り]
Abstract
Plant sphingolipids mostly possess 2-hydroxy fatty acids (HFA), the synthesis of which is catalyzed by FA 2-hydroxylases (FAHs). In Arabidopsis (Arabidopsis thaliana), two FAHs (FAH1 and FAH2) have been identified. However, the functions of FAHs and sphingolipids with HFAs (2-hydroxy sphingolipids) are still unknown because of the lack of Arabidopsis lines with the complete deletion of FAH1. In this study, we generated a FAH1 mutant (fah1c) using CRISPR/Cas9-based genome editing. Sphingolipid analysis of fah1c, fah2, and fah1cfah2 mutants revealed that FAH1 hydroxylates very long-chain FAs (VLCFAs), whereas the substrates of FAH2 are VLCFAs and palmitic acid. However, 2-hydroxy sphingolipids are not completely lost in the fah1cfah2 double mutant, suggesting the existence of other enzymes catalyzing the hydroxylation of sphingolipid FAs. Plasma membrane (PM) analysis and molecular dynamics simulations revealed that hydroxyl groups of sphingolipid acyl chains play a crucial role in the organization of nanodomains, which are nanoscale liquid-ordered domains mainly formed by sphingolipids and sterols in the PM, through hydrogen bonds. In the PM of the fah1cfah2 mutant, the expression levels of 26.7% of the proteins, including defense-related proteins such as the pattern recognition receptors (PRRs) brassinosteroid insensitive 1-associated receptor kinase 1 and chitin elicitor receptor kinase 1, NADPH oxidase respiratory burst oxidase homolog D (RBOHD), and heterotrimeric G proteins, were lower than that in the wild-type. In addition, reactive oxygen species (ROS) burst was suppressed in the fah1cfah2 mutant after treatment with the pathogen-associated molecular patterns flg22 and chitin. These results indicated that 2-hydroxy sphingolipids are necessary for the organization of PM nanodomains and ROS burst through RBOHD and PRRs during pattern-triggered immunity.
Oxford University Press (OUP), 英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1093/plphys/kiac134
DOI ID:10.1093/plphys/kiac134, ISSN:0032-0889, eISSN:1532-2548 - VNI2 effectively inhibits transcriptional activities of VND7 through a conserved sequence
Aili Ailizati; Isura Sumeda Priyadarshana Nagahage; Atsuko Miyagi; Toshiki Ishikawa; Maki Kawai-Yamada; Taku Demura; Masatoshi Yamaguchi
Plant Biotechnology, 巻:39, 号:2, 開始ページ:147, 終了ページ:153, 2022年06月, [査読有り], [最終著者, 責任著者], [国際共著]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.22.0122a
DOI ID:10.5511/plantbiotechnology.22.0122a - An Arabidopsis NAC domain transcriptional activator VND7 negatively regulates VNI2 expression.
Ailizati A; Nagahage ISP; Miyagi A; Ishikawa T; Kawai-Yamada M; Demura T; Yamaguchi M
Plant Biotechnology, 開始ページ:in press, 2021年10月, [査読有り], [最終著者, 責任著者] - Change in expression levels of NAD kinase-encoding genes in Flaveria species
Masami Tanaka; Yuuma Ishikawa; Sayaka Suzuki; Takako Ogawa; Yukimi Y. Taniguchi; Atsuko Miyagi; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi; Yuri N. Munekage; Maki Kawai-Yamada
Journal of Plant Physiology, 巻:265, 開始ページ:153495, 終了ページ:153495, 2021年10月, [査読有り], [国際誌]
Nicotinamide adenine dinucleotides (NAD(H)) and NAD phosphates (NADP(H)) are electron carriers involved in redox reactions and metabolic processes in all organisms. NAD kinase (NADK) is the only enzyme that phosphorylates NAD+ into NADP+, using ATP as a phosphate donor. In NADP-dependent malic enzyme (NADP-ME)-type C4 photosynthesis, NADP(H) are required for dehydrogenation by NADP-dependent malate dehydrogenase (NADP-MDH) in mesophyll cells, and decarboxylation by NADP-ME in bundle sheath cells. In this study, we identified five NADK genes (FbNADK1a, 1b, 2a, 2b, and 3) from the C4 model species Flaveria bidentis. RNA-Seq database analysis revealed higher transcript abundance in one of the chloroplast-type NADK2 genes of C4F. bidentis (FbNADK2a). Comparative analysis of NADK activity in leaves of C3, C3-C4, and C4Flaveria showed that C4Flaveria (F. bidentis and F. trinervia) had higher NADK activity than the other photosynthetic-types of Flaveria. Taken together, our results suggest that chloroplastic NAD kinase appeared to increase in importance as C3 plants evolved into C4 plants in the genus Flaveria.
Elsevier BV, 英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1016/j.jplph.2021.153495
DOI ID:10.1016/j.jplph.2021.153495, ISSN:0176-1617, PubMed ID:34411985 - The NAD Kinase Slr0400 Functions as a Growth Repressor in Synechocystis sp. PCC 6803
Yuuma Ishikawa; Cedric Cassan; Aikeranmu Kadeer; Koki Yuasa; Nozomu Sato; Kintake Sonoike; Yasuko Kaneko; Atsuko Miyagi; Hiroko Takahashi; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi; Yoshitaka Nishiyama; Yukako Hihara; Yves Gibon; Maki Kawai-Yamada
Plant and Cell Physiology, 巻:62, 号:4, 開始ページ:668, 終了ページ:677, 2021年09月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1093/pcp/pcab023
DOI ID:10.1093/pcp/pcab023, ISSN:0032-0781, eISSN:1471-9053, PubMed ID:33560438, Web of Science ID:WOS:000728395500015 - The NAD Kinase Slr0400 Functions as a Growth Repressor in Synechocystis sp. PCC 6803
Yuuma Ishikawa; Cedric Cassan; Aikeranmu Kadeer; Koki Yuasa; Nozomu Sato; Kintake Sonoike; Yasuko Kaneko; Atsuko Miyagi; Hiroko Takahashi; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi; Yoshitaka Nishiyama; Yukako Hihara; Yves Gibon; Maki Kawai-Yamada
Plant and Cell Physiology, 巻:62, 号:4, 開始ページ:668, 終了ページ:677, 2021年09月, [査読有り]Abstract
NADP+, the phosphorylated form of nicotinamide adenine dinucleotide (NAD), plays an essential role in many cellular processes. NAD kinase (NADK), which is conserved in all living organisms, catalyzes the phosphorylation of NAD+ to NADP+. However, the physiological role of phosphorylation of NAD+ to NADP+ in the cyanobacterium Synechocystis remains unclear. In this study, we report that slr0400, an NADK-encoding gene in Synechocystis, functions as a growth repressor under light-activated heterotrophic growth conditions and light and dark cycle conditions in the presence of glucose. We show, via characterization of NAD(P)(H) content and enzyme activity, that NAD+ accumulation in slr0400-deficient mutant results in the unsuppressed activity of glycolysis and tricarboxylic acid (TCA) cycle enzymes. In determining whether Slr0400 functions as a typical NADK, we found that constitutive expression of slr0400 in an Arabidopsis nadk2-mutant background complements the pale-green phenotype. Moreover, to determine the physiological background behind the growth advantage of mutants lacking slr04000, we investigated the photobleaching phenotype of slr0400-deficient mutant under high-light conditions. Photosynthetic analysis found in the slr0400-deficient mutant resulted from malfunctions in the Photosystem II (PSII) photosynthetic machinery. Overall, our results suggest that NADP(H)/NAD(H) maintenance by slr0400 plays a significant role in modulating glycolysis and the TCA cycle to repress the growth rate and maintain the photosynthetic capacity.
Oxford University Press (OUP), 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1093/pcp/pcab023
DOI ID:10.1093/pcp/pcab023, ISSN:0032-0781, eISSN:1471-9053, PubMed ID:33210985, PubMed Central ID:PMC7781788 - Altered metabolism of chloroplastic NAD kinase-overexpressing Arabidopsis in response to magnesium sulfate supplementation
Maki Kawai-Yamada; Atsuko Miyagi; Yuki Sato; Yuki Hosoi; Shin-Nosuke Hashida; Toshiki Ishikawa; Masatoshi Yamaguchi
Plant Signaling & Behavior, 巻:16, 号:1, 開始ページ:1844509, 終了ページ:1844509, 2021年01月, [査読有り]
Informa UK Limited, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1080/15592324.2020.1844509
DOI ID:10.1080/15592324.2020.1844509, eISSN:1559-2324 - An Arabidopsis NAC domain transcription factor, ATAF2 , promotes age‐dependent and dark‐induced leaf senescence
Isura Sumeda Priyadarshana Nagahage; Shingo Sakamoto; Minoru Nagano; Toshiki Ishikawa; Nobutaka Mitsuda; Maki Kawai‐Yamada; Masatoshi Yamaguchi
Physiologia Plantarum, 巻:170, 号:2, 開始ページ:299, 終了ページ:308, 2020年10月, [査読有り], [最終著者, 責任著者], [国際誌]
Leaf senescence is controlled developmentally and environmentally and is affected by numerous genes, including transcription factors. An Arabidopsis NAC domain transcription factor, ATAF2, is known to regulate biotic stress responses. Recently, we have demonstrated that ATAF2 upregulates ORE1, a key regulator of leaf senescence. Here, to investigate the function of ATAF2 in leaf senescence further, we generated and analyzed overexpressing transgenic and T-DNA inserted mutant lines. Transient expression analysis indicated that ATAF2 upregulates several NAC domain transcription factors that regulate senescence. Indeed, ATAF2 overexpression induced the expression of senescence-related genes, thereby accelerating leaf senescence, whereas the expression of such genes in ataf2 mutants was lower than that of wild-type plants. Furthermore, the ataf2 mutants exhibited significant delays in dark-induced leaf senescence. It was also found that ATAF2 induces the expression of transcription factors, which both promotes and represses leaf senescence. The present study demonstrates that ATAF2 promotes leaf senescence in response to developmental and environmental signals.
Wiley, 英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1111/ppl.13156
DOI ID:10.1111/ppl.13156, ISSN:0031-9317, eISSN:1399-3054, PubMed ID:32579231, 共同研究・競争的資金等ID:12839792;12839799 - Plant-unique cis/trans isomerism of long-chain base unsaturation is selectively required for Aluminum tolerance resulting from glucosylceramide-dependent plasma membrane fluidity
Sato M; Nagano M; Jin S; Miyagi A; Yamaguchi M; Kawai-Yamada M; Ishikawa T
Plants, 巻:9, 号:1, 開始ページ:19, 2020年, [査読有り], [招待有り], [国際誌]
Cis/trans isomerism of the Δ8 unsaturation of long-chain base (LCB) is found only in plant sphingolipids. This unique geometry is generated by sphingolipid LCB Δ8 desaturase SLD which produces both isomers at various ratios, resulting in diverse cis/trans ratios in plants. However, the biological significance of this isomeric diversity remains controversial. Here, we show that the plant-specific cis unsaturation of LCB selectively contributes to glucosylceramide (GlcCer)-dependent tolerance to aluminum toxicity. We established three transgenic rice lines with altered LCB unsaturation profiles. Overexpression of SLD from rice (OsSLD-OX), which preferentially exhibits cis-activity, or Arabidopsis (AtSLD-OX), showing preference for trans-activity, facilitated Δ8 unsaturation in different manners: a slight increase of cis-unsaturated glycosylinositolphosphoceramide (GIPC) in OsSLD-OX, and a drastic increase of trans-unsaturated GlcCer and GIPC in AtSLD-OX. Disruption of LCB Δ4 desaturase (des) significantly decreased the content of GlcCer. Fluorescence imaging analysis revealed that OsSLD-OX and AtSLD-OX showed increased plasma membrane fluidity, whereas des had less fluidity, demonstrating that the isomers universally contributed to increasing membrane fluidity. However, the results of a hydroponic assay showed decreased aluminum tolerance in AtSLD-OX and des compared to OsSLD-OX and the control plants, which did not correlate with membrane fluidity. These results suggest that cis-unsaturated GlcCer, not GIPC, selectively serves to maintain the membrane fluidity specifically associated with aluminum tolerance.
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.3390/plants9010019
DOI ID:10.3390/plants9010019, PubMed ID:31877922, PubMed Central ID:PMC7020186 - The Class II KNOX genes KNAT3 and KNAT7 work cooperatively to influence deposition of secondary cell walls that provide mechanical support to Arabidopsis stems
Shumin Wang; Masatoshi Yamaguchi; Etienne Grienenberger; Patrick T. Martone; A. Lacey Samuels; Shawn D. Mansfield
The Plant Journal, 巻:101, 号:2, 開始ページ:293, 終了ページ:309, 2020年01月, [査読有り]
Wiley, 英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1111/tpj.14541
DOI ID:10.1111/tpj.14541, ISSN:0960-7412, eISSN:1365-313X - Affinity‐based high‐resolution analysis of DNA binding by VASCULAR‐RELATED NAC‐DOMAIN7 via fluorescence correlation spectroscopy
Tamura T; Endo H; Suzuki A; Sato Y; Kato K; Ontani M; Yamaguchi M; Demura T
Plant Journal, 巻:100, 号:2, 開始ページ:298, 終了ページ:313, 2019年10月, [査読有り], [責任著者]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1111/tpj.14443
Scopus:https://www.scopus.com/inward/record.uri?partnerID=HzOxMe3b&scp=85070718967&origin=inward
Scopus Citedby:https://www.scopus.com/inward/citedby.uri?partnerID=HzOxMe3b&scp=85070718967&origin=inward
DOI ID:10.1111/tpj.14443, ISSN:0960-7412, eISSN:1365-313X, PubMed ID:31313414, SCOPUS ID:85070718967 - One of the NAD kinases, sll1415, is required for the glucose metabolism of Synechocystis sp. PCC 6803.
Yuma Ishikawa; Atsuko Miyagi; Toshiki Ishikawa; Minoru Nagano; Masatoshi Yamaguchi; Yukako Hihara; Yasuo Kaneko; Maki Kawai‐Yamada
Plant Journal, 巻:98, 号:4, 開始ページ:654, 終了ページ:666, 2019年05月, [査読有り], [国際誌]
Pyridine nucleotides (NAD(P)(H)) are electron carriers that are the driving forces in various metabolic pathways. Phosphorylation of NAD(H) to NADP(H) is performed by the enzyme NAD kinase (NADK). Synechocystis sp. PCC 6803 harbors two genes (sll1415 and slr0400) that encode proteins with NADK homology. When genetic mutants for sll1415 and slr0400 (Δ1415 and Δ0400, respectively) were cultured under photoheterotrophic growth conditions only the Δ1415 cells showed a growth defect. In wild-type cells, the sll1415 transcript accumulated after the cells were transferred to photoheterotrophic conditions. Furthermore, NAD(P)(H) measurements demonstrated that a dynamic metabolic conversion was implemented during the adaptation from photoautotrophic to photoheterotrophic conditions. Electron microscopy observation and biochemistry quantification demonstrated the accumulation of glycogen in the Δ1415 cells under photoheterotrophic conditions at 96 h. Quantitative real-time reverse transcription PCR (qRT-PCR) demonstrated the accumulation of mRNAs that encoded glycogen biosynthesis-related enzymes in photoheterotrophic Δ1415 cells. At 96 h, enzyme activity measurement in the photoheterotrophic Δ1415 cells demonstrated that the activities of glucose-6-phosphate dehydrogenase and 6-phosphogluconate dehydrogenase were decreased, but the activities of glucose dehydrogenase were increased. Furthermore, metabolomics analysis demonstrated that the Δ1415 cells showed increased glucose-6-phosphate and 6-phosphogluconate content at 96 h. Therefore, sll1415 has a significant function in the oxidative pentose phosphate (OPP) pathway for catabolism of glucose under photoheterotrophic conditions. Additionally, it is presumed that the slr0400 had a different role in glucose catabolism during growth. These results suggest that the two Synechocystis sp. PCC 6803 NADKs (Sll1415 and Slr0400) have distinct functions in photoheterotrophic cyanobacterial metabolism.
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1111/tpj.14262
DOI ID:10.1111/tpj.14262, PubMed ID:30693583 - Arabidopsis Group IIId ERF proteins positively regulate primary cell wall-type CESA genes.
Laddawan Saelim; Nobuhiro Akiyoshi; Tian Tian Tan; Ayumi Ihara; Masatoshi Yamaguchi; Ko Hirano; Makoto Matsuoka; Taku Demura; Misato Ohtani
Journal of plant research, 巻:132, 号:1, 開始ページ:117, 終了ページ:129, 2019年01月, [査読有り], [国内誌]
The cell wall determines morphology and the environmental responses of plant cells. The primary cell wall (PCW) is produced during cell division and expansion, determining the cell shape and volume. After cell expansion, specific types of plant cells produce a lignified wall, known as a secondary cell wall (SCW). We functionally analyzed Group IIId Arabidopsis AP2/EREBP genes, namely ERF34, ERF35, ERF38, and ERF39, which are homologs of a rice ERF gene previously proposed to be related to SCW biosynthesis. Expression analysis revealed that these four genes are expressed in regions related to cell division and/or cell differentiation in seedlings (i.e., shoot apical meristems, the primordia of leaves and lateral roots, trichomes, and central cylinder of primary roots) and flowers (i.e., vascular tissues of floral organs and replums and/or valve margins of pistils). Overexpression of ERF genes significantly upregulated PCW-type, but not SCW-type, CESA genes encoding cellulose synthase catalytic subunits in Arabidopsis seedlings. Transient co-expression reporter analysis indicated that ERF35, ERF38, and ERF39 possess transcriptional activator activity, and that ERF34, ERF35, ERF38, and ERF39 upregulated the promoter activity of CESA1, a PCW-type CESA gene, through the DRECRTCOREAT elements, the core cis-acting elements known to be recognized by AP2/ERF proteins. Together, our findings show that Group IIId ERF genes are positive transcriptional regulators of PCW-type CESA genes in Arabidopsis and are possibly involved in modulating cellulose biosynthesis in response to developmental requirements and environmental stimuli.
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1007/s10265-018-1074-1
DOI ID:10.1007/s10265-018-1074-1, PubMed ID:30478480 - An NAC domain transcription factor ATAF2 acts as transcriptional activator or repressor dependent on promoter context
Isura Sumeda Priyadarshana Nagahage; Shingo Sakamoto; Minoru Nagano; Toshiki Ishikawa; Maki Kawai-Yamada; Nobutaka Mitsuda; Masatoshi Yamaguchi
Plant Biotechnology, 巻:35, 号:3, 開始ページ:285, 終了ページ:289, 2018年09月, [査読有り], [最終著者, 責任著者]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.18.0507a
DOI ID:10.5511/plantbiotechnology.18.0507a - Characterization of rice KT/HAK/KUP potassium transporters and K+ uptake by HAK1 from oryza sativa
Tomoyuki Okada; Sousuke Yamane; Masatoshi Yamaguchi; Ko Kato; Atsuhiko Shinmyo; Yuta Tsunemitsu; Kozo Iwasaki; Daisei Ueno; Taku Demura
Plant Biotechnology, 巻:35, 号:2, 開始ページ:101, 終了ページ:111, 2018年, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
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Tian Tian Tan; Hitoshi Endo; Ryosuke Sano; Tetsuya Kurata; Masatoshi Yamaguchi; Misato Ohtani; Taku Demura
Plant physiology, 巻:176, 号:1, 開始ページ:773, 終了ページ:789, 2018年01月, [査読有り], [国際誌]
英語
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DOI ID:10.1104/pp.17.00461, ORCID:42523540, PubMed ID:29133368, PubMed Central ID:PMC5761765, Web of Science ID:WOS:000419675300060 - Evaluation of metabolic changes in oxalate-rich plant Rumex obtusifolius L. caused by ion beam irradiation.
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Plant physiology and biochemistry : PPB, 巻:122, 開始ページ:40, 終了ページ:45, 2018年01月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌)
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Chiemi Imaizumi; Harumi Tomatsu; Kiminari Kitazawa; Yoshihisa Yoshimi; Seiji Shibano; Kaoru Kikuchi; Masatoshi Yamaguchi; Satoshi Kaneko; Yoichi Tsumuraya; Toshihisa Kotake
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英語, 研究論文(学術雑誌)
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DOI ID:10.1093/jxb/erx279, ISSN:0022-0957, eISSN:1460-2431, ORCID:39147297, Web of Science ID:WOS:000412100500020 - Metabolomic analysis of NAD kinase-deficient mutants of the cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803
Yuuma Ishikawa; Atsuko Miyagi; Yuto Haishima; Toshiki Ishikawa; Minoru Nagano; Masatoshi Yamaguchi; Yukako Hihara; Maki Kawai-Yamada
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英語, 研究論文(学術雑誌)
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DOI ID:10.1016/j.jplph.2016.09.002, ISSN:0176-1617, eISSN:1618-1328, ORCID:39147298, Web of Science ID:WOS:000385858600014 - The expression of a rice secondary wall-specific cellulose synthase gene, OsCesA7, is directly regulated by a rice transcription factor, OsMYB58/63
Soichiro Noda; Taichi Koshiba; Takefumi Hattori; Masatoshi Yamaguchi; Shiro Suzuki; Toshiaki Umezawa
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英語, 研究論文(学術雑誌)
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DOI ID:10.1007/s00425-015-2343-z, ISSN:0032-0935, eISSN:1432-2048, ORCID:39147303, Web of Science ID:WOS:000359831900008 - Arabidopsis NAC domain proteins VND-INTERACTING1 and ANAC103 interact with multiple NAC domain proteins
Masatoshi Yamaguchi; Isura Sumeda Priyadarshana Nagahage; Misato Ohtani; Toshiki Ishikawa; Hirofumi Uchimiya; Maki Kawai-Yamada; Taku Demura
PLANT BIOTECHNOLOGY, 巻:32, 号:2, 開始ページ:119, 終了ページ:U14, 2015年06月, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
英語, 研究論文(学術雑誌)
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Yoshimi Nakano; Masatoshi Yamaguchiz; Hitoshi Endo; Nur Ardiyana Rejab; Misato Ohtani
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 巻:6, 2015年05月, [査読有り]
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Hitoshi Endo; Masatoshi Yamaguchi; Taizo Tamura; Yoshimi Nakano; Nobuyuki Nishikubo; Arata Yoneda; Ko Kato; Minoru Kubo; Shinya Kajita; Yoshihiro Katayama; Misato Ohtani; Taku Demura
PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻:56, 号:2, 開始ページ:242, 終了ページ:254, 2015年02月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
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Bo Xu; Misato Ohtani; Masatoshi Yamaguchi; Kiminori Toyooka; Mayumi Wakazaki; Mayuko Sato; Minoru Kubo; Yoshimi Nakano; Ryosuke Sano; Yuji Hiwatashi; Takashi Murata; Tetsuya Kurata; Arata Yoneda; Ko Kato; Mitsuyasu Hasebe; Taku Demura
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英語, 研究論文(学術雑誌)
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DOI ID:10.1126/science.1248417, ISSN:0036-8075, eISSN:1095-9203, ORCID:39147304, Web of Science ID:WOS:000333471000046 - Culture temperature affects gene expression and metabolic pathways in the 2-methylisoborneol-producing cyanobacterium Pseudanabaena galeata
Masayuki Kakimoto; Toshiki Ishikawa; Atsuko Miyagi; Kazuaki Saito; Motonobu Miyazaki; Takashi Asaeda; Masatoshi Yamaguchi; Hirofumi Uchimiya; Maki Kawai-Yamada
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英語, 研究論文(学術雑誌)
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研究論文(学術雑誌)
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PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻:54, 号:4, 開始ページ:474, 終了ページ:483, 2013年04月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
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英語, 研究論文(学術雑誌)
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英語, 研究論文(学術雑誌)
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Kiyotaka Ueda; Hideyuki Matsuura; Masatoshi Yamaguchi; Taku Demura; Ko Kato
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英語, 研究論文(学術雑誌)
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英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04614.x
DOI ID:10.1111/j.1365-313X.2011.04614.x, ISSN:0960-7412, ORCID:39147311, PubMed ID:21649762, Web of Science ID:WOS:000293176600010 - VASCULAR-RELATED NAC-DOMAIN 7 directly regulates the expression of a broad range of genes for xylem vessel formation
Masatoshi Yamaguchi; Nobutaka Mitsuda; Misato Ohtani; Masaru Ohme-Takagi; Ko Kato; Taku Demura
Plant Journal, 巻:66, 号:4, 開始ページ:579, 終了ページ:590, 2011年05月, [査読有り], [筆頭著者]
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DOI ID:10.1111/j.1365-313X.2011.04514.x, ISSN:0960-7412, ORCID:39147312, PubMed ID:21284754, SCOPUS ID:79955852269, Web of Science ID:WOS:000290456400013 - 道管分化マスター因子の発現を制御する転写因子の探索とその解析
遠藤 仁; 山口 雅利; 中野 仁美; 西窪 伸之; 大谷 美沙都; 加藤 晃; 片山 義博; 梶田 真也; 出村 拓
日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集, 巻:2011, 開始ページ:0480, 終了ページ:0480, 2011年
私たちはこれまでに、シロイヌナズナ培養細胞の道管要素への分化転換を同調的に誘導する実験系を確立し、これを用いたマイクロアレイ解析により道管要素分化誘導過程において発現が変動する遺伝子を多数同定した。さらに、これらの中で、NACドメイン転写因子をコードするVASCULAR-RELARED NAC-DOMAIN7 (VND7)が道管分化のマスター因子であることをすでに明らかにしている。本研究ではVND7の発現制御に関わる転写因子を同定するために、道管要素分化過程でVND7と同調して発現が上昇する転写因子に着目し、VND7プロモーター:ルシフェラーゼをレポーターとしたパーティクルボンバードメントによるトランジェント解析を行った。その結果、VND7を含む7種のVNDファミリー遺伝子すべてがVND7の発現を正に制御することが明らかとなった。また、VND以外の80種の転写因子について解析を行ったところ、VND7の発現を正に制御する複数の転写因子を同定した。このうち、新たに同定したNACタイプの転写因子の機能解析を進めたところ、過剰発現体において異所的な二次細胞壁形成が認められた。このことから、現在NAC転写因子について更なる機能解析を進めており、その結果についても報告したい。
日本植物生理学会
DOI:https://doi.org/10.14841/jspp.2011.0.0480.0
DOI ID:10.14841/jspp.2011.0.0480.0, CiNii Articles ID:130006996826 - 植物二次細胞壁形成の転写制御機構
Masatoshi YAMAGUCHI; Misato OHTANI; Taku DEMURA
KAGAKU TO SEIBUTSU, 巻:49, 号:11, 開始ページ:770, 終了ページ:777, 2011年, [査読有り], [筆頭著者]
Masatoshi YAMAGUCHI, Misato OHTANI, Taku DEMURA, 2011, '植物二次細胞壁形成の転写制御機構', <i>KAGAKU TO SEIBUTSU</i>, vol. 49, no. 11, pp. 770-777
Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry, 日本語
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DOI ID:10.1271/kagakutoseibutsu.49.770, ISSN:0453-073X, CiNii Articles ID:10029873610, CiNii Books ID:AN00037573, ORCID:9105799 - A Short Period of Mannitol Stress but Not LiCl Stress Led to Global Translational Repression in Plants
Hideyuki Matsuura; Ueda Kiyotaka; Yu Ishibashi; Yuki Kubo; Masatoshi Yamaguchi; Kazumasa Hirata; Taku Demura; Ko Kato
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 巻:74, 号:10, 開始ページ:2110, 終了ページ:2112, 2010年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
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PLANT BIOTECHNOLOGY, 巻:27, 号:3, 開始ページ:237, 終了ページ:242, 2010年, [査読有り], [筆頭著者]
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英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.27.267
DOI ID:10.5511/plantbiotechnology.27.267, ISSN:1342-4580, ORCID:39147314, Web of Science ID:WOS:000280085800008 - Identifying New Components Participating in the Secondary Cell Wall Formation of Vessel Elements in Zinnia and Arabidopsis
Satoshi Endo; Edouard Pesquet; Masatoshi Yamaguchi; Gen Tashiro; Mayuko Sato; Kiminori Toyooka; Nobuyuki Nishikubo; Makiko Udagawa-Motose; Minoru Kubo; Hiroo Fukuda; Taku Demura
PLANT CELL, 巻:21, 号:4, 開始ページ:1155, 終了ページ:1165, 2009年04月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1105/tpc.108.059154
DOI ID:10.1105/tpc.108.059154, ISSN:1040-4651, CiNii Articles ID:80020348025, ORCID:39147318, PubMed ID:19383897, Web of Science ID:WOS:000266295800015 - An isoform of Arabidopsis myosin XI interacts with small GTPases in its C-terminal tail region
Kohsuke Hashimoto; Hisako Igarashi; Shoji Mano; Chikako Takenaka; Takashi Shiina; Masatoshi Yamaguchi; Taku Demura; Mikio Nishimura; Teruo Shimmen; Etsuo Yokota
JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, 巻:59, 号:13, 開始ページ:3523, 終了ページ:3531, 2008年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1093/jxb/ern202
DOI ID:10.1093/jxb/ern202, ISSN:0022-0957, eISSN:1460-2431, CiNii Articles ID:80019971620, ORCID:39147319, PubMed ID:18703495, Web of Science ID:WOS:000259973800003 - VASCULAR-RELATED NAC-DOMAIN7 is involved in the differentiation of all types of xylem vessels in Arabidopsis roots and shoots
Masatoshi Yamaguchi; Minoru Kubo; Hiroo Fukuda; Taku Demura
PLANT JOURNAL, 巻:55, 号:4, 開始ページ:652, 終了ページ:664, 2008年08月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2008.03533.x
DOI ID:10.1111/j.1365-313X.2008.03533.x, ISSN:0960-7412, ORCID:39147320, PubMed ID:18445131, Web of Science ID:WOS:000258287700010 - Control of cell division and transcription by cyclin-dependent kinase-activating kinases in plants
M Umeda; A Shimotohno; M Yamaguchi
PLANT AND CELL PHYSIOLOGY, 巻:46, 号:9, 開始ページ:1437, 終了ページ:1442, 2005年09月, [査読有り]
英語
DOI:https://doi.org/10.1093/pcp/pci170
DOI ID:10.1093/pcp/pci170, ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:40006875958, Web of Science ID:WOS:000232223100001 - Transcription switches for protoxylem and metaxylem vessel formation
M Kubo; M Udagawa; N Nishikubo; G Horiguchi; M Yamaguchi; J Ito; T Mimura; H Fukuda; T Demura
GENES & DEVELOPMENT, 巻:19, 号:16, 開始ページ:1855, 終了ページ:1860, 2005年08月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1101/gad.1331305
DOI ID:10.1101/gad.1331305, ISSN:0890-9369, CiNii Articles ID:30018919280, PubMed ID:16103214, Web of Science ID:WOS:000231277600005 - Control of in vitro organogenesis by cyclin-dependent kinase activities in plants
M Yamaguchi; H Kato; S Yoshida; S Yamamura; H Uchimiya; M Umeda
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 巻:100, 号:13, 開始ページ:8019, 終了ページ:8023, 2003年06月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1073/pnas.1332637100
DOI ID:10.1073/pnas.1332637100, ISSN:0027-8424, CiNii Articles ID:80016025487, PubMed ID:12799469, Web of Science ID:WOS:000183845800108 - Cell cycle function of a rice B2-type cyclin interacting with a B-type cyclin-dependent kinase
J Lee; A Das; M Yamaguchi; J Hashimoto; N Tsutsumi; H Uchimiya; M Umeda
PLANT JOURNAL, 巻:34, 号:4, 開始ページ:417, 終了ページ:425, 2003年05月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.2003.01736.x
DOI ID:10.1046/j.1365-313X.2003.01736.x, ISSN:0960-7412, PubMed ID:12753582, Web of Science ID:WOS:000182785300003 - Differential phosphorylation activities of CDK-activating kinases in Arabidopsis thaliana
A Shimotohno; S Matsubayashi; M Yamaguchi; H Uchimiya; M Umeda
FEBS LETTERS, 巻:534, 号:1-3, 開始ページ:69, 終了ページ:74, 2003年01月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1016/S0014-5793(02)03780-8
DOI ID:10.1016/S0014-5793(02)03780-8, ISSN:0014-5793, CiNii Articles ID:80015743159, PubMed ID:12527363, Web of Science ID:WOS:000180502100012 - Activation of CDK-activating kinase is dependent on interaction with H-type cyclins in plants
M Yamaguchi; T Fabian; M Sauter; RP Bhalerao; J Schrader; G Sandberg; M Umeda; H Uchimiya
PLANT JOURNAL, 巻:24, 号:1, 開始ページ:11, 終了ページ:20, 2000年10月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.2000.00846.x
DOI:https://doi.org/10.1046/j.1365-313x.2000.00846.x
DOI ID:10.1046/j.1365-313X.2000.00846.x, ISSN:0960-7412, ORCID:39147327, Web of Science ID:WOS:000089935800002 - A rice homolog of Cdk7/MO15 phosphorylates both cyclin-dependent protein kinases and the carboxy-terminal domain of RNA polymerase II
M Yamaguchi; M Umeda; H Uchimiya
PLANT JOURNAL, 巻:16, 号:5, 開始ページ:613, 終了ページ:619, 1998年12月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌)
DOI:https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.1998.00338.x
DOI:https://doi.org/10.1046/j.1365-313x.1998.00338.x
DOI ID:10.1046/j.1365-313X.1998.00338.x, ISSN:0960-7412, ORCID:39147330, Web of Science ID:WOS:000077866600010
- シロイヌナズナVND遺伝子群の遺伝学的解析
伊藤敦也; 久保稔; 大谷美沙都; 石川寿樹; 川合真紀; 出村拓; 山口雅利
日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 巻:36th, 開始ページ:153, 2018年08月15日
日本語
J-Global ID:201802264094945466 - イオンビームを照射した高シュウ酸植物エゾノギシギシの代謝解析
宮城敦子; 北野沙也佳; 長谷純宏; 大野豊; 山口雅利; 川合真紀
日本植物学会大会研究発表記録, 巻:79th, 開始ページ:134, 2015年09月01日
日本語
J-Global ID:201502214850620962 - NAD(P)代謝改変シロイヌナズナの作出および代謝解析
鈴木渉太; 宮城敦子; 石川寿樹; 刑部敬史; 長野稔; 山口雅利; 川合真紀
日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 巻:33rd, 開始ページ:140, 2015年07月20日
日本語
J-Global ID:201502202919376033 - An E3 ubiquitin ligase involved in secondary wall formation
Soichiro Noda; Masatoshi Yamaguchi; Nobuyuki Nishikubo; Nozomu Sakurai; Masaomi Yamamura; Takefumi Hattori; Hideyuki Suzuki; Daisuke Shibata; Taku Demura; Shiro Suzuki; Toshiaki Umezawa
International Symposium on Wood Science and Technology 2015, 2015年03月 - Functional characterization of rice MYB transcription factors involved in secondary cell wall biosynthesis
Soichiro Noda; Taichi Koshiba; Masatoshi Yamaguchi; Takefumi Hattori; Shiro Suzuki; Toshiaki Umezawa
ICP2014, XXVIIth International Conference on Polyphenols, Nagoya, 2014年09月, [招待有り] - 道管細胞と繊維細胞を作り分けるシス配列-転写因子結合制御の分子基盤の解明
田村泰造; 山口雅利; 遠藤仁; 米田新; 久保稔; 加藤晃; 大谷美沙都; 出村拓; 出村拓
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 巻:37th, 2014年
J-Global ID:201502208023422025 - 道管細胞分化マスター制御因子VND7はタイトにその発現が制御される
遠藤仁; 山口雅利; TAN Tian Tian; 田村泰造; 久保稔; 大谷美沙都; 出村拓; 出村拓
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 巻:37th, 2014年
J-Global ID:201502260216732643 - 道管細胞分化におけるタンパク質S-ニトロシル化修飾の役割の解明
川邊陽文; 大谷美沙都; 山口雅利; 久保稔; 倉田哲也; 坂本智昭; 米田新; 加藤晃; 出村拓; 出村拓
日本植物学会大会研究発表記録, 巻:78th, 2014年
J-Global ID:201402276448409810 - ガンマ線が高シュウ酸植物の代謝に及ぼす影響
北野沙也佳; 宮城敦子; 大野豊; 長谷純弘; 鳴海一成; 山口雅利; 内宮博文; 川合真紀
日本植物学会大会研究発表記録, 巻:77th, 開始ページ:185, 2013年08月20日
日本語
J-Global ID:201302255221317192 - VND7による道管要素分化誘導系を用いたキシランキシロシルトランスフェラーゼの生化学的解析
深水祐一郎; 中野仁美; 山口雅利; 石水毅; 出村拓; 出村拓
日本植物生理学会年会要旨集, 巻:53rd, 2012年
J-Global ID:201202213414100741 - タバコBY-2細胞を用いた道管要素分化誘導システムの構築-二次壁形成における分子機構の解明に向けて-
中野仁美; 深水祐一郎; 伊藤由希子; グエ ナディア; 五十嵐久子; 山口雅利; 石水毅; 出村拓; 出村拓
日本植物生理学会年会要旨集, 巻:53rd, 2012年
J-Global ID:201202283424277095 - 道管分化マスター因子の発現制御機構の解明
遠藤仁; 山口雅利; 中野仁美; 米田新; 加藤晃; 出村拓
日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 巻:30th, 2012年
J-Global ID:201302254240186272 - 二次細胞壁形成の時空間的制御 (特集 植物細胞壁研究の新局面 : サステナブル社会構築の基盤となる循環型炭素資源)
大谷 美沙都; 山口 雅利; 出村 拓
遺伝 : 生物の科学, 巻:66, 号:1, 開始ページ:40, 終了ページ:46, 2012年01月
エヌ・ティー・エス, 日本語
ISSN:0387-0022, CiNii Articles ID:40019142214, CiNii Books ID:AN00015468 - 道管分化マスター因子の発現を制御する転写因子の探索とその解析
遠藤仁; 遠藤仁; 山口雅利; 中野仁美; 西窪伸之; 大谷美沙都; 加藤晃; 片山義博; 梶田真也; 出村拓
日本植物生理学会年会要旨集, 巻:52nd, 2011年
J-Global ID:201102292421319805 - 非モデル樹木ヤトロファの次世代トランスクリプトーム解析
中野仁美; 坂本智昭; 大谷美沙都; 山口雅利; 倉田哲也; 出村拓; 出村拓
日本植物学会大会研究発表記録, 巻:75th, 2011年
J-Global ID:201102231679331797 - 植物細胞壁形成を司る遺伝子発現制御機構
山口雅利; 大谷美沙都; 中野仁美; 出村拓; 出村拓
日本植物学会大会研究発表記録, 巻:75th, 2011年
J-Global ID:201102236607613137 - 二次細胞壁形成の生化学的解析
山口雅利; 中野仁美; 武藤裕貴; 伊藤由希子; 深水祐一郎; 加藤晃; 石水毅; 出村拓; 出村拓
生化学, 2011年
ISSN:0037-1017, J-Global ID:201202226282928090 - 二次壁形成に関わるRING fingerタンパク質の局在と転写因子による発現制御
野田壮一郎; 鈴木史朗; 山口雅利; 服部武文; 西窪伸之; 出村拓; 梅澤俊明
第61回日本木材学会大会研究発表要旨集,p. 6,2011., 2011年 - 道管分化マスター因子の発現を制御する転写因子の探索とその解析
遠藤仁; 遠藤仁; 山口雅利; 中野仁美; 西窪伸之; 大谷美沙都; 片山義博; 出村拓; 出村拓
日本植物生理学会年会要旨集, 巻:51st, 2010年
J-Global ID:201002286014242795 - 転写因子を用いた道管分化誘導システム
山口雅利; 山口雅利; NADIA Goue; 五十嵐久子; 大谷美沙都; 大谷美沙都; 中野仁美; 中野仁美; MORTIMER Jennifer C; 西窪伸之; 久保稔; 片山義博; 掛川弘一; DUPREE Paul; 出村拓; 出村拓; 出村拓
日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 巻:28th, 2010年
J-Global ID:201102284406482470 - シロイヌナズナの二次壁形成に関与するRING fingerタンパク質の機能解析
野田壮一郎; 鈴木史朗; 西窪伸之; 山口雅利; 出村拓; 服部武文; 梅澤俊明
日本農芸化学会関西支部例会(第463回講演会),6, 2010年 - 木化初期に発現するRING fingerタンパク質の機能解析
野田壮一郎; 鈴木史朗; 西窪伸之; 山口雅利; 出村拓; 服部武文; 梅澤俊明
第60回日本木材学会大会研究発表要旨集,p. 148,2010., 2010年 - 機能未知遺伝子TED6・TED7は道管細胞壁形成の新規コンポーネントである
遠藤暁詩; 遠藤暁詩; 遠藤暁詩; PESQUET Edouard; 山口雅利; 田代玄; 佐藤繭子; 豊岡公徳; 西窪伸之; 本瀬真樹子; 久保稔; 福田裕穂; 福田裕穂; 出村拓
日本植物学会大会研究発表記録, 巻:73rd, 2009年
J-Global ID:200902280934707308 - 転写因子の活性化による効率的な道管要素分化誘導システムの開発
山口雅利; 五十嵐久子; 大谷美沙都; GOUE Nadia; 中野仁美; 中野仁美; 西窪伸之; 出村拓
日本植物生理学会年会要旨集, 巻:49th, 2008年
J-Global ID:200902256767883338 - FUNCTIONAL ANALYSIS OF NAC-DOMAIN PROTEINS THAT REGULATE XYLEM VESSEL DIFFERENTIATION
YAMAGUCHI Masatoshi; KUBO Minoru; FUKUDA Hiroo; DEMURA Taku
Journal of plant research, 巻:119, 開始ページ:164, 終了ページ:164, 2006年12月01日
英語
ISSN:0918-9440, CiNii Articles ID:10019309878, CiNii Books ID:AA10900218 - 高等植物における道管形成のマスター制御因子であるVND6とVND7
久保稔; 宇田川真理子; 西窪伸之; 堀口吾朗; 山口雅利; 井藤純; 三村徹郎; 福田裕穂; 出村拓
日本分子生物学会年会講演要旨集, 巻:28th, 開始ページ:718, 2005年11月25日
日本語
J-Global ID:200902242102699632 - Control of cell division and transcription by cyclin-dependent kinase-activating kinases in plants
M Umeda; A Shimotohno; M Yamaguchi
巻:46, 号:9, 開始ページ:1437, 終了ページ:1442, 2005年09月
英語, 書評論文,書評,文献紹介等
DOI:https://doi.org/10.1093/pcp/pci170
DOI ID:10.1093/pcp/pci170, ISSN:0032-0781, Web of Science ID:WOS:000232223100001 - Transcription switches for protoxylem and metaxylem vessel formation
M Kubo; M Udagawa; N Nishikubo; G Horiguchi; M Yamaguchi; J Ito; T Mimura; H Fukuda; T Demura
巻:19, 号:16, 開始ページ:1855, 終了ページ:1860, 2005年08月
英語
DOI:https://doi.org/10.1101/gad.1331305
DOI ID:10.1101/gad.1331305, ISSN:0890-9369, Web of Science ID:WOS:000231277600005 - Characterication of novel NAC-domain proteins interacting with VND7
M Yamaguchi; M Kubo; H Fukuda; T Demura
巻:46, 開始ページ:S196, 終了ページ:S196, 2005年
英語, 研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
ISSN:0032-0781, Web of Science ID:WOS:000228104101288 - Functional analyses of VND genes of Arabidopsis for vascular development
M Kubo; M Yamaguchi; H Fukuda; T Demura
巻:45, 開始ページ:S61, 終了ページ:S61, 2004年
英語, 研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
ISSN:0032-0781, Web of Science ID:WOS:000220592700240 - Cell cycle function of a rice B2-type cyclin interacting with a B-type cyclin-dependent kinase
J Lee; A Das; M Yamaguchi; J Hashimoto; N Tsutsumi; H Uchimiya; M Umeda
巻:34, 号:4, 開始ページ:417, 終了ページ:425, 2003年05月
英語
DOI:https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.2003.01736.x
DOI ID:10.1046/j.1365-313X.2003.01736.x, ISSN:0960-7412, Web of Science ID:WOS:000182785300003 - Differential phosphorylation activities of CDK-activating kinases in Arabidopsis thaliana
A Shimotohno; S Matsubayashi; M Yamaguchi; H Uchimiya; M Umeda
巻:534, 号:1-3, 開始ページ:69, 終了ページ:74, 2003年01月
英語
DOI:https://doi.org/10.1016/S0014-5793(02)03780-8
DOI ID:10.1016/S0014-5793(02)03780-8, ISSN:0014-5793, Web of Science ID:WOS:000180502100012 - Analysis of transgenic tobacco plants expressing rice CDK-activating kinase (CAK)
M Yamaguchi; S Yamamura; M Umeda; H Uchimiya
巻:43, 開始ページ:S213, 終了ページ:S213, 2002年
英語, 研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
ISSN:0032-0781, Web of Science ID:WOS:000174726400752 - Ara6, a plant-unique novel type Rab GTPase, functions in the endocytic pathway of Arabidopsis thaliana
T Ueda; M Yamaguchi; H Uchimiya; A Nakano
巻:20, 号:17, 開始ページ:4730, 終了ページ:4741, 2001年09月
英語
DOI:https://doi.org/10.1093/emboj/20.17.4730
DOI ID:10.1093/emboj/20.17.4730, ISSN:0261-4189, Web of Science ID:WOS:000170907900012 - ANALYSIS OF THE REGULATORY MECHANISM ON CDK-ACTVATING KINASE (CAK) :
YAMAGUCHI Masatoshi; YAMAMURA Saburo; UMEDA Masaaki; UCHIMIYA Hirofumi
Plant and cell physiology, 巻:42, 開始ページ:s46, 2001年
Japanese Society of Plant Physiologists, 英語
ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:110003715320, CiNii Books ID:AA0077511X - MECHANISM OF ENDOSOMAL LOCALIZATION AND GTPase CYCLE REGULATION OF Ara6,A NOVEL PLANT-SPECIFIC Rab/Ypt GTPase :
UEDA Takashi; YAMAGUCHI Masatoshi; UCHIMIYA Hirofumi; NAKANO Akihiko
Plant and cell physiology, 巻:42, 開始ページ:s219, 2001年
Japanese Society of Plant Physiologists, 英語
ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:110003715997, CiNii Books ID:AA0077511X - Molecular dissection of cell death in rice (共著)
巻:pp.365-376, 2001年 - CYCLIN H INTERACTS WITH AND ACTIVATES CDK-ACTIVATING KINASE IN RICE :
YAMAGUCHI Masatoshi; UMEDA Masaaki; UCHIMIYA Hirofumi
Plant and cell physiology, 巻:41, 開始ページ:s134, 2000年
Japanese Society of Plant Physiologists, 英語
ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:110003722413, CiNii Books ID:AA0077511X - Ara6,A NOVEL PLANT-SPECIFIC Rab/Ypt GTPase, RESIDES ON ENDOCYTIC MEMBRANES :
UEDA Takashi; YAMAGUCHI Masatoshi; UCHIMIYA Hirofumi; NAKANO Akihiko
Plant and cell physiology, 巻:41, 開始ページ:s31, 2000年
Japanese Society of Plant Physiologists, 英語
ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:110003722056, CiNii Books ID:AA0077511X - Molecular characterization of mitotic cyclins in rice plants
M Umeda; N Iwamoto; C Umeda-Hara; M Yamaguchi; J Hashimoto; H Uchimiya
巻:262, 号:2, 開始ページ:230, 終了ページ:238, 1999年09月
英語
DOI:https://doi.org/10.1007/s004380051079
DOI ID:10.1007/s004380051079, ISSN:0026-8925, CiNii Articles ID:30009502304, PubMed ID:10517318, Web of Science ID:WOS:000082852000004 - CHARACTERIZATION OF FACTORS INTERACTING WITH CDK-ACTIVATING KINASE OF RICE
YAMAGUCHI Masatoshi; UMEDA Masaaki; HASHIMOTO Junji; UCHIMIYA Hirofumi
Plant and cell physiology, 巻:40, 開始ページ:s162, 終了ページ:s162, 1999年03月
英語
ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:10003758381, CiNii Books ID:AA0077511X - Differential expression of genes for cyclin-dependent protein kinases in rice plants
M Umeda; C Umeda-Hara; M Yamaguchi; J Hashimoto; H Uchimiya
巻:119, 号:1, 開始ページ:31, 終了ページ:40, 1999年01月
英語
DOI:https://doi.org/10.1104/pp.119.1.31
DOI ID:10.1104/pp.119.1.31, ISSN:0032-0889, CiNii Articles ID:30019360023, PubMed ID:9880343, Web of Science ID:WOS:000078048300005 - イネのCDK活性化キナーゼの機能解析
山口 雅利; 梅田 正明; 橋本 純治; 内宮 博文
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 巻:21, 開始ページ:507, 終了ページ:507, 1998年12月01日
日本語
CiNii Articles ID:10002919420, CiNii Books ID:AN10468414 - FUNCTIONAL ANALYSIS OF RICE CYCLIN-DEPENDENT KINASES
YAMAGUCHI Masatoshi; UMEDA Masaaki; UMEDA-HARA Chikage; HASHIMOTO Junji; UCHIMIYA Hirofumi
Plant and cell physiology, 巻:39, 開始ページ:S53, 終了ページ:S53, 1998年05月
英語
ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:10003751680, CiNii Books ID:AA0077511X - DIFFERENTIAL EXPRESSION OF cdc2-RELATED GENES IN RICE
UMEDA Masaaki; UMEDA-HARA Chikage; YAMAGUCHI Masatoshi; HASHIMOTO Junji; UCHIMIYA Hirofumi
Plant and cell physiology, 巻:38, 開始ページ:s81, 1997年03月
英語
ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:10004345700, CiNii Books ID:AA0077511X - ANALYSIS OF AERENCHYMA FORMATION CAUSED BY CELL DEATH IN RICE ROOT
KAWAI Maki; SAMARAJEEWA P. K.; YAMAGUCHI Masatoshi; UCHIMIYA Hirofumi
Plant and cell physiology, 巻:37, 開始ページ:131, 終了ページ:131, 1996年03月
英語
ISSN:0032-0781, CiNii Articles ID:10002708306, CiNii Books ID:AA0077511X - RING fingerタンパク質ATL54の機能解析
野田壮一郎; 鈴木史朗; 山口雅利; 西窪伸之; 櫻井望; 服部武文; 鈴木秀幸; 出村拓; 柴田大輔; 梅澤俊明
第29回日本植物細胞分子生物学会(福岡)大会・シンポジウム講演要旨集、p. 96
- 二次細胞壁マスター因子の転写制御機構
向井陸馬; 清水悠裕; 藤澤りみり; 満山進; 坂本真吾; 光田展隆; 石川寿樹; 川合真紀; 山口雅利
第41回日本植物バイオテクノロジー学会(仙台)大会, 2024年09月
2024年08月 - 2024年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
共同研究・競争的資金等ID:48984418;48984419 - Master regulators of formation of secondary cell wall, main target of the woody biomass
Masatoshi Yamaguchi
Genomic Big Bang-Evolution, Biodiversity, and Sustainable Bio-inovation-, 2024年05月, [招待有り]
2024年05月 - 2024年05月, 英語, 口頭発表(招待・特別)
共同研究・競争的資金等ID:48984418;48984419
- 2025年 - 現在
バイオテクノロジー特論, 埼玉大学, 大学院専門科目 - 2025年 - 現在
生命化学, 埼玉大学, 学部専門科目 - 2016年 - 現在
生物学基礎, 埼玉大学, 学部専門科目 - 2016年 - 現在
生物代謝工学特論, 大学院専門科目 - 2018年 - 2021年
分子細胞学, 埼玉大学, 学部専門科目 - 2012年 - 2021年
生物代謝工学, 埼玉大学大学院, 大学院専門科目 - 2014年 - 2020年
バイオテクノロジー, 埼玉大学 - 2012年 - 2020年
環境共生学実験, 埼玉大学 - 2017年 - 2017年
生物学特講, 山形大学, 学部専門科目 - 2013年 - 2014年
生物学序説, 埼玉大学
■ 所属学協会
■ 共同研究・競争的資金等の研究課題
- 二次細胞壁を形成する道管要素と繊維細胞分化制御機構の解明
日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C), 2024年04月01日 - 2027年03月31日
山口 雅利, 埼玉大学
配分額(総額):4680000, 配分額(直接経費):3600000, 配分額(間接経費):1080000
課題番号:24K08823
講演・口頭発表等ID:50178821 - 機能性を高めるグルコマンナン高アセチル化の分子メカニズム
日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(B), 2023年04月01日 - 2027年03月31日
小竹 敬久; 山口 雅利, 埼玉大学
配分額(総額):18720000, 配分額(直接経費):14400000, 配分額(間接経費):4320000
課題番号:23K26827
講演・口頭発表等ID:50178821 - 超高感度光干渉法による多元的植物の環境汚染ストレス・活性の無侵襲極短時間モニタ法
日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(B), 2019年04月01日 - 2022年03月31日
門野 博史; 山口 雅利; ラジャゴパラン ウママヘスワリ; LIM YIHENG, 埼玉大学
配分額(総額):17420000, 配分額(直接経費):13400000, 配分額(間接経費):4020000
本研究の目的は,無侵襲・超高感度な光干渉法である統計干渉法(SIT)およびバイオスペックル光断層画像法(bOCT)に基づいて,植物の環境に対する極短時間の生理的・形態的応答を多元的に知ることにより,新しい植物の環境ストレスモニタリング技術を確立することである.本研究ではSITを用いて得られる新規な現象である植物成長の「自発的ナノメータゆらぎ」(NIF)の特性を利用する.加えて,新たに提案するbOCTを用いた植物内部の3次元的生理応答情報を統合して利用する.これらを総合して多角的に植物活性を無侵襲,迅速かつ高感度に評価することにより植物を用いた環境の毒性評価の確立を試みるものである。
本年度はbOCTおよびSIT統合システムの基礎設計および構築を試みた。新システム設計のための基礎データを取得するための基礎実験を中心におこなった。特にbOCTについては新に提案したバイオスペックルデータの植物活性状態をモニタするための有効性について検討した。環境汚染物質として重金属である亜鉛(Zn)と酸性鉱山排水(AMD)をlentilおよびradishの種子に対して暴露実験をおこなった。
Znの濃度は0.75から10mg/Lである。この濃度では微量栄養物質として植物に対して成長促進作用が知られている。これに対してbOCTにより得られる活性指標としてのバイオスペックルコントラストは10mg/L(Zn)に対して発芽以前の早期である僅か6時間後に2.5倍の増加を示した。
一方、人工AMD(FeSO4)(濃度150μmol/L, 298μmol)に対する暴露においても発芽前の早期において内部活性の増加が観測された。これは主としてAMD溶液の低pHによる効果と思われる。 このようにbOCTによる内部活性のモニタの有効性を確認した。
課題番号:19H04289 - 様々なNACドメイン転写因子と複合体を形成するVNI2の多面的な生物学的役割
文部科学省, 科学研究費補助金(基盤研究(C)), 基盤研究(C), 2018年04月 - 2021年03月
山口 雅利, 埼玉大学, 研究代表者
NACドメイン転写因子であるVNI2は、これまでにNACドメイン転写因子で道管形成の鍵因子であるVND7と相互作用する因子と同定されている。また、VNI2はVND7以外にも30ものNACドメイン転写因子と複合体を形成することを明らかにしており、本研究ではVNI2が複合体を形成する作用機構や生物学的意義を明らかにすることを目的として解析を行った。その結果、VNI2は葉の老化を制御する異なるNACドメイン転写因子と複合体を形成することで、多段階制御することを明らかにした。また、VNI2が相互作用因子の機能制御に重要なアミノ酸領域の特定にも成功した。
競争的資金, 課題番号:18K06277
論文ID:31422729 - カビ臭産出関連遺伝子の分析を用いた次世代型貯水池カビ臭対策技術の開発
文部科学省, 科学研究費補助金(挑戦的萌芽研究), 2015年04月 - 2018年03月
浅枝 隆
競争的資金 - 単一種のマングローブの植林による生態系と景観の改変の実態把握と改善法の開発
文部科学省, 科学研究費補助金(基盤研究(B)), 2015年04月 - 2018年03月
浅枝 隆
競争的資金 - NACドメイン転写因子へテロ複合体の生物学的役割
文部科学省, 科学研究費補助金(基盤研究(C)), 2015年04月 - 2018年03月
山口 雅利, 研究代表者
競争的資金
論文ID:31422729 - オミクス解析による細胞外情報処理空間構築の統合的理解
日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 新学術領域研究(研究領域提案型), 2012年06月28日 - 2017年03月31日
出村 拓; 倉田 哲也; 米田 新; 山口 雅利; 楢本 悟史, 奈良先端科学技術大学院大学
配分額(総額):111670000, 配分額(直接経費):85900000, 配分額(間接経費):25770000
道管分化のマスター転写因子VND7の下流で展開する二次細胞壁形成、および、プロトプラストからの細胞壁再生について、オミクス解析を行った。トランスクリプトーム/メタボローム解析により、二次細胞壁形成時に一次代謝経路の活性化が起こること、プロテオーム解析により、リグニン合成とペクチン分解に関連する酵素タンパク質の蓄積量が大きく変動すること、細胞壁再生過程のトランスクリプトーム解析からは、KOR2タンパク質の一次細胞壁再生への関与を示した。さらに、ヒメツリガネゴケのVND7遺伝子ホモログ(VNS遺伝子群)が、通水細胞ハイドロイドと支持細胞ステライドの細胞分化を制御することを示した。
課題番号:24114002 - 転写抑制因子を活用したリグノセルロース点含有植物の作出
科学技術振興機構, 戦略的創造研究推進事業さきがけ, 2011年12月 - 2015年03月
山口 雅利, 研究代表者
配分額(総額):52000000, 配分額(直接経費):40000000, 配分額(間接経費):12000000
競争的資金 - NAC転写因子複合体の作用機構と生物学的な役割
文部科学省, 科学研究費補助金(若手研究(B)), 若手研究(B), 2013年 - 2014年
山口 雅利, 埼玉大学, 研究代表者
配分額(総額):4420000, 配分額(直接経費):3400000, 配分額(間接経費):1020000
NAC転写因子ファミリーは、生物個体の成長や維持に重要な様々な制御に関わっていることが明らかになっている。本研究では、まずVNI1、および高い相同性を有するANAC103がVND7だけでなく様々なNAC転写因子と複合体を形成することを明らかにした。また、転写因子ライブラリーを用いてVNI2と相互作用する因子を探索したところ、30ものNAC転写因子が同定された。単離されたNAC転写因子には、これまで知られている二次細胞壁形成だけでなく、ストレス応答や、老化、さらに機能が解明されていないものが含まれており、NAC転写因子複合体が様々な制御機構において機能していることが強く示唆された。
競争的資金, 課題番号:25840098 - 二次細胞壁形成の統御システムの解明
日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(B), 2010年 - 2012年
出村 拓; 山口 雅利, 奈良先端科学技術大学院大学
配分額(総額):18980000, 配分額(直接経費):14600000, 配分額(間接経費):4380000
木質バイオマスを構成する二次細胞壁の形成メカニズムについては、不明な点が多々残されている。本研究では、二次細胞壁形成のマスタースイッチとして同定したVND7 遺伝子を利用して、高効率な二次細胞壁誘導系を確立し、これらを用いて、二次細胞壁の主要成分であるセルロースとキシランの生合成ならびにVND7 の機能制御機構の解析を行うことで、二次細胞壁形成を統御するシステムの新たな側面を明らかにした。
課題番号:22370020 - 道管分化マスター因子が制御する下流遺伝子発現機構の解析
文部科学省, 科学研究費補助金(若手研究(B)), 若手研究(B), 2008年 - 2009年
山口 雅利, 独立行政法人理化学研究所->奈良先端科学技術大学院大学, 研究代表者
配分額(総額):4420000, 配分額(直接経費):3400000, 配分額(間接経費):1020000
私は、道管分化機構を分子レベルで明らかにすることを目的に、道管分化マスター因子であるVND7についての機能解析を行った。まず、マクロアレイ解析によりVND7が制御する多数の下流遺伝子を明らかにし、それらの中からVND7が直接制御する候補遺伝子を見いだした。また、VND7はVNDタンパク質とダイマーを形成することが明らかとなった。さらに、VND7と相互作用する因子として、VNI2を同定し、VND7の転写活性を負に制御することが明らかとなった。
競争的資金, 課題番号:20770041 - 維管束メリステムからの細胞運命決定機構
日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 特定領域研究, 2008年 - 2008年
出村 拓; 山口 雅利; 西窪 伸之, 独立行政法人理化学研究所
配分額(総額):3000000, 配分額(直接経費):3000000
私たちはこれまでに単一のサブファミリーに属する一群のNAC転写因子(VNDl〜VND7がいずれも維管束細胞に発現し、特にVND6とVND7が道管分化を制御するマスター因子として機能することを明らかにした。本研究では、維管束メリステムからの細胞運命の決定機構を明らかする目的で、VNDファミリーの発現と機能の制御機構を詳細な解析を行っている。まず、VND7の機能解析として、転写活性化ドメインを欠失させたドミナントネガティブ体全体のあらゆる道管の分化を制御しうることが明らかとなった。そこで、VNDファミリー内の冗長性を確かめるために、多重変異体の作出を進めた。その結果、VND4/VND7二重T-DNA挿入変異体で根において顕著な道管分化の抑制が起こることが明らかとなった。また、VND7の機能を制御する新規因子を同定するために、酵母Two-hybridスクリーニングによる相互作用因子の探索を行い、新規のNAC転写因子VNI2を単離した。詳細な解析の結果、VNI2はVND7と結合し、VND7の転写活性を抑制することで、道管分化を負に制御することが明らかとなった。さらに、DEXに処理により植物型のVND7を用いた解析を行った。その結果、VND7が他のVNDファミリーと協調的に植物体全体で道管分化誘導が可能なVND7-VP16-GR発現シロイヌナズナを用いたサプレッサーのスクリーニングを行い、多数の変異体を得た。現在、導入遺伝子のインターナル変異やGRシステムヘの変異の有無について調査するとともに原因遺伝子の特定を進めている。一方、トランジェントアッセイ系により、上流でVND7の発現を制御する転写因子についても探索を行っており、現在までにVND4、VND5がVND7の発現を正に制御することを明らかにした。
課題番号:20061029 - 維管束分化を制御するタンパク質-タンパク質相互作用因子の探索と作用機構の解析
文部科学省, 科学研究費補助金(若手研究(B)), 若手研究(B), 2006年 - 2007年
山口 雅利, 独立行政法人理化学研究所, 研究代表者
配分額(総額):3700000, 配分額(直接経費):3700000
私たちの研究室では、木質バイオマスの質的および、量的な改変を目的として、植物の維管束、特に木質器官の分化制御機構について分子レベルで明らかにすることを試みている。特に本研究では、タンパク質-タンパク質相互作用機構に焦点を置きながら、新規制御機構の解明を試みてきた。私たちはこれまでに、植物に特有な転写因子であるNACドメインタンパク質をコードするVND7(Vascular related NAC domain protein7)が、過剰発現体などの解析より、道管細胞への分化を決定するマスター遺伝子であることを明らかにした。そこで、まずこのVND7について生化学的な手法などにより解析を行ったところ、VND7はVND1からVND6と二量体を形成することが明らかとなった。また、阻害剤を用いた発現解析により、VND7は積極的なタンパク質分解制御を受けていることが明らかとなった。さらに、VND7と相互作用する因子の探索を行ったところ、NACドメインタンパク質をコートするVNDIP2(VND7-Interacting Protein2)を同定した。このVNDIP2の発現は未成熟な道管細胞においてVND7の発現と重なっているものの、発現のピークはVND7よりも早いことが明らかとなった。また、一過的に遺伝子を導入する実験において、VNDIP2はVND7の転写活性を著しく阻害すること、さらにVN...
競争的資金, 課題番号:18770045 - 植物における細胞の分裂と分化を制御する分子機構の解析
文部科学省, 科学研究費補助金(若手研究(B)), 若手研究(B), 2004年 - 2005年
山口 雅利, 独立行政法人理化学研究所, 研究代表者
配分額(総額):3700000, 配分額(直接経費):3700000
分化全能性を有する植物は、様々な外的・内的なシグナルに対して、細胞分裂と分化とを柔軟に制御していることが知られている。私はこれまでに、その細胞の分裂と分化の方向性は、細胞周期の進行を制御するサイクリン依存性キナーゼ(CDKs)の活性レベルによって決定されていることを明らかにした。そこで、本研究では高頻度かつ同調的に脱分化そして道管を構成する管状要素細胞へと分化を誘導することが可能なヒャクニチソウ葉肉細胞培養系に着目し、誘導過程においてCDKsの発現や活性がどのような制御を受けているか解析を行っている。昨年度までに私は、細胞周期の進行の決定に重要なCDKA(ZeCDKA)を単離した。さらに、今年度は分裂期特異的に発現し植物にのみ存在するCDKBに属するZeCDKB1;1についても単離することに成功した。これらの機能を推測する目的で、出芽酵母cdc28変異株にこのZeCDKA、およびZeCDKB1;1を導入したところ、ZeCDKAはcdc28の温度感受性を相補することができたのに対し、ZeCDKB1;1はむしろ許容条件下においても生育を阻害することが明らかとなった。また興味深いことに、CDK活性化キナーゼ(CAK)によるリン酸化部位を置換したZeCDKAを導入した場合にも、相補活性はみられなかった。これまでの発現解析結果と併せることにより、ZeCDKAは葉肉細胞が脱分化能を獲得す...
競争的資金, 課題番号:16770047 - 植物細胞に特徴的な分裂期を制御する細胞周期関連因子に関する解析
日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 特別研究員奨励費, 2000年 - 2001年
山口 雅利, 東京大学
配分額(総額):2000000, 配分額(直接経費):2000000
課題番号:00J08639